CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : CodonNum = 394

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VA6319VnonsyngCtgTt242302124229770.99998219219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VA6319VnonsyngCTgTC2423021440.000018159119219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IA6319InonsynGCtATt619619119219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FA6319FnonsynGCtTTt2942920.99319719219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FA6319FnonsynGCTTTC29420.0068027219219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SA6319SnonsynGctTct2302290.99565219219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SA6319SnonsynGcTTcC23010.0043478319219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AA6319AsyngcTgcC88790.89772719219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AA6319AsyngcTgcA8870.079545519219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AA6319AsyngcTgcG8820.022727319219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TA6319TnonsynGctAct4141119219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delA6319deldelGCT---2929119219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394DA6319DnonsyngCtgAt77119219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394PA6319PnonsynGctCct650.83333319219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394PA6319PnonsynGcTCcG610.16666719219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del1A6319del1delgCtg-t430.7519219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del1A6319del1delgcTgc-410.2519219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del2A6319del2delGCt--t320.66666719219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del2A6319del2delgCTg--310.33333319219-19221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394GA6319GnonsyngCtgGt11119219-19221

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt24229772423021All0.463423
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC442423021All0.000008
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt642131642136AY.40.999427
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC5642136AY.40.000008
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt224720224724B.1.617.20.846164
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC4224724B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt220638220644AY.430.977529
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC6220644AY.430.000027
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt165558165563AY.250.995802
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC5165563AY.250.00003
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt162310162316AY.440.987942
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC6162316AY.440.000037
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt160162160165AY.1030.994455
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC3160165AY.1030.000019
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt100208100211AY.30.996708
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC3100211AY.30.00003
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt6335063350AY.290.999259
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt4834048341AY.50.998183
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC148341AY.50.000021
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt4609446095AY.4.20.999718
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC146095AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt3988339884AY.390.985568
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC139884AY.390.000025
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt3748637488AY.1020.993902
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC237488AY.1020.000053
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2823628236AY.1190.996963
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2687626877AY.1200.999219
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC126877AY.1200.000037
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2558025581AY.200.99417
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC125581AY.200.000039
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2513325133AY.39.10.995603
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2462224622AY.420.990546
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2429224292AY.60.999095
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2161321613AY.1000.994341
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2050620506AY.98.10.993123
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1583615836AY.1180.992106
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1484414844AY.330.991252
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1403114031AY.230.978657
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1377213772AY.46.60.99444
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1242512426AY.980.981515
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC112426AY.980.000079
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1172311723AY.1170.990788
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1170411705AY.3.10.997869
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC111705AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1079610796AY.99.20.994931
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1028810288AY.340.997576
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt93039303AY.460.968256
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt92639263AY.4.50.9957
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt88498849AY.7.10.997295
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt79107910AY.450.962521
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt72987298AY.1210.987551
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt68596859AY.1130.976648
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt67146714AY.360.995109
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt66736673AY.4.2.10.99419
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt60706070AY.46.40.998519
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt54555455AY.1110.999084
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt50895089AY.70.997452
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt50245024AY.46.50.996825
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt45344534AY.29.10.999779
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt42944294AY.1140.992373
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt42284228AY.1100.476448
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt36203620AY.930.988531
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt35493549AY.5.40.982014
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt34443444AY.1160.987668
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt33683368AY.410.990006
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt33523352AY.920.962942
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt32513251AY.9.20.119408
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt31973197AY.116.10.99564
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt31333133AY.120.990202
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt31013101AY.120.10.995506
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt29622962AY.1060.991962
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt28822882AY.5.30.972335
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt24902491AY.10.985358
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC12491AY.10.000396
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt24372437AY.4.40.997136
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt23962396AY.23.11
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt23162316AY.850.989321
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22502250AY.940.996016
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22282228AY.840.974628
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt21352135AY.1070.994874
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt20222022AY.1010.991663
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt20032003AY.120.2.10.998007
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt19431943AY.34.10.990821
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt18291829AY.320.973908
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt17731773AY.7.20.991611
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt15071507AY.46.20.957433
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt14661466AY.1050.942765
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt14491449AY.900.991786
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt13801380AY.39.1.11
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt13561356AY.4.11
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt13391339AY.1090.990385
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt13391339AY.910.978086
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt12791279AY.950.973364
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11841184AY.4.30.996633
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11801180AY.870.982515
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11631163AY.860.965145
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt10941094AY.880.967286
