CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : CodonNum = 357

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IS6282InonsynaGtaTt11641164119108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NS6282NnonsynaGtaAt207207119108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GS6282GnonsynAgtGgt129129119108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SS6282SsynagTagC8787119108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delS6282deldelAGT---4040119108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RS6282RnonsynAgtCgt26160.61538519108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RS6282RnonsynagTagG2670.26923119108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RS6282RnonsynagTagA2630.11538519108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357CS6282CnonsynAgtTgt1818119108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357TS6282TnonsynaGtaCt99119108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357del1S6282del1delagTag-320.66666719108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357del1S6282del1delAgt-gt310.33333319108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357KS6282KnonsynaGTaAA210.519108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357KS6282KnonsynaGTaAG210.519108-19110
ORF1ab/nsp14A2-B357S357AS6282AnonsynAGtGCt11119108-19110

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11641164All0.000223
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt300300B.1.1.70.000269
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt207207All0.00004
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt133133AY.40.000207
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt129129All0.000025
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt103103B.1.617.20.000388
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC8787All0.000017
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt7676AY.1030.000472
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt6363B.1.1.70.000056
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt6060AY.250.000361
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt5050AY.430.000222
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---4040All0.000008
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RAgtCgt1626All0.000003
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RagTagG726All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RagTagA326All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC2626AY.40.00004
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt2525AY.440.000152
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt2020L.41
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1919B.10.000174
ORF1ab/nsp14A2-B357S357CAgtTgt1818All0.000003
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt1818AY.40.000028
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1818B.1.177.730.010193
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1818P.10.000284
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt1717AY.40.000026
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1616B.1.36.290.008277
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt1616B.1.617.20.00006
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1515AY.30.000149
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1414AY.1000.000644
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1414AY.1200.000521
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RAgtCgt1414AY.39.10.000555
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC1414B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1313AY.1020.000345
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1313AY.39.10.000515
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1313AY.50.000268
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1313B.1.4290.000306
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC1313B.1.617.20.000049
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1212AY.980.000948
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1212B.1.10.000218
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1212B.1.3510.000357
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt1212B.1.617.20.000045
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt1111AY.46.60.000794
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt1010AY.440.000061
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1010AY.470.000311
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1010B.1.1.5120.285714
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---1010B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt1010B.1.20.000088
ORF1ab/nsp14A2-B357S357TaGtaCt99All0.000002
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt99AY.250.000054
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt88AY.390.000198
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt88AY.440.000049
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt88B.1.160.280.023392
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt77AY.200.000272
ORF1ab/nsp14A2-B357S357CAgtTgt77AY.250.000042
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---77AY.40.000011
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt77AY.60.000288
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt77B.1.1.10.002287
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt66AY.290.000095
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt66AY.30.00006
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC66AY.440.000037
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt66AY.99.20.000553
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt66B.1.360.000875
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt66B.1.4270.000303
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt55AY.260.000142
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt55AY.420.000201
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt55AZ.20.004105
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt55B.1.1.5190.000199
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt55B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt55B.1.617.10.000645
ORF1ab/nsp14A2-B357S357CAgtTgt55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt44AY.1070.001864
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt44AY.1140.000924
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt44AY.250.000024
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt44AY.460.000416
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt44AY.610.000419
ORF1ab/nsp14A2-B357S357del1agTag-23All0
ORF1ab/nsp14A2-B357S357del1Agt-gt13All0
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt33AY.140.000264
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt33AY.260.000085
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt33AY.320.001597
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt33AY.330.0002
ORF1ab/nsp14A2-B357S357TaGtaCt33AY.40.000005
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt33AY.4.50.000322
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt33AY.430.000013
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ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt33AY.9.20.00011
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ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC33B.1.4270.000151
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ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---33B.1.617.20.000011
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ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt33D.20.000225
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ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt22A.10.000564
ORF1ab/nsp14A2-B357S357KaGTaAA12All0
ORF1ab/nsp14A2-B357S357KaGTaAG12All0
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---22AY.140.000176
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt22AY.160.000759
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt22AY.230.000139
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC22AY.260.000057
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ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt22AY.90.000135
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RagTagG12B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RAgtCgt12B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt22B.1.1110.00235
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ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt22B.1.5970.009259
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt22B.1.6200.001892
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp14A2-B357S357KaGTaAG110.055556
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RagTagG110.055556
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AE.80.000489
ORF1ab/nsp14A2-B357S357AAGtGCt11All0
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AP.10.001502
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.100.00053
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp14A2-B357S357TaGtaCt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.190.00114
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC11AY.250.000006
ORF1ab/nsp14A2-B357S357CAgtTgt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC11AY.390.000025
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp14A2-B357S357RAgtCgt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp14A2-B357S357TaGtaCt11AY.4.10.000737
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC11AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC11AY.450.000122
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp14A2-B357S357NaGtaAt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp14A2-B357S357KaGTaAA11AY.480.000465
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---11AY.50.000021
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC11AY.50.000021
ORF1ab/nsp14A2-B357S357GAgtGgt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp14A2-B357S357SagTagC11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.530.000288
ORF1ab/nsp14A2-B357S357delAGT---11AY.540.000095
ORF1ab/nsp14A2-B357S357IaGtaTt11AY.540.000095
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