CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp15A1-B : CodonNum = 271

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IM6723InonsynatGatT264814860.56117820431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IM6723InonsynatGatA264811400.43051420431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IM6723InonsynatGatC2648220.0083081620431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VM6723VnonsynAtgGtg2802780.99285720431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VM6723VnonsynAtGGtC28010.0035714320431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VM6723VnonsynAtGGtA28010.0035714320431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TM6723TnonsynaTgaCg2682650.98880620431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TM6723TnonsynaTGaCA26820.0074626920431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TM6723TnonsynaTGaCT26810.0037313420431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KM6723KnonsynaTgaAg124124120431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delM6723deldelATG---4040120431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LM6723LnonsynAtgTtg31250.80645220431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LM6723LnonsynAtgCtg3130.096774220431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LM6723LnonsynAtGTtA3120.064516120431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LM6723LnonsynAtGCtT3110.032258120431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271RM6723RnonsynaTgaGg77120431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271FM6723FnonsynAtGTtT210.520431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271FM6723FnonsynAtGTtC210.520431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271del1M6723del1delAtg-tg210.520431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271del1M6723del1delaTga-g210.520431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271NM6723NnonsynaTGaAT11120431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271del2M6723del2delaTGa--11120431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271AM6723AnonsynATgGCg11120431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271WM6723WnonsynATgTGg11120431-20433
ORF1ab/nsp15A1-B271M271GM6723GnonsynATGGGT11120431-20433

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT14862648All0.000284
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11402648All0.000218
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatC222648All0.000004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA658660AP.10.987988
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2660AP.10.003003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT481533B.1.1.70.000431
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA47533B.1.1.70.000042
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatC5533B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg278280All0.000053
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtGGtA1280All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtGGtC1280All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg265268All0.000051
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTGaCA2268All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTGaCT1268All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT188228AY.40.000293
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA40228AY.40.000062
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT131131AY.4.50.014081
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg124124All0.000024
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg108108AY.40.000168
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT5096B.1.617.20.000188
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA4696B.1.617.20.000173
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg9292B.1.1.70.000082
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT8181AY.620.035294
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg7272AY.40.000112
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA4168AY.430.000182
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2768AY.430.00012
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT5268B.1.20.000458
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatC1268B.1.20.000106
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA468B.1.20.000035
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA6162B.1.5750.018507
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT162B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT4957AY.1030.000304
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA857AY.1030.00005
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA4849B.1.1.2220.009792
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT149B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT4747P.1.150.01092
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2541AY.470.000778
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA1641AY.470.000498
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---4040All0.000008
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT3737B.1.1.4320.046835
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA2133B.10.000192
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1133B.10.000101
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatC133B.10.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg3232B.10.000293
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg2531All0.000005
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgCtg331All0.000001
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtGTtA231All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtGCtT131All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA3131AY.360.004595
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2129AY.250.000126
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA829AY.250.000048
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg2626AY.3.10.002217
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2424A.2.5.10.115385
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2123AY.98.10.001017
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA223AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1821AY.30.000179
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA321AY.30.00003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg2121AY.40.000033
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT2020B.1.1600.000624
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1119AY.440.000067
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA719AY.440.000043
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatC119AY.440.000006
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg1717B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg1616AY.290.000252
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg1616B.1.1.2140.000887
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1415AY.1020.000371
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA115AY.1020.000027
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA1515AY.4.20.000325
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg1414B.1.617.20.000053
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1214P.10.000189
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA214P.10.000032
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg1313B.1.10.000236
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT813B.1.10.000145
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA413B.1.10.000073
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatC113B.1.10.000018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg1010B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT710B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA310B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT1010B.1.3690.002852
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg99AY.1030.000056
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg99AY.250.000054
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT79AY.390.000173
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA29AY.390.000049
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg99P.10.000142
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg88AY.430.000035
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA58AY.50.000103
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT38AY.50.000062
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT68AY.9.20.00022
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA28AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg88B.1.36.380.013136
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT88Q.80.001319
ORF1ab/nsp15A1-B271M271RaTgaGg77All0.000001
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg77AY.1190.000247
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg77AY.420.000282
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg77B.1.20.000062
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg77P.10.00011
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---660.333333
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg66AY.1030.000037
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT66AY.4.10.004425
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg66B.10.000055
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT66B.1.177.360.096774
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA56B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT16B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg55AE.80.002445
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA45AY.290.000063
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT15AY.290.000016
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA45AY.370.001264
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT15AY.370.000316
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg55B.1.258.60.098039
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg55C.350.00387
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44AY.200.000155
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg44AY.470.000124
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---44AY.590.002119
