CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | G6581V | nonsyn | gGt | gTt | 2431 | 2431 | 1 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | G6581S | nonsyn | Ggt | Agt | 283 | 283 | 1 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | G6581G | syn | ggT | ggC | 194 | 181 | 0.93299 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | G6581G | syn | ggT | ggG | 194 | 9 | 0.0463918 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | G6581G | syn | ggT | ggA | 194 | 4 | 0.0206186 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | G6581D | nonsyn | gGt | gAt | 166 | 163 | 0.981928 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | G6581D | nonsyn | gGT | gAC | 166 | 3 | 0.0180723 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | G6581del | del | GGT | --- | 147 | 147 | 1 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | G6581C | nonsyn | Ggt | Tgt | 98 | 98 | 1 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | G6581A | nonsyn | gGt | gCt | 18 | 17 | 0.944444 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | G6581A | nonsyn | gGT | gCA | 18 | 1 | 0.0555556 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | G6581del1 | del | Ggt | -gt | 7 | 3 | 0.428571 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | G6581del1 | del | ggT | gg- | 7 | 2 | 0.285714 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | G6581del1 | del | GGT | -NN | 7 | 1 | 0.142857 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | G6581del1 | del | GgT | -gN | 7 | 1 | 0.142857 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129R | G6581R | nonsyn | Ggt | Cgt | 5 | 4 | 0.8 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129R | G6581R | nonsyn | GgT | AgA | 5 | 1 | 0.2 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129N | G6581N | nonsyn | GGt | AAt | 3 | 3 | 1 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del2 | G6581del2 | del | GGT | --N | 1 | 1 | 1 | 20005-20007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129H | G6581H | nonsyn | GGT | CAC | 1 | 1 | 1 | 20005-20007 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2431 | 2431 | All | 0.000465 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 596 | 596 | AY.25 | 0.003585 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 504 | 504 | AY.4 | 0.000784 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 283 | 283 | All | 0.000054 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 227 | 227 | B.1.1.7 | 0.000203 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 197 | 197 | B.1.617.2 | 0.000742 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 181 | 194 | All | 0.000035 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggG | 9 | 194 | All | 0.000002 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggA | 4 | 194 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 163 | 166 | All | 0.000031 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGT | gAC | 3 | 166 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 147 | 147 | All | 0.000028 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 112 | 112 | AY.103 | 0.000695 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 98 | 98 | All | 0.000019 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 98 | 98 | AY.29 | 0.001546 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 98 | 98 | AY.43 | 0.000434 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 64 | 64 | AY.105 | 0.041158 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 59 | 59 | B.1.332 | 0.206294 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 54 | 54 | B.1.243 | 0.003758 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 50 | 50 | AY.3 | 0.000497 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 48 | 48 | B.1.177 | 0.000632 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 46 | 46 | AY.25 | 0.000277 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 44 | 44 | B.1.1.7 | 0.000039 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 42 | 42 | AY.102 | 0.001114 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 40 | 40 | B.1.1 | 0.000726 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 29 | 30 | AY.43 | 0.000128 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggG | 1 | 30 | AY.43 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 30 | 30 | B.1.160 | 0.000936 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 30 | 30 | B.1.2 | 0.000264 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 29 | 29 | AY.4 | 0.000045 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 25 | 25 | B.1.2 | 0.00022 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 22 | 22 | B.1.1.7 | 0.00002 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 19 | 22 | B.1.1.7 | 0.000017 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggG | 2 | 22 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggA | 1 | 22 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 19 | 19 | B.1.575 | 0.005765 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 17 | 18 | All | 0.000003 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGT | gCA | 1 | 18 | All | 0 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 18 | 18 | AY.3.1 | 0.001535 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 18 | 18 | AY.4 | 0.000028 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 18 | 18 | AY.44 | 0.00011 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 18 | 18 | B.1 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 18 | 18 | B.1.1.145 | 0.666667 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 18 | 18 | B.1.1.7 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 16 | 16 | B.1.2 | 0.000141 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 16 | 16 | P.1 | 0.000252 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 15 | 15 | B.1 | 0.000137 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 15 | 15 | B.1.1.420 | 0.015091 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 13 | 13 | AY.100 | 0.000598 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 13 | 13 | AY.4.2 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 13 | 13 | AY.99.2 | 0.001198 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 13 | 13 | B.1.617.2 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 11 | 11 | AY.39 | 0.000272 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 9 | 9 | AY.4 | 0.000014 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 9 | 9 | AY.5 | 0.000186 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 9 | 9 | B.1.177 | 0.000119 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 8 | 8 | AY.113 | 0.001139 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 8 | 8 | AY.43 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 8 | 8 | B.1.36.28 | 0.045977 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | Ggt | -gt | 3 | 7 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | ggT | gg- | 2 | 7 | All | 0 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | GgT | -gN | 1 | 7 | All | 0 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | GGT | -NN | 1 | 7 | All | 0 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 7 | 7 | AY.20 | 0.000272 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 7 | 7 | AY.26 | 0.000198 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 7 | 7 | AY.4 | 0.000011 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 7 | 7 | AY.47 | 0.000218 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 7 | 7 | B.1.617.2 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 6 | 6 | A.3 | 0.012579 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 6 | 6 | AY.20 | 0.000233 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 6 | 6 | AY.4.2.1 | 0.000894 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 6 | 6 | AY.9 | 0.000406 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 6 | 6 | B.1.1.322 | 0.052632 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 6 | 6 | B.1.1.519 | 0.000238 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 6 | 6 | B.1.351 | 0.000178 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129R | Ggt | Cgt | 4 | 5 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129R | GgT | AgA | 1 | 5 | All | 0 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 5 | 5 | AY.121 | 0.000677 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 5 | 5 | AY.39.1 | 0.000198 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 5 | 5 | AY.43 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 5 | 5 | AY.46.2 | 0.003177 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 5 | 5 | B.1 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | B.1 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 5 | 5 | B.1.36 | 0.00073 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 5 | 5 | B.1.526 | 0.000118 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 5 | 5 | B.1.526 | 0.000118 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 5 | 5 | P.1.14 | 0.000239 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 4 | 4 | 0.222222 | |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 4 | 4 | AY.23.1 | 0.001669 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 3 | 4 | AY.4 | 0.000005 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGT | gCA | 1 | 4 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 4 | 4 | AY.42 | 0.000161 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 4 | 4 | AY.43 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 4 | 4 | AY.44 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 4 | 4 | AY.69 | 0.000747 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 4 | 4 | AY.98 | 0.000316 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 4 | 4 | B.1.1 | 0.000073 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 4 | 4 | B.1.1.377 | 0.005525 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 4 | 4 | B.1.1.486 | 0.006309 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | B.1.1.7 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 4 | 4 | B.1.429 | 0.000094 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 4 | 4 | B.1.617.2 | 0.000015 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 4 | 4 | P.1 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 3 | 3 | A.2.5.3 | 0.030928 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | A.29 | 0.015957 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129N | GGt | AAt | 3 | 3 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 3 | 3 | AY.103 | 0.000019 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.117 | 0.000254 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.118 | 0.000188 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.121 | 0.000406 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.23 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 3 | 3 | AY.25 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 3 | 3 | AY.29 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 3 | 3 | AY.3 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.43 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.46 | 0.000312 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 3 | 3 | AY.5 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 3 | 3 | AY.5 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.54 | 0.000286 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.6 | 0.000123 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.61 | 0.000314 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.64 | 0.001786 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | B | 0.000383 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggG | 2 | 3 | B.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 3 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGT | gAC | 2 | 3 | B.1.1 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 3 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.1.25 | 0.001706 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.1.28 | 0.000934 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.1.434 | 0.001046 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129N | GGt | AAt | 3 | 3 | B.1.1.7 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.2 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 3 | 3 | B.1.2 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.351 | 0.000089 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.526 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.595 | 0.000783 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 3 | 3 | B.1.596 | 0.000261 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.617.2 | 0.000011 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.620 | 0.002838 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 3 | 3 | B.1.621.1 | 0.001517 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 3 | 3 | D.2 | 0.000225 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 3 | 3 | P.1 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 3 | 3 | P.1.14 | 0.000143 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 3 | 3 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 2 | 2 | AY.100 | 0.000092 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.102 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 2 | 2 | AY.103 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.103 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.114 | 0.000462 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.119 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.120 | 0.000074 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 2 | 2 | AY.120 | 0.000074 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.13 | 0.000322 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.14 | 0.000176 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.20 | 0.000078 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggG | 1 | 2 | AY.3 | 0.00001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 2 | AY.3 | 0.00001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.33 | 0.000134 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.39 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.44 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 2 | 2 | AY.44 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.45 | 0.000243 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 2 | 2 | AY.46.6 | 0.000144 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129R | Ggt | Cgt | 2 | 2 | AY.47 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.52 | 0.001629 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.57 | 0.001312 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.75.1 | 0.000361 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.78 | 0.003082 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.9.2 | 0.000073 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 2 | 2 | B.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | Ggt | -gt | 1 | 2 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | ggT | gg- | 1 | 2 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.1 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.1.141 | 0.004024 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.1.214 | 0.000111 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.1.214 | 0.000111 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.1.263 | 0.003115 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.1.294 | 0.002532 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.1.317 | 0.000823 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.1.467 | 0.038462 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.1.63 | 0.000772 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.258 | 0.000133 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 2 | 2 | B.1.351 | 0.000059 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.351 | 0.000059 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.36 | 0.000292 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 2 | 2 | B.1.36 | 0.000292 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.36.19 | 0.018519 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.36.29 | 0.001035 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.36.8 | 0.002 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.429 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggG | 1 | 2 | B.1.497 | 0.000315 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggA | 1 | 2 | B.1.497 | 0.000315 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.509 | 0.001732 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.575 | 0.000607 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.582 | 0.000981 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.6 | 0.00182 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.6.6 | 0.001778 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | D.2 | 0.00015 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 