CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : Mut = E204D

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DE6129DnonsyngaGgaT1423880720.56693418649-18651
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DE6129DnonsyngaGgaC1423861660.43306618649-18651

Details of the mutation E204D within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT807214238All0.001544
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC616614238All0.001179
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC60586058AY.740.70059
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT29412946B.1.1.70.002633
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC52946B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT824826AY.40.001282
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC2826AY.40.000003
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT416416B.1.2790.213662
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT404404B.1.177.210.030894
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT396396A.23.10.278873
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT263278B.1.617.20.00099
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC15278B.1.617.20.000056
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT175175AY.430.000775
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT169169AY.1030.001049
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT141142AY.470.004386
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC1142AY.470.000031
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT133133AY.330.008881
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT119119B.1.20.001048
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT113113B.1.5410.5
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT100100B.1.1770.001317
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT9698AY.440.000584
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC298AY.440.000012
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT9293AY.250.000553
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC193AY.250.000006
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT8484B.1.3690.023959
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT7879B.10.000714
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC179B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT7474AY.4.50.007954
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT7171AY.50.001466
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT6970B.1.10.001252
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC170B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT6969B.1.243.21
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT6565P.10.001024
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT6363B.1.3510.001873
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT5050AY.980.00395
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC3749AY.210.070209
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1249AY.210.02277
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT4747B.1.1.5190.001866
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT4242AY.30.000418
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT4040B.1.5990.145985
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT3737AY.390.000914
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT3737B.1.1.1890.055976
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT3737B.1.1.4320.046835
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT3737B.1.3110.010159
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT3131AY.4.20.000672
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT2727AY.1020.000716
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT2425AY.540.002288
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC125AY.540.000095
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT2525B.1.5250.002829
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT2121AY.290.000331
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1919B.1.1600.000593
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1919B.1.2580.001264
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC1317AY.450.001582
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT417AY.450.000487
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1717B.1.1.2980.014655
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1616AY.420.000644
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1616B.1.6370.001169
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1214B.1.4270.000606
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC214B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1414Q.10.001769
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1313AY.4.40.005319
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1313AY.46.60.000939
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1313B.1.1.3690.005801
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1313B.1.36.80.013
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1212C.36.30.006807
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1111AY.460.001145
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1111B.1.2210.000781
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1111P.1.140.000526
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1010B.1.1.2220.00204
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT1010B.1.1.500.006789
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT99AY.230.000628
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT89AY.350.001864
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC19AY.350.000233
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT99AZ.20.007389
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT78AY.1130.000997
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC18AY.1130.000142
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC68AY.5.30.002024
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT28AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT88B.1.2430.000557
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT88B.1.36.290.004139
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT78D.20.000525
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC18D.20.000075
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT88P.20.001493
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT77AY.360.001037
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT77AY.400.00675
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT77AY.9.20.000257
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT77B.1.1.280.002179
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT77B.1.1.700.002387
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT77B.1.360.001021
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT77B.1.4220.005686
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT66AY.260.00017
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT56AY.610.000524
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC16AY.610.000105
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT66AY.840.002625
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT66B.1.1.3480.004777
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT66B.1.36.390.013304
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT66B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT35AY.1190.000106
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC25AY.1190.000071
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT55AY.200.000194
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT55B.1.160.160.004647
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT55B.1.177.510.022831
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT55B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT55C.160.005302
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT55Q.80.000825
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT44AY.7.20.002237
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT44AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT44B.1.258.170.000416
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT44B.1.4290.000094
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT44B.1.5950.001044
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33AY.10.001187
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33AY.120.10.000963
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT23AY.130.000322
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC13AY.130.000161
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC33AY.240.001293
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33AY.3.10.000256
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33AY.39.10.000119
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33AY.4.2.10.000447
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT23AY.550.001835
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC13AY.550.000917
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT23AY.620.000871
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC13AY.620.000436
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT23AY.750.000112
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC13AY.750.000056
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33B0.000383
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC23B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT13B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33B.1.1.4120.022901
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33B.1.177.160.001993
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33B.1.2010.017045
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33B.1.214.20.001799
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33B.1.4000.001287
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33B.1.5750.00091
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT33P.1.170.000485
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22AD.20.000438
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC12AY.1060.000335
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT12AY.1060.000335
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22AY.270.000129
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC22AY.670.000929
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22AY.870.001665
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.1.1570.001826
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.1.2880.003831
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.1.390.001019
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.1.4090.005666
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.1.5280.009615
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.1570.00597
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.177.570.000562
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.2320.001075
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.258.60.039216
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.36.180.00084
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.4690.00722
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.4870.039216
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.5050.008772
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.5210.00995
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.1.5640.000852
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22B.3.10.003317
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22C.360.001821
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22C.370.000232
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22L.30.007092
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT22R.10.00018
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AL.10.012987
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AT.10.005128
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.160.00038
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.280.00189
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.370.000316
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.410.000294
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaT11AY.5.10.003759
ORF1ab/nsp14A2-B204E204DgaGgaC11AY.530.000288
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