CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : Mut = M501T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TM6426TnonsynaTgaCg113811320.99472819540-19542
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TM6426TnonsynaTGaCA113840.0035149419540-19542
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TM6426TnonsynaTGaCT113820.0017574719540-19542

Details of the mutation M501T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11321138All0.000217
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTGaCA41138All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTGaCT21138All0
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg400400AY.1140.092443
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg204204AY.40.000318
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg100100AY.330.006678
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg8688B.1.1.70.000077
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTGaCA288B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg4848AY.440.000292
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg4446B.1.617.20.000166
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTGaCA146B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTGaCT146B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg3536AY.1190.001236
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTGaCA136AY.1190.000035
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg2525AY.430.000111
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg1414AY.320.007455
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg1414B.1.20.000123
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg1112AY.1030.000068
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTGaCT112AY.1030.000006
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg1111B.10.000101
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg1111B.1.1770.000145
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg1111B.1.177.90.014647
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg99AY.1020.000239
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg88B.1.2340.001056
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg55AY.250.00003
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg55AY.30.00005
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg55AY.5.30.001687
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg44AY.460.000416
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg44AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg33AY.120.2.10.001495
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg33AY.4.30.002525
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg33AY.420.000121
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg33B.1.177.400.015464
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg33P.1.110.030612
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22AY.200.000078
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22AY.470.000062
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22AY.60.000082
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22AY.750.000112
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22AY.980.000158
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22B.1.3130.013158
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22B.1.80.003945
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22P.50.027397
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg22Q.10.000253
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.360.000148
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.410.000294
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.50.000021
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.530.000288
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11B.1.177.380.010417
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11P.10.000016
ORF1ab/nsp14A2-B501M501TaTgaCg11P.1.30.034483