CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : CodonNum = 494

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HY6419HnonsynTatCat243824350.99876919519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HY6419HnonsynTaTCaC243830.0012305219519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YY6419YsyntaTtaC15361536119519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delY6419deldelTAT---737737119519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CY6419CnonsyntAttGt68640.94117619519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CY6419CnonsyntATtGC6840.058823519519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494WY6419WnonsyntATtGG6464119519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494DY6419DnonsynTatGat1515119519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494FY6419FnonsyntAttTt15130.86666719519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494FY6419FnonsyntATtTC1520.13333319519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494XY6419XnonsyntaTtaA1180.72727319519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494XY6419XnonsyntaTtaG1130.27272719519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494SY6419SnonsyntAttCt1090.919519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494SY6419SnonsynTAtAGt1010.119519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494NY6419NnonsynTatAat650.83333319519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1Y6419del1delTat-at620.33333319519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1Y6419del1delTaTGa-610.16666719519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1Y6419del1delTaT-aC610.16666719519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494NY6419NnonsynTaTAaC610.16666719519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1Y6419del1delTATCG-610.16666719519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1Y6419del1delTAt-Gt610.16666719519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del2Y6419del2delTAt--t430.7519519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del2Y6419del2delTAT--N410.2519519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494LY6419LnonsyntATtTA33119519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494VY6419VnonsynTAtGTt210.519519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494VY6419VnonsynTATGTA210.519519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494AY6419AnonsynTATGCC210.519519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494RY6419RnonsynTAtCGt210.519519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494AY6419AnonsynTATGCA210.519519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494RY6419RnonsynTATCGC210.519519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494TY6419TnonsynTATACA11119519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494EY6419EnonsynTaTGaA11119519-19521
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494QY6419QnonsynTaTCaG11119519-19521

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat24352438All0.000466
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTaTCaC32438All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat16181618AY.670.751161
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC15361536All0.000294
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC10001000B.1.1.70.000895
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---737737All0.000141
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat429429AY.440.002611
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat170171B.1.617.20.00064
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTaTCaC1171B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---162162AY.430.000718
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC8484B.1.1.4160.076018
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---7575B.1.20.00066
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtAttGt6468All0.000012
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtATtGC468All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC6767AY.39.10.002654
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494WtATtGG6464All0.000012
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC6464AY.46.40.010528
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC5353AY.40.000082
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---4545B.1.617.20.000169
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---4444B.1.1.70.000039
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat4242B.1.1.4310.677419
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---3232B.10.000293
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---2727AY.250.000162
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC2525AY.1020.000663
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat2323AY.40.000036
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494WtATtGG2323B.1.617.20.000087
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat2222B.1.1.5190.000874
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---2020AY.34.10.010199
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---2020AY.440.000122
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC1919AY.290.0003
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC1919B.1.617.20.000072
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtAttGt1818AY.40.000028
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---1616AY.30.000159
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494DTatGat1515All0.000003
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494FtAttTt1315All0.000002
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494FtATtTC215All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC1414B.10.000128
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC1414B.1.20.000123
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC1313B.1.177.180.015081
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---1313B.1.5260.000306
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat1212AY.620.005229
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---1212B.1.10.000218
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---1212B.1.3510.000357
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494XtaTtaA811All0.000002
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494XtaTtaG311All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---1111AY.1030.000068
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC1111AY.1030.000068
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---1111AY.390.000272
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---1111AY.9.20.000404
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC1111P.10.000173
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494StAttCt910All0.000002
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494STAtAGt110All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC99AY.1200.000335
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC99AY.430.00004
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat99AY.430.00004
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---99AY.750.000504
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494WtATtGG99B.10.000082
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC99B.1.1.4040.142857
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---88AY.520.006515
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---88AY.98.10.000387
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---88B.1.5960.000697
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtAttGt78B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtATtGC18B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494DTatGat77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC77AY.30.00007
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---77AY.40.000011
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat77AY.690.001307
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---77B.1.4290.000165
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494NTatAat56All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1Tat-at26All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1TAt-Gt16All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1TaTGa-16All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1TATCG-16All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del1TaT-aC16All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494NTaTAaC16All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---66AY.1180.000376
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat66AY.290.000095
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtAttGt66AY.30.00006
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC66AY.4.2.10.000894
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---66AY.420.000241
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC66AY.440.000037
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC66B.1.10.000109
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC66B.1.1.1900.3
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat66B.1.5610.002382
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---55AY.1100.000563
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---55AY.230.000349
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat55AY.30.00005
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat55AY.740.000578
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---55B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del2TAt--t34All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494del2TAT--N14All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---44AY.110.005355
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtAttGt44AY.200.000155
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtAttGt44AY.440.000024
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC44AY.470.000124
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC44AY.60.000165
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat44AY.610.000419
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---44AY.650.002132
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC44B.1.177.600.000874
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---44B.1.360.000584
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494FtATtTC230.111111
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494FtAttTt130.055556
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494LtATtTA33All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat33AY.1100.000338
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat33AY.190.003421
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---33AY.330.0002
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC33AY.420.000121
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC33AY.450.000365
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC33AY.460.000312
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC33AY.50.000062
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494WtATtGG33AY.650.001599
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtAttGt33B.1.1.10.00098
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC33B.1.1.1690.054545
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---33B.1.1.2180.023077
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC33B.1.1.2430.012245
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---33B.1.1.4160.002715
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat33B.1.1.4860.004732
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494WtATtGG33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494XtaTtaA23B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494XtaTtaG13B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---33B.1.2650.003812
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat33B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC33B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTaTCaC220.111111
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtATtGC220.111111
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---220.111111
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494VTAtGTt120.055556
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494VTATGTA120.055556
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC22A.20.001324
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494VTAtGTt12All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494RTAtCGt12All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494ATATGCA12All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494RTATCGC12All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494ATATGCC12All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494VTATGTA12All0
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---22AY.1070.000932
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494YtaTtaC22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat22AY.120.20.002571
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat22AY.240.000862
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494CtAttGt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494HTatCat22AY.250.000012
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494WtATtGG22AY.400.001929
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494StAttCt22AY.430.000009
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494WtATtGG22AY.430.000009
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494DTatGat22AY.430.000009
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494XtaTtaA12AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494XtaTtaG12AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494WtATtGG22AY.440.000012
ORF1ab/nsp14A2-B494Y494delTAT---22AY.46.60.000144
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