CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : Mut = H455Y

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YH6380YnonsynCatTat300630040.99933519402-19404
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YH6380YnonsynCaTTaC300620.00066533619402-19404

Details of the mutation H455Y within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat30043006All0.000575
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCaTTaC23006All0
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat592592AY.40.000921
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat208208B.1.617.20.000783
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat174174B.1.1.70.000156
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat156156AY.1030.000969
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat154154B.1.438.10.016518
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat114114B.1.4290.002682
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat109109AY.440.000663
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat9090AY.4.2.10.013409
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat8989AY.250.000535
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat8484B.1.20.00074
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat6464B.10.000586
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat6060B.1.5610.023819
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat5555B.1.1.2430.22449
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat5353AY.430.000235
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat4848AY.1200.001785
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat4444AY.30.000438
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat4444B.1.10.000798
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat3535AY.1000.00161
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2626AY.390.000642
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2626B.1.1.370.005014
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2525B.1.1390.018328
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2525B.1.5960.002178
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2424AY.1020.000636
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2424AY.4.20.000521
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2424B.1.1.620.648649
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2222AY.50.000454
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2222P.10.000347
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat2121B.1.1770.000277
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1818AY.290.000284
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1818B.1.6370.001315
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1616AY.740.00185
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1616B.1.36.80.016
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1313AY.9.20.000477
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1313B.1.1.2140.000721
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1313P.1.100.003503
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1313P.20.002426
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1212B.1.1.4640.017673
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1212B.1.214.20.007194
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1111AY.260.000311
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1010A.2.50.00499
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1010AY.1180.000626
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1010AY.470.000311
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1010B.1.1600.000312
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat1010B.1.2980.021142
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat99AY.330.000601
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat88AY.200.000311
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat88B.1.5260.000188
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat88P.1.10.002541
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat77AY.140.000616
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat77B.1.2790.003595
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat77B.1.360.001021
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat77B.1.6210.00062
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat66AY.1060.002009
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat66AY.370.001896
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55AA.70.045872
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55AY.270.000324
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55AY.280.009452
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55AY.3.10.000426
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55AY.610.000524
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55AZ.10.004337
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55B.1.351.20.001513
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55B.1.617.10.000645
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat55P.1.70.001596
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44AY.120.10.001284
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44AY.230.000279
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44AY.420.000161
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44AY.450.000487
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44AY.750.000224
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44AY.98.10.000194
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44B.1.1.3480.003185
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44B.1.2340.000528
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44B.1.3960.002823
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44B.1.5750.001214
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat44R.10.00036
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33AY.100.00159
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33AY.1210.000406
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33AY.20.001068
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33AY.5.30.001012
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33AY.540.000286
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33AY.60.000123
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33AY.70.000588
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.1.390.001529
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.1.630.001157
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.110.30.002155
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.177.450.001144
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33B.1.6190.002613
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33C.370.000348
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat33Q.80.000495
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCaTTaC220.111111
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.1040.003968
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.120.2.10.000997
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.240.000862
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.29.10.000441
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.360.000296
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.380.000999
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.4.30.001684
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.400.001929
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.460.000208
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.520.001629
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.700.000417
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.920.000575
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.980.000158
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22AZ.20.001642
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.1.1410.004024
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.177.120.000303
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.177.150.001262
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.220.002635
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.30.005236
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.36.170.000988
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.4090.001563
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.416.10.003125
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.1.6270.00404
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22B.40.004415
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22D.20.00015
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat22P.1.160.000748
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11A.210.00277
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11A.270.001656
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AT.10.005128
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.120.000316
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.160.00038
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.300.000396
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.340.000097
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.410.000294
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.560.001605
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.590.00053
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.630.000387
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.660.00107
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.680.000274
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.710.000475
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.770.001127
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.790.001211
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.840.000437
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.90.000068
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11AY.910.00073
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.2630.001558
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.2790.001121
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.3630.005988
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.5070.008696
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.160.330.004425
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.221.30.000833
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.3400.004292
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.36.210.00216
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.4060.006061
ORF1ab/nsp14A2-B455H455YCatTat11B.1.4110.003704
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