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt10681068AY.46.30.997199
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt955955B.10.008747
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt945945AY.46.10.970226
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt945945AY.990.991605
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt915915AY.470.028461
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt883883AY.800.996614
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt834834AY.770.940248
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt829829AY.750.046443
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt823823AY.790.996368
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt765765AY.1080.84344
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt726726AY.820.985075
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt709709AY.120.20.911311
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt648648AY.39.20.998459
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt634634AY.99.10.984472
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt619619All0.000118
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt618618AY.780.952234
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt616616AY.730.409847
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt585585AY.970.994898
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt578578AY.830.996552
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt498498AY.1040.988095
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt490490AY.810.976096
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt487487AY.680.133315
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt471471AY.210.893738
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt470470AY.220.983264
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt463463AY.960.960581
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt457457AY.550.419266
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt406406B0.051892
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt405405AY.5.20.997537
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt388388AY.740.044871
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt366366AY.540.034897
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt297297AY.590.157309
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt297297B.1.617.20.001118
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt292294All0.000056
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCTTTC2294All0
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt290290AY.580.263158
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt281281AY.190.32041
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt266266AY.5.11
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt246246AY.91.11
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct229230All0.000044
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGcTTcC1230All0
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt223223AY.260.006313
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt221221AY.530.063542
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt204204AY.891
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt203203AY.760.980676
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt191191AY.1150.994792
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt186186AY.520.151466
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt182182AY.690.033974
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt173173AY.75.10.031194
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt164164AY.670.076137
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt163163AY.640.097024
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt148148AY.560.23756
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt147147AY.100.077901
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt145145AY.40.000226
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt144144AY.370.045512
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct139140B.1.1.70.000124
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGcTTcC1140B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt129129AY.630.049903
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt108108AY.570.070866
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt9797AY.1020.002572
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt9797AY.140.008537
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt9696AY.1030.000596
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt9595AY.620.041394
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt9494B.1.1.70.000084
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt9393AY.380.04643
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt9191AY.400.087753
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt8989AY.130.014327
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC7988All0.000015
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcA788All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcG288All0
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt8787AY.480.040465
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt8686AY.700.017932
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt8686B.1.20.000757
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt8181AY.350.018877
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt7171AY.710.033729
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt5959AY.600.055347
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt5555AY.650.029318
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt5353AY.110.07095
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt5151B.1.617.20.000192
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt5050AY.160.018983
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt4848AY.40.000075
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt4545B.1.10.000816
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct4141All0.000008
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt3939AY.500.031175
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt3636AY.430.000159
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt3636AY.490.115016
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt3232AY.390.000791
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt3131B.1.4270.001565
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt3030AY.170.245902
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---2929All0.000006
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2828AY.240.012069
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2828B.1.360.004085
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2727AY.610.002829
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2121AY.510.019091
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC2021B.1.1.70.000018
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcG121B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt2020AY.280.037807
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct2020B.1.1770.000263
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC2020P.10.000315
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1818AY.300.007123
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt1616AY.46.50.003175
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---1515B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1414AY.16.10.006579
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1414AY.660.014973
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1414AY.80.008485
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct1414B.10.000128
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1414B.1.617.10.001806
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt1313AY.440.000079
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt1313AY.46.60.000939
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct1313B.1.1.70.000012
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1212AY.90.000811
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1212B.1.1.5260.042553
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1212B.1.1770.000158
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct1212B.1.177.620.014303
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1111AY.9.10.000921
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1111P.10.000173
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1010B.1.6210.000885
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt1010B.1.6280.003524
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct1010D.20.00075
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt99AY.1200.000335
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt99AY.720.012245
ORF1ab/nsp14A2-B394A394DgCtgAt77All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt77B.1.1600.000218
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt77B.1.2340.000924
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt77B.1.36.350.018229
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt460.222222
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCTgTC260.111111
ORF1ab/nsp14A2-B394A394PGctCct56All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B394A394PGcTCcG16All0
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC66AY.260.00017
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt66AY.270.000388
