CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp15A1-B : CodonNum = 287 & Codon = tcG

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp15A1-B287S287SS6739SsyntcAtcG117611380.96768720479-20481

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11381176All0.000218
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG299299AY.46.60.02159
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG255258B.1.1.70.000228
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG173173AY.1030.001074
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG5556AY.40.000086
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG5454AY.250.000325
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG4040AY.260.001132
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG2929B.1.258.170.003015
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG2526AY.440.000152
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG2121B.1.617.20.000079
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG1717B.1.1.2840.001826
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG1414AY.290.000221
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG1212AY.1130.001709
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG1010AY.470.000311
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG1010B.10.000092
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG1010B.1.20.000088
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG110B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG99AY.200.00035
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG99AY.230.000628
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG88AY.4.20.000174
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG67AY.1200.000223
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG56AY.30.00005
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG66B.1.1.1920.013857
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG44B.1.1.3060.001754
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG44B.1.4290.000094
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG23AY.1190.000071
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG33AY.430.000013
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG33AY.50.000062
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG13B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG33B.1.2320.001612
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG13P.10.000016
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG22AY.750.000112
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG22B0.000256
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG22B.1.221.30.001667
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG12P.1.140.000048
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AD.20.000219
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.330.000067
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.350.000233
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.390.000025
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.410.000294
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.420.00004
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.460.000104
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.840.000437
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.90.000068
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11AY.980.000079
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.1.2440.015385
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.1.570.011494
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.36.270.000763
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.36.350.002604
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11C.370.000116
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11C.40.01
ORF1ab/nsp15A1-B287S287StcAtcG11Q.80.000165