CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp15A1-B : CodonNum = 19 & Codon = cGg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RQ6471RnonsyncAgcGg370370119675-19677

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg370370All0.000071
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg6666B.1.1.70.000059
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg4343AY.250.000259
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg4040AY.9.10.003349
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg3434AE.80.016626
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg2626B.1.2430.001809
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg1111AY.98.10.000533
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg99AY.1030.000056
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg99AY.40.000014
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg99AY.430.00004
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg88AD.10.032922
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg77B.1.20.000062
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg55AY.39.20.007704
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg55B.1.2340.00066
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg44AY.440.000024
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg33AY.200.000117
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg33AY.260.000085
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg33AY.540.000286
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg33B.10.000027
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg33B.1.2100.006397
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg33B.60.00273
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg22AY.320.001065
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg22AY.50.000041
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg22P.10.000032
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.130.000161
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.270.000065
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.370.000316
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.480.000465
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.610.000105
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11AY.850.000427
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.1.4130.006897
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.4260.001009
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp15A1-B19Q19RcAgcGg11Q.80.000165