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC36B.10.000027
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcA36B.10.000027
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct66B.1.10.000109
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt66B.1.1.2940.007595
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt66B.1.2140.021978
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt66B.1.3490.004289
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt66B.1.3750.004918
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt66B.1.5960.000523
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt66B.1.6230.003219
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt66C.180.015544
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt55B.1.177.730.002831
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt55B.1.3350.051546
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt55B.1.5250.000566
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt55P.1.10.001588
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt240.111111
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCTTTC240.111111
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del1gCtg-t34All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del1gcTgc-14All0
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt44B.1.1.5230.00625
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt44B.1.4740.007605
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt44B.1.5760.003626
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt33A0.001161
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del2GCt--t23All0
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del2gCTg--13All0
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct33AY.260.000085
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt33AY.330.0002
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC33AY.430.000013
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp14A2-B394A394PGctCct33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt33B.1.4280.003061
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt33B.1.4680.017143
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt33B.1.4850.044776
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC23B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcG13B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcA23B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC13B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct33N.50.0053
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22A.10.000564
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22AU.30.004219
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22AY.20.000712
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt22AY.440.000012
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt22AY.450.000243
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt22AY.50.000041
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt22AY.50.000041
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct22AY.550.001835
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt22AY.60.000082
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct22AY.680.000547
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp14A2-B394A394DgCtgAt22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.1430.042553
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.1570.00597
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.177.600.000437
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.3360.004878
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.36.10.002281
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.3690.00057
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.3980.005952
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.4330.00639
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.6040.034483
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.1.6290.026667
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22B.550.0059
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22C.370.000232
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC22N.40.008511
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt22Q.10.000253
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11A.10.000282
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp14A2-B394A394GgCtgGt11All0
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11AU.30.00211
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11AY.150.002222
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11AY.180.010101
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del2gCTg--11AY.190.00114
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp14A2-B394A394DgCtgAt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11AY.270.000065
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp14A2-B394A394PGcTCcG11AY.30.00001
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11AY.310.018519
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11AY.350.000233
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del2GCt--t11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del1gCtg-t11AY.440.000006
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11AY.440.000006
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp14A2-B394A394GgCtgGt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11AY.470.000031
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11AY.480.000465
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.70.000196
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11AY.720.001361
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.780.001541
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.810.001992
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del1gCtg-t11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.920.000287
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.960.002075
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11AY.960.002075
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp14A2-B394A394IGCtATt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp14A2-B394A394DgCtgAt11B0.000128
ORF1ab/nsp14A2-B394A394FGCtTTt11B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B394A394DgCtgAt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.1010.01
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.2100.005714
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.1.2260.005814
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.2540.011236
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.4020.011111
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.5120.028571
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.1040.00369
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1310.008772
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1420.002899
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1580.02381
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp14A2-B394A394PGctCct11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.177.510.004566
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del1gcTgc-11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11B.1.240.10.025
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp14A2-B394A394delGCT---11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.3250.006897
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.3260.007576
ORF1ab/nsp14A2-B394A394PGctCct11B.1.3320.003497
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.3780.006849
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.3900.010638
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.4060.006061
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5460.003704
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5710.009709
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5730.006098
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5740.002151
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcA11B.1.5810.009434
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5860.010989
ORF1ab/nsp14A2-B394A394DgCtgAt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.6000.005848
ORF1ab/nsp14A2-B394A394DgCtgAt11B.1.6060.006024
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del1gCtg-t11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp14A2-B394A394TGctAct11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.6310.003367
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.700.02439
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.810.021277
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.1.940.027027
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.370.028571
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11B.400.000364
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcA11B.400.000364
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11C.36.3.10.002717
ORF1ab/nsp14A2-B394A394AgcTgcC11C.370.000116
ORF1ab/nsp14A2-B394A394del2GCt--t11D.20.000075
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11D.30.005917
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11N.90.005952
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11P.20.000187
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11P.70.004367
ORF1ab/nsp14A2-B394A394SGctTct11Q.10.000126
ORF1ab/nsp14A2-B394A394VgCtgTt11R.10.00009