CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : CodonNum = 49

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IM5974InonsynatGatT749572950.97331618184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IM5974InonsynatGatA74951460.019479718184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IM5974InonsynatGatC7495540.007204818184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VM5974VnonsynAtgGtg2722690.98897118184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VM5974VnonsynAtGGtT27220.0073529418184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VM5974VnonsynAtGGtC27210.0036764718184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TM5974TnonsynaTgaCg209209118184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LM5974LnonsynAtgTtg78490.62820518184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LM5974LnonsynAtgCtg78290.37179518184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delM5974deldelATG---2424118184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49KM5974KnonsynaTgaAg22118184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49del1M5974del1delaTGaC-22118184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49NM5974NnonsynaTGaAT11118184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49del2M5974del2delATg--g11118184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49FM5974FnonsynAtGTtT11118184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49GM5974GnonsynATgGGg11118184-18186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49RM5974RnonsynaTgaGg11118184-18186

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT72957495All0.001395
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA1467495All0.000028
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC547495All0.00001
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT29462979B.1.1.70.002637
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC202979B.1.1.70.000018
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA132979B.1.1.70.000012
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT947947B.1.177.820.452029
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT905905B.1.258.140.887255
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg269272All0.000051
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtGGtT2272All0
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtGGtC1272All0
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT237237B.1.177.750.246618
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg209209All0.00004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT200205B.1.617.20.000753
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA5205B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT138153B.1.1770.001817
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC14153B.1.1770.000184
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA1153B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT133145AY.40.000207
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA8145AY.40.000012
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC4145AY.40.000006
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT143143B.1.1.390.072885
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT9090AY.600.084428
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT8486AY.440.000511
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC186AY.440.000006
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA186AY.440.000006
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT5681AY.430.000248
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA2581AY.430.000111
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg4978All0.000009
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg2978All0.000006
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT6977B.10.000632
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC477B.10.000037
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA477B.10.000037
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg6969B.1.6280.024313
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT6262B.1.3570.590476
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT5659B.1.10.001016
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC259B.1.10.000036
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA159B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg5151B.1.1.70.000046
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT5050B.1.177.830.074074
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT4949B.1.2580.003261
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT4343A.2.50.021457
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT4142AY.390.001013
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA142AY.390.000025
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg4242B.1.1.3650.234637
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT4041P.10.00063
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA141P.10.000016
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT3439AY.30.000338
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA339AY.30.00003
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC239AY.30.00002
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg3636B.10.00033
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT3535AY.1020.000928
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT3035AY.1030.000186
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA535AY.1030.000031
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT3435B.1.4290.0008
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA135B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT2433B.1.20.000211
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA833B.1.20.00007
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC133B.1.20.000009
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT2831AY.250.000168
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA231AY.250.000012
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC131AY.250.000006
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT3030B.1.1.2220.00612
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT2929AY.330.001937
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg2828AY.1030.000174
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg2727AY.430.00012
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT2526AY.260.000708
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA126AY.260.000028
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT2426B.1.4270.001212
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA226B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT2525B.1.3060.142857
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---2424All0.000005
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg2424AY.1050.015434
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA2424AY.830.041379
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT2323AY.1200.000855
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT2222B.1.1.970.647059
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT2020AY.50.000413
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg1919AY.290.0003
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg1919B.1.1.2040.057751
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1919B.1.1.2770.014416
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1718AY.9.10.001423
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA118AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1818B.1.5650.014587
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA1717B.1.1.500.011541
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1616AY.340.001551
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg1515AY.40.000023
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1515B.1.177.70.002473
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1313AY.610.001362
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1313B.1.1600.000405
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg1212AY.250.000072
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1212AY.290.000189
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1212AY.60.000494
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg1212B.1.20.000106
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1112B.1.3510.000327
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC112B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1111AY.200.000428
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg1111AY.7.10.00124
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg1010AY.34.10.005099
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg1010AY.40.000016
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1010AY.420.000402
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT1010B.1.1.5190.000397
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT89AY.190.009122
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC19AY.190.00114
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT99AY.630.003482
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg99B.1.1600.000281
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT99B.1.6210.000797
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg88AY.30.00008
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT88AY.5.30.002699
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---88B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT88B.1.1490.027397
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT88B.1.177.210.000612
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT88B.1.5250.000905
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT47AY.1190.000141
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA37AY.1190.000106
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT77AY.270.000453
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT77AY.360.001037
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT67AY.540.000572
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA17AY.540.000095
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT67AY.980.000474
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA17AY.980.000079
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT67B.1.1.3060.00263
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA17B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg77B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT66A.2.5.30.061856
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg66AY.1030.000037
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg36AY.40.000005
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg36AY.40.000005
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg56AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg16AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT66AY.75.10.001082
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg66B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg46B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg26B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT66B.1.177.440.003114
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA66C.140.025974
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT66N.20.230769
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT350.166667
