CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp15A1-B : CodonNum = 271 & Codon = atT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IM6723InonsynatGatT264814860.56117820431-20433

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT14862648All0.000284
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2660AP.10.003003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT481533B.1.1.70.000431
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT188228AY.40.000293
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT131131AY.4.50.014081
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT5096B.1.617.20.000188
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT8181AY.620.035294
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2768AY.430.00012
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT5268B.1.20.000458
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT162B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT4957AY.1030.000304
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT149B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT4747P.1.150.01092
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2541AY.470.000778
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT3737B.1.1.4320.046835
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1133B.10.000101
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2129AY.250.000126
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2424A.2.5.10.115385
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2123AY.98.10.001017
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1821AY.30.000179
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2020B.1.1600.000624
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1119AY.440.000067
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1415AY.1020.000371
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1214P.10.000189
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT813B.1.10.000145
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT710B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1010B.1.3690.002852
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT79AY.390.000173
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT38AY.50.000062
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT68AY.9.20.00022
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT88Q.80.001319
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT66AY.4.10.004425
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT66B.1.177.360.096774
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT16B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT15AY.290.000016
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT15AY.370.000316
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44AY.200.000155
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44B.1.258.70.007648
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT24B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44B.1.3560.006908
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT13AY.1000.000046
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT23AY.230.000139
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT23AY.260.000057
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT13AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33AY.610.000314
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT23B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT23B.1.360.000292
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33B.1.36.80.003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33B.1.617.10.000387
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33B.1.6320.020134
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33Q.10.000379
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT12AY.1170.000085
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22B.1.1.2440.030769
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT12B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22B.1.3990.003868
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22N.90.011905
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT110.055556
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.450.000122
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.570.000656
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.640.000595
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.1010.01
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.2170.003636
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.4820.023256
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.980.018519
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1420.002899
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.160.80.001289
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.177.410.0025
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.3360.002439
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.4080.00369
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.390.002331
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11N.50.001767
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11P.1.140.000048