CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp14A2-B : CodonNum = 208

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsyntGttCt7043740.5312518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsynTgtAgt7043250.46164818661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsynTgTAgC70420.0028409118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsyntGTtCG70410.0014204518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsyntGTtCC70410.0014204518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208SC6133SnonsyntGTtCA70410.0014204518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CC6133CsyntgTtgC179179118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208delC6133deldelTGT---9797118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208FC6133FnonsyntGttTt19180.94736818661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208FC6133FnonsyntGTtTC1910.052631618661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GC6133GnonsynTgtGgt1580.53333318661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GC6133GnonsynTgTGgA1530.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GC6133GnonsynTgTGgG1520.13333318661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GC6133GnonsynTgTGgC1520.13333318661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208YC6133YnonsyntGttAt14120.85714318661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208YC6133YnonsyntGTtAC1420.14285718661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RC6133RnonsynTgtCgt1050.518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RC6133RnonsynTgTAgA1030.318661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RC6133RnonsynTgTAgG1020.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208del1C6133del1delTgt-gt980.88888918661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208del1C6133del1deltGtt-t910.11111118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208NC6133NnonsynTGtAAt860.7518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VC6133VnonsynTGtGTt830.37518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VC6133VnonsynTGTGTA830.37518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208NC6133NnonsynTGTAAC820.2518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VC6133VnonsynTGTGTC810.12518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VC6133VnonsynTGTGTG810.12518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208IC6133InonsynTGTATA730.42857118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208IC6133InonsynTGtATt730.42857118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208IC6133InonsynTGTATC710.14285718661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208DC6133DnonsynTGtGAt640.66666718661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208DC6133DnonsynTGTGAC620.33333318661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208XC6133XnonsyntgTtgA530.618661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TC6133TnonsynTGtACt520.418661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208AC6133AnonsynTGtGCt520.418661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208AC6133AnonsynTGTGCA510.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TC6133TnonsynTGTACA510.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208XC6133XnonsyntGTtAA510.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208XC6133XnonsyntGTtAG510.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208AC6133AnonsynTGTGCG510.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208AC6133AnonsynTGTGCC510.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TC6133TnonsynTGTACG510.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TC6133TnonsynTGTACC510.218661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208LC6133LnonsyntGTtTA430.7518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208LC6133LnonsyntGTtTG410.2518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208WC6133WnonsyntgTtgG22118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208del2C6133del2delTGt--t22118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208KC6133KnonsynTGTAAG210.518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208EC6133EnonsynTGTGAG210.518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208KC6133KnonsynTGTAAA210.518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208EC6133EnonsynTGTGAA210.518661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208MC6133MnonsynTGTATG11118661-18663
ORF1ab/nsp14A2-B208C208HC6133HnonsynTGtCAt11118661-18663

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt374704All0.000072
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt325704All0.000062
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgTAgC2704All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCA1704All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCC1704All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCG1704All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt358358B.1.1.3030.98895
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt258258AY.60.010611
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC179179All0.000034
ORF1ab/nsp14A2-B208C208delTGT---9797All0.000019
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC8888B.1.1.70.000079
ORF1ab/nsp14A2-B208C208delTGT---4444B.1.1.70.000039
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt2626B.1.1.280.008092
ORF1ab/nsp14A2-B208C208FtGttTt1819All0.000003
ORF1ab/nsp14A2-B208C208FtGTtTC119All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC1717B.1.243.10.377778
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgtGgt815All0.000002
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgTGgA315All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgTGgC215All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgTGgG215All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208YtGttAt1214All0.000002
ORF1ab/nsp14A2-B208C208YtGTtAC214All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC1414B.1.20.000123
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt813B.10.000073
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt313B.10.000027
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgTAgC113B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCA113B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC1212AY.250.000072
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RTgtCgt510All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RTgTAgA310All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RTgTAgG210All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt410B.1.10.000073
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGttCt310B.1.10.000054
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCC110B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgTAgC110B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208StGTtCG110B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208del1Tgt-gt89All0.000002
ORF1ab/nsp14A2-B208C208del1tGtt-t19All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt99AY.50.000186
ORF1ab/nsp14A2-B208C208NTGtAAt68All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGTGTA38All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGtGTt38All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208NTGTAAC28All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGTGTG18All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGTGTC18All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ITGTATA37All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ITGtATt37All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ITGTATC17All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208YtGttAt67B.10.000055
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgtGgt47B.10.000037
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgTGgA27B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgTGgC17B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208YtGTtAC17B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208delTGT---77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp14A2-B208C208DTGtGAt46All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208DTGTGAC26All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgtGgt26B.1.10.000036
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgTGgG26B.1.10.000036
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgTGgA16B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208GTgTGgC16B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC66B.1.36.290.003104
ORF1ab/nsp14A2-B208C208XtgTtgA35All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ATGtGCt25All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TTGtACt25All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ATGTGCA15All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TTGTACA15All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TTGTACC15All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208XtGTtAA15All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208XtGTtAG15All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TTGTACG15All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ATGTGCG15All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ATGTGCC15All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208delTGT---55AY.40.000008
ORF1ab/nsp14A2-B208C208FtGttTt45B.10.000037
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ITGtATt25B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGtGTt25B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGTGTA25B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ITGTATA25B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGTGTC15B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208FtGTtTC15B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ITGTATC15B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp14A2-B208C208LtGTtTA34All0.000001
ORF1ab/nsp14A2-B208C208LtGTtTG14All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC44B.10.000037
ORF1ab/nsp14A2-B208C208DTGtGAt34B.10.000027
ORF1ab/nsp14A2-B208C208DTGTGAC14B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp14A2-B208C208delTGT---33AY.4.50.000322
ORF1ab/nsp14A2-B208C208NTGtAAt23B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208XtgTtgA23B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RTgTAgA23B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208XtGTtAA13B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RTgtCgt13B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208NTGTAAC13B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp14A2-B208C208delTGT---33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RTgTAgG23B.1.10.000036
ORF1ab/nsp14A2-B208C208NTGtAAt23B.1.10.000036
ORF1ab/nsp14A2-B208C208YtGttAt23B.1.10.000036
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ATGtGCt13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGTGTG13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGTGTA13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208YtGTtAC13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TTGtACt13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ATGTGCC13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TTGTACG13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ATGTGCG13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TTGTACC13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208NTGTAAC13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208VTGtGTt13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208RTgTAgA13B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC33B.1.1.270.016949
ORF1ab/nsp14A2-B208C208STgtAgt33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC22A.190.018868
ORF1ab/nsp14A2-B208C208del2TGt--t22All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208WtgTtgG22All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208KTGTAAG12All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ETGTGAA12All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208KTGTAAA12All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ETGTGAG12All0
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp14A2-B208C208FtGttTt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp14A2-B208C208delTGT---22AY.250.000012
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC22AY.290.000032
ORF1ab/nsp14A2-B208C208FtGttTt22AY.30.00002
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC22AY.30.00002
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC22AY.40.000003
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC22AY.430.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208delTGT---22AY.430.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC22AY.680.000547
ORF1ab/nsp14A2-B208C208CtgTtgC22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp14A2-B208C208del1Tgt-gt22B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208LtGTtTA22B.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TTGTACA12B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ATGtGCt12B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208TTGtACt12B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ATGTGCA12B.10.000009
ORF1ab/nsp14A2-B208C208WtgTtgG22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp14A2-B208C208DTGTGAC12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ITGtATt12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208ITGTATA12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208XtGTtAG12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp14A2-B208C208DTGtGAt12B.1.10.000018
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