CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : Mut = L495L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LL6420LsynctCctT87477871700.9964919522-19524
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LL6420LsynctCctA874772680.0030636619522-19524
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LL6420LsynctCctG87477390.00044583119522-19524

Details of the mutation L495L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT8717087477All0.016672
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA26887477All0.000051
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctG3987477All0.000007
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2117721302B.1.1.70.018958
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA9321302B.1.1.70.000083
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctG3221302B.1.1.70.000029
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1672916730B.1.617.20.062992
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA116730B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1463214632AY.98.10.70864
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT87238730AY.40.013577
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA78730AY.40.000011
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT82178217AY.980.649103
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT26502650AY.680.725431
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT20112013B.1.3510.05978
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA22013B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT18741874B.1.2210.133115
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT977977B.6.60.868444
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT942942B.1.5650.763371
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT709709B.1.177.80.533484
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT515516B.1.20.004535
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA1516B.1.20.000009
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT508509AY.430.002251
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA1509AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT374378B.1.10.006785
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA4378B.1.10.000073
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT288290AY.250.001732
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA2290AY.250.000012
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT263266AY.440.001601
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA3266AY.440.000018
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT258260P.10.004065
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctG2260P.10.000032
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT246252B.10.002253
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA3252B.10.000027
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctG3252B.10.000027
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT246246AY.260.006964
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT241241C.36.11
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT208208Q.80.034301
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT194194AY.4.50.020853
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT171184AY.1030.001062
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA13184AY.1030.000081
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT168168AY.650.089552
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT168168B.1.258.110.066587
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT149150B.1.4290.003506
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA1150B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT130144B.1.1770.001712
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA14144B.1.1770.000184
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT129129B.1.1.3690.057564
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT122122B.1.6320.818792
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT105105B.60.095541
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT104104AY.360.015414
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99103AY.1020.002625
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA4103AY.1020.000106
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA9296AY.740.01064
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT496AY.740.000463
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT9090B.1.1600.002807
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT8181B.1.2430.005636
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7878B.1.5960.006797
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7777B.1.5260.00181
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7777B.1.6370.005627
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7676Q.10.009601
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7575N.90.446429
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7474AY.1200.002751
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7373AY.30.000726
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7272B.1.5510.092903
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7272B.1.617.10.009286
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT7171B.1.110.30.051006
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT6768AY.60.002756
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA168AY.60.000041
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT6767R.10.006031
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT6666B.1.177.70.01088
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT6363AY.370.019912
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT6363AY.4.2.10.009386
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT5757AY.46.40.009377
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT5656B.1.36.80.056
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT4646AY.1080.050717
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT4646B.1.466.20.017997
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT4545AY.5.30.015182
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT4343AY.270.002783
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT4141AY.290.000647
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT4040B.1.351.50.023981
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3939AY.50.000805
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3839C.370.00441
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA139C.370.000116
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3737AY.140.003256
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3434AY.39.10.001347
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3434B.1.2580.002263
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3333AY.4.20.000716
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3333B.1.1.250.018761
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3232AY.460.003331
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3131AY.200.001205
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3131AY.230.002162
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT3131AY.390.000766
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2930AY.420.001167
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctG130AY.420.00004
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2929B.1.1.10.009474
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2929B.1.6210.002567
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2929C.36.30.016449
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2828AY.1160.00803
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2828B.1.3690.007986
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2727B.1.258.170.002807
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2626AY.600.02439
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2626B.1.5250.002942
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2525AY.90.00169
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2525S.10.123762
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2324AY.1000.001058
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctG124AY.1000.000046
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2424AY.1060.008038
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2424AY.470.000747
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2424B.1.3990.046422
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2324P.1.100.006198
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA124P.1.100.000269
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2424P.1.140.001147
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2323AY.1170.001944
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2323B.1.1.5190.000913
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2222B.6.41
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2121B.1.1.2220.004284
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT2121B.1.4270.00106
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1819AY.3.10.001535
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA119AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1919B.1.1.700.00648
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1919B.1.2010.107955
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1919B.1.2340.002507
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA1719B.1.36.360.010235
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT219B.1.36.360.001204
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1718B.1.360.00248
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA118B.1.360.000146
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1717B.1.4080.062731
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1717B.1.4090.013281
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1717B.1.5640.00724
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1616AY.5.40.004427
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1616B.1.5750.004854
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1616P.20.002986
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1515AY.1190.00053
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1515AY.99.20.001382
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1515B.1.1.1890.022693
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1515B.1.1.280.004669
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1515B.1.3670.011886
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1414AY.1140.003235
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1414AY.450.001704
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1414AY.9.20.000514
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1414B.1.1110.016451
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1414B.1.4690.050542
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1113AY.1130.001566
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA213AY.1130.000285
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1313B.1.177.430.019202
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1212AY.1110.002198
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1212B.1.1.2040.036474
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1212B.1.1.2690.016238
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1212B.1.1.630.00463
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1111AY.116.10.003426
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1111AY.1210.001488
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1111AY.29.10.002426
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1111AY.750.000616
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1111B.1.1.1471
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1111B.1.1.3040.030899
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1111B.1.1.4060.071429
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1111B.1.6270.022222
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1111P.1.150.002556
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT910B.1.1.1980.013216
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctA110B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1010B.1.214.20.005995
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1010B.1.5610.00397
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT1010B.1.5820.004907
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99AY.330.000601
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99AY.340.000873
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99AY.350.002097
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99AY.610.000943
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99B.1.1.2140.000499
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99B.1.1460.038136
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99B.1.177.560.006008
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99B.1.177.790.021077
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT99B.1.575.10.021951
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT88AY.46.50.001587
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT88AY.540.000763
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT88AY.840.0035
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT88B0.001022
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT88P.1.120.003872
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT77A.10.001973
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT77AY.1180.000439
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT77AY.160.002658
ORF1ab/nsp14A2-B495L495LctCctT77AY.320.003727
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