CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : Mut = Y260C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CY6185CnonsyntAttGt510510118817-18819

Details of the mutation Y260C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt510510All0.000098
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt8787B.1.1.70.000078
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt7878B.10.000714
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt7474AY.40.000115
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt4848AY.1030.000298
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt3737B.1.1681
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt2222B.1.1600.000686
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt1313P.10.000205
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt1212AY.30.000119
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt1212AY.430.000053
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt1212B.1.1.5190.000477
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt1010B.1.4270.000505
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt88AY.39.10.000317
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt88C.370.000929
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt77B.1.20.000062
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt66B.1.2210.000426
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt55AY.98.10.000242
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt44B.1.4290.000094
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt33AY.260.000085
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt33AY.440.000018
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt33AY.50.000062
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt33B.1.1.1570.00274
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt33Q.80.000495
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22AY.330.000134
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22AY.450.000243
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22AY.610.00021
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22B.1.1.2070.002364
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt22C.90.060606
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11A.290.005319
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.550.000917
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.2220.001692
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.6120.002653
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp14A2-B260Y260CtAttGt11C.36.30.000567