CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : Mut = I15T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TI5940TnonsynaTcaCc236023580.99915318082-18084
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TI5940TnonsynaTCaCG236020.00084745818082-18084

Details of the mutation I15T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc23582360All0.000451
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTCaCG22360All0
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc651651B.1.177.430.961595
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc303303B.1.20.002668
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc299299AY.250.001798
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc184184AY.40.000286
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc103103B.1.10.001869
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc7373B.1.617.20.000275
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc7272AE.80.035208
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc5050B.1.1.70.000045
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc4646AY.1030.000286
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc4242B.10.000385
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc3636AY.440.000219
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc3030B.1.2340.003958
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc2626AY.840.011374
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc2424AY.470.000747
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc2323AY.290.000363
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc2223AY.430.000097
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTCaCG123AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc1919AY.46.40.003126
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc1919B.1.177.750.019771
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc1818B.1.1600.000561
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc1717B.1.1.4640.025037
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc1616B.1.1770.000211
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc1616B.1.2430.001113
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc1414B.1.1.2140.000776
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc1010B.1.177.310.114943
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc88B.1.177.830.011852
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc77AY.160.002658
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc77AY.50.000145
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc77B.1.1.5190.000278
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc66AY.200.000233
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc66B0.000767
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc66B.1.160.320.025751
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc66B.1.177.440.003114
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc55AY.260.000142
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc55AY.420.000201
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc55B.1.416.10.007812
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc55B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc44AY.30.00004
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc44B.1.1.3060.001754
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc44B.1.1.700.001364
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc44B.1.5240.005626
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc33B.1.1.390.001529
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc33B.1.4000.001287
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc33B.1.617.10.000387
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc33D.20.000225
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22AY.270.000129
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22AY.390.000049
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22AY.450.000243
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22AY.460.000208
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22AY.540.000191
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22AY.610.00021
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22AY.710.00095
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.160.100.016129
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.177.520.003515
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.258.110.000793
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.5230.004902
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.5380.016129
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.5410.00885
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11A.210.00277
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.100.00053
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.120.000316
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.130.000161
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.140.000088
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.180.010101
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.190.00114
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.230.00007
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.240.000431
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.320.000532
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.330.000067
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.510.000909
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.550.000917
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.590.00053
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.60.000041
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.630.000387
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTCaCG11AY.670.000464
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.750.000056
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.990.001049
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.2540.011236
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.2740.005051
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.3710.010417
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.4190.007407
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1.4860.001577
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.2220.001692
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.3320.003497
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.36.350.002604
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.4250.002994
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.4730.019231
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11B.1.6010.030303
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11C.370.000116
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11Q.80.000165
ORF1ab/nsp14A2-B15I15TaTcaCc11Z.10.00289