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44B.1.258.70.007648
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA24B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT24B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT44B.1.3560.006908
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg44B.1.5680.004444
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA44B.1.6370.000292
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA44D.20.0003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA23AY.1000.000092
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT13AY.1000.000046
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg33AY.200.000117
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT23AY.230.000139
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA13AY.230.00007
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT23AY.260.000057
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA13AY.260.000028
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg33AY.390.000074
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA33AY.39.10.000119
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA23AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT13AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33AY.610.000314
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg23B.10.000018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtGTtA13B.10.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg23B.1.10.000036
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtGGtC13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtGTtA13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtGGtA13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA33B.1.1.4360.076923
ORF1ab/nsp15A1-B271M271RaTgaGg33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT23B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA13B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT23B.1.360.000292
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA13B.1.360.000146
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33B.1.36.80.003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg33B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33B.1.617.10.000387
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33B.1.6320.020134
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA33P.20.00056
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT33Q.10.000379
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg120.055556
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTGaCT120.055556
ORF1ab/nsp15A1-B271M271del1Atg-tg12All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271del1aTga-g12All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271FAtGTtT12All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271FAtGTtC12All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg22AY.1070.000932
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA12AY.1170.000085
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT12AY.1170.000085
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.250.000012
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg22AY.260.000057
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg22AY.360.000296
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---22AY.430.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.440.000012
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg22AY.440.000012
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22AY.610.00021
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg22AY.980.000158
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA22AY.980.000158
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22B.1.1.2440.030769
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT12B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA12B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA22B.1.1.580.010753
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22B.1.3990.003868
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgCtg12B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtGCtT12B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---22B.1.5170.000854
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg22B.1.5760.001813
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp15A1-B271M271RaTgaGg22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgCtg12B.6.60.000889
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg12B.6.60.000889
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg22C.360.001821
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT22N.90.011905
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg22P.10.000032
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT110.055556
ORF1ab/nsp15A1-B271M271NaTGaAT110.055556
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg110.055556
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg110.055556
ORF1ab/nsp15A1-B271M271del1Atg-tg11A.20.000662
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp15A1-B271M271NaTGaAT11All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271WATgTGg11All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271AATgGCg11All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271del2aTGa--11All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271GATGGGT11All0
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.200.000039
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.240.000431
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg11AY.250.000006
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.260.000028
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11AY.260.000028
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.360.000148
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.370.000316
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.370.000316
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11AY.40.000002
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11AY.420.00004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg11AY.430.000004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.430.000004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11AY.440.000006
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.450.000122
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11AY.470.000031
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.50.000021
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp15A1-B271M271RaTgaGg11AY.540.000095
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.570.000656
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.60.000041
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11AY.60.000041
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11AY.600.000938
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.640.000595
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11AY.710.000475
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11AY.750.000056
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.850.000427
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11AY.910.00073
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B0.000128
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11B.10.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271GATGGGT11B.10.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271FAtGTtT11B.10.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11B.10.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271FAtGTtC11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.1010.01
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.2170.003636
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.1.2530.002506
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.4820.023256
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTGaCA11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp15A1-B271M271WATgTGg11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp15A1-B271M271del2aTGa--11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1.980.018519
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11B.1.1420.002899
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.1420.002899
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgTtg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.160.80.001289
ORF1ab/nsp15A1-B271M271RaTgaGg11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.177.410.0025
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11B.1.177.680.015152
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271del1aTga-g11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.1.221.20.004016
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11B.1.2730.012987
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11B.1.3200.001245
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.3360.002439
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTGaCA11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.4080.00369
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp15A1-B271M271AATgGCg11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatC11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11B.1.564.10.001577
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp15A1-B271M271KaTgaAg11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp15A1-B271M271delATG---11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.1.6320.006711
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.390.002331
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11B.390.002331
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.400.000364
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11B.60.00091
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11C.1.20.004255
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11C.370.000116
ORF1ab/nsp15A1-B271M271LAtgCtg11D.20.000075
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11N.50.001767
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11N.50.001767
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatT11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatA11Q.70.001111
ORF1ab/nsp15A1-B271M271TaTgaCg11R.10.00009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271VAtgGtg11R.10.00009
ORF1ab/nsp15A1-B271M271IatGatC11W.40.001351