2 | 2 | P.1 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 2 | 2 | P.1.17 | 0.000324 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | A | 0.000387 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | A.1 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | A.29 | 0.005319 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AE.8 | 0.000489 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129H | GGT | CAC | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del2 | GGT | --N | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AT.1 | 0.005128 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.104 | 0.001984 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.107 | 0.000466 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.108 | 0.001103 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.120.1 | 0.000321 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.13 | 0.000161 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.16.1 | 0.00047 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggG | 1 | 1 | AY.22 | 0.002092 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.24 | 0.000431 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | AY.29 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.3 | 0.00001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.32 | 0.000532 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.34 | 0.000097 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.34 | 0.000097 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.34.1 | 0.00051 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.35 | 0.000233 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.4.1 | 0.000737 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.4.1 | 0.000737 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.4.4 | 0.000409 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.45 | 0.000122 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.46.4 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.46.4 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.47 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.5.3 | 0.000337 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.5.4 | 0.000277 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.55 | 0.000917 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.55 | 0.000917 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.58 | 0.000907 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.6 | 0.000041 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.64 | 0.000595 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.70 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.73 | 0.000665 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.74 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.84 | 0.000437 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | AZ.2 | 0.000821 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del2 | GGT | --N | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggG | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129R | GgT | AgA | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.10 | 0.001115 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.135 | 0.004695 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.139 | 0.022727 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.157 | 0.000913 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.174 | 0.003378 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.207 | 0.001182 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.1.222 | 0.000204 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.222 | 0.000204 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.244 | 0.015385 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.254 | 0.011236 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.284 | 0.000107 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.298 | 0.000862 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.350 | 0.04 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.37 | 0.000193 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.375 | 0.011905 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.393 | 0.111111 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.46 | 0.004367 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggA | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129H | GGT | CAC | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | GgT | -gN | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.110 | 0.004525 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.157 | 0.002985 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.177.4 | 0.000211 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.177.56 | 0.000668 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.177.57 | 0.000281 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.177.79 | 0.002342 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.177.80 | 0.001912 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.179 | 0.003759 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.189 | 0.004292 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.199 | 0.004132 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.210 | 0.002132 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.221.1 | 0.002907 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.234 | 0.000132 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.311 | 0.000275 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.332 | 0.003497 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.340 | 0.004292 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.36.17 | 0.000494 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.36.8 | 0.001 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.361 | 0.001289 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.409 | 0.000781 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.409 | 0.000781 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.416.1 | 0.001563 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | GGT | -NN | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.432 | 0.011236 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.438.1 | 0.000107 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.453 | 0.003236 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.456 | 0.003268 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGT | gAC | 1 | 1 | B.1.497 | 0.000315 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.515 | 0.014493 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.517 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.517 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.524 | 0.001406 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.555 | 0.022222 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.577 | 0.000687 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.609 | 0.000479 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.619.1 | 0.000641 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.620 | 0.000946 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129G | ggT | ggA | 1 | 1 | B.1.628 | 0.000352 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.637 | 0.000073 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.29 | 0.003509 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.40 | 0.000364 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.55 | 0.00295 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.6 | 0.00091 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.6.6 | 0.000889 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.60 | 0.015873 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | C.1 | 0.002392 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | C.1.2 | 0.004255 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | C.40 | 0.027778 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | P.1.15 | 0.000232 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129D | gGt | gAt | 1 | 1 | P.1.7 | 0.000319 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | Q.3 | 0.000145 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del | GGT | --- | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129V | gGt | gTt | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129S | Ggt | Agt | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
ORF1ab/nsp15A1-B | 129 | G129del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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