CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : Mut = R289C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CR6214CnonsynCgtTgt351351118904-18906

Details of the mutation R289C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt351351All0.000067
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt9090B.1.1511
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt4343B.1.1.70.000038
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt3434AY.1030.000211
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt2424AY.40.000037
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt1717B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt1313AY.4.20.000282
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt1313B.10.000119
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt1212AY.1190.000424
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt1010AY.30.000099
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt1010AY.390.000247
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt99B.1.177.170.007389
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt55AY.470.000156
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt33AY.440.000018
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt33B.1.2370.014925
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt33B.1.3750.002459
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt22AY.200.000078
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt22B.1.1.470.010695
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt22B.1.258.140.001961
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt22D.20.00015
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt22P.10.000032
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt110.055556
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.410.000294
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.1.270.00565
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11C.350.000774
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11C.360.000911
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp14A2-B289R289CCgtTgt11P.1.140.000048