CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp15A1-B : CodonNum = 271 & Codon = aCg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TM6723TnonsynaTgaCg2682650.98880620431-20433

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg265268All0.000051
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg9292B.1.1.70.000082
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg2626AY.3.10.002217
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg2121AY.40.000033
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg1616B.1.1.2140.000887
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg1313B.1.10.000236
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg99P.10.000142
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg88AY.430.000035
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg77AY.420.000282
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg66B.10.000055
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg55C.350.00387
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg44AY.470.000124
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg44B.1.5680.004444
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg120.055556
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.250.000012
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.440.000012
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.610.00021
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22C.360.001821
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.200.000039
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.240.000431
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.260.000028
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.370.000316
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.60.000041
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.1.2530.002506
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.564.10.001577
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11N.50.001767
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11R.10.00009