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA250.111111
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55AY.1140.001156
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55AY.1180.000313
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55AY.120.2.10.002491
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55AY.410.00147
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg55AY.440.00003
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55AY.460.00052
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55AY.730.003327
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55B.1.1.280.001556
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55B.1.1.3120.00956
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55B.1.1.330.002104
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55B.1.1.4170.013514
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT55B.1.1.5160.333333
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg240.111111
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtGGtT240.111111
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg44AY.250.000024
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT34AY.470.000093
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA14AY.470.000031
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44B.1.177.860.000734
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44B.1.360.000584
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44B.1.5090.003463
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44N.80.125
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44P.1.100.001078
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44P.1.150.000929
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT44P.20.000747
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT33AY.1060.001005
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg33AY.130.000483
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT33AY.130.000483
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg33AY.360.000445
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg33AY.440.000018
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT33AY.450.000365
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT23AY.920.000575
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA13AY.920.000287
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatC33B.1.1.2890.00625
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT33B.1.1.3740.007126
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg33B.1.177.100.002634
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT33B.1.2400.000647
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT33B.1.3670.002377
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT33B.1.5640.001278
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT23B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA13B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp14A2-B49M49KaTgaAg22All0
ORF1ab/nsp14A2-B49M49del1aTGaC-22All0
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.100.00106
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT12AY.1000.000046
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA12AY.1000.000046
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---22AY.250.000012
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg22AY.260.000057
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg12AY.30.00001
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg12AY.30.00001
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.320.001065
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.380.000999
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg12AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtGGtC12AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg22AY.440.000012
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg22AY.450.000243
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.520.001629
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.650.001066
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.680.000547
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.750.000112
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.80.001212
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.870.001665
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT12AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA12AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg22B.1.1.3810.08
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.1.460.008734
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.1.5230.003125
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.177.400.010309
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.214.20.001199
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.2180.010309
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA12B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT12B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.2370.00995
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.3420.2
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.3610.002577
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.3630.025974
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.4220.001625
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.4330.00639
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.4480.005249
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.4740.003802
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.5880.00182
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.6270.00404
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22B.1.88.10.009615
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22C.230.011628
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg22C.36.30.001134
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22L.30.007092
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22P.1.70.000639
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp14A2-B49M49KaTgaAg110.055556
ORF1ab/nsp14A2-B49M49NaTGaAT110.055556
ORF1ab/nsp14A2-B49M49del1aTGaC-11A0.000387
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11A.10.000282
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11A.50.001923
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp14A2-B49M49NaTGaAT11All0
ORF1ab/nsp14A2-B49M49del2ATg--g11All0
ORF1ab/nsp14A2-B49M49FAtGTtT11All0
ORF1ab/nsp14A2-B49M49GATgGGg11All0
ORF1ab/nsp14A2-B49M49RaTgaGg11All0
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.10.000396
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.110.001339
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.120.000316
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.160.00038
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.200.000039
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11AY.250.000006
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.260.000028
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.300.000396
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg11AY.320.000532
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg11AY.330.000067
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.340.000097
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11AY.360.000148
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11AY.40.000002
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.400.000964
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.500.000799
ORF1ab/nsp14A2-B49M49RaTgaGg11AY.540.000095
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.560.001605
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.750.000056
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11AY.770.001127
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.800.001129
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.850.000427
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11AY.910.00073
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.91.10.004065
ORF1ab/nsp14A2-B49M49del2ATg--g11AY.920.000287
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.930.000273
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.960.002075
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11AZ.10.000867
ORF1ab/nsp14A2-B49M49del1aTGaC-11B0.000128
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B49M49GATgGGg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B49M49KaTgaAg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.1910.004762
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.2190.005
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1510.011111
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.1580.02381
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgCtg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.160.170.001701
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11B.1.177.680.015152
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.2470.014925
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.2670.018519
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.2810.021739
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.2940.032258
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.370.014706
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.3850.010638
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.4030.003268
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.429.10.012048
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.5040.03125
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp14A2-B49M49FAtGTtT11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.5430.01
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.5480.035714
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11B.1.5890.007576
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.5910.010638
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.6310.003367
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.6360.006711
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatA11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.1.6380.052632
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11B.470.020408
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11C.10.002392
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11C.160.00106
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11C.260.007353
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11C.370.000116
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11D.20.000075
ORF1ab/nsp14A2-B49M49LAtgTtg11D.20.000075
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11N.10.016949
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11N.50.001767
ORF1ab/nsp14A2-B49M49delATG---11P.10.000016
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11P.10.000016
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp14A2-B49M49TaTgaCg11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11P.1.90.004808
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11P.30.001595
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11Q.20.000613
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11Q.30.000145
ORF1ab/nsp14A2-B49M49IatGatT11Q.40.000455
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11Q.80.000165
ORF1ab/nsp14A2-B49M49VAtgGtg11R.10.00009