CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : Mut = C208S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsyntGttCt7043740.5312518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsynTgtAgt7043250.46164818661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsynTgTAgC70420.0028409118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsyntGTtCC70410.0014204518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsyntGTtCG70410.0014204518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsyntGTtCA70410.0014204518661-18663

Details of the mutation C208S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt374704All0.000072
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt325704All0.000062
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgTAgC2704All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCG1704All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCA1704All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCC1704All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt358358B.1.1.3030.98895
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt258258AY.60.010611
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt2626B.1.1.280.008092
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt813B.10.000073
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt313B.10.000027
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgTAgC113B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCA113B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt410B.1.10.000073
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt310B.1.10.000054
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCG110B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCC110B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgTAgC110B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt99AY.50.000186
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt22P.10.000032
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11AY.580.000907
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11AY.990.001049
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt11B.1.1.1170.009709
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11B.1.1.3780.007299
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt11D.20.000075