CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : Mut = Y64Y

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1364Y64YY5388YsyntaCtaT76077607116426-16428

Details of the mutation Y64Y within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT76077607All0.001455
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT15051505AY.40.002342
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11251125B.1.1.70.001007
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT873873B.1.5680.97
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT506506B.1.5820.248283
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT317317AY.260.008974
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT236236B.1.617.20.000889
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT198198AY.440.001205
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT181181AZ.50.635088
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT173173B.10.001585
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT145145C.37.10.379581
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT140140B.1.2580.009317
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT102102P.10.001607
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT9393AY.250.000559
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT9292AY.30.000915
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT9191B.1.20.000801
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT9191B.1.3510.002705
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT9090AY.430.000399
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT7575AY.1030.000466
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT7272AD.20.015765
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT6161AY.1020.001617
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT5959B.1.2120.983333
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT5252B.1.3110.014278
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT5151AY.420.002052
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT5050B.1.2340.006597
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT4242B.1.5361
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT3838B.1.5260.000893
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT3737B.1.1770.000487
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT3636B.1.4090.028125
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT3333AY.620.014379
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT3333AY.750.001849
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT3333R.10.00297
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT3131B.1.10.000562
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT3030B.1.1.5190.001191
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT3030B.1.4290.000706
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT2727AY.46.60.00195
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT2626AY.4.20.000564
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT2626AY.50.000537
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT2323B.1.360.003356
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT2121AY.390.000519
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT2121AY.4.50.002257
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT2121B.1.6370.001535
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1818C.370.002089
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1616AY.240.006897
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1515AY.200.000583
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1515AY.290.000237
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1414P.1.120.006776
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1313AY.340.001261
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1212A.2.50.005988
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1212B.1.2430.000835
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1212B.1.4270.000606
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1212P.1.140.000574
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1212P.20.00224
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1111B.1.1600.000343
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1111B.1.177.40.002322
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1010AY.1000.00046
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1010B.1.6120.026525
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT1010B.6.60.008889
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT99AY.1190.000318
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT99B.1.2410.007305
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT99B.1.36.360.005418
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT99B.1.5960.000784
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT88A.40.102564
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT88AY.9.20.000294
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT88B.1.1.2140.000444
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT88B.1.1.280.00249
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT88B.1.1.630.003086
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT88B.1.2210.000568
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT88Q.30.00116
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT77AY.940.003099
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT77B.1.177.810.001325
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT77B.1.4510.057377
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66AY.360.000889
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66AY.380.002996
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66AY.540.000572
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66AY.610.000629
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66B.1.1.3510.01676
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66B.1.1.740.025862
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66B.1.177.570.001686
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66B.1.5610.002382
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66B.1.5750.00182
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66B.1.6210.000531
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT66B.1.9.50.034091
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT55AY.230.000349
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT55AY.330.000334
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT55AY.450.000608
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT55AY.98.10.000242
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT55B.1.1.2220.00102
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT55B.1.177.730.002831
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT55B.1.3490.003574
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT55B.1.5950.001305
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT55P.30.007974
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.1050.002572
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.270.000259
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.46.40.000658
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.470.000124
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.680.001095
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.780.006163
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.850.001709
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.860.00332
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.920.001149
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44B.1.1.3150.033898
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44B.1.177.560.00267
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44B.1.177.70.000659
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44B.1.3960.002823
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44B.1.4700.005618
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT44Q.40.001819
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33AY.1070.001398
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33AY.1100.000338
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33AY.1110.000549
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33AY.300.001187
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33AY.4.2.10.000447
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33AY.560.004815
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33AY.980.000237
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B0.000383
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.1.1.3180.000905
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.1.1.4480.006098
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.1.177.760.007481
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.1.2400.000647
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.1.36.160.004274
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.1.36.190.027778
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.1.36.220.003623
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.1.4250.008982
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.1.5240.004219
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33B.3.10.004975
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT33D.20.000225
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT220.111111
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.120.000632
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.130.000322
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.140.000176
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.320.001065
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.46.10.002053
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.590.001059
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.720.002721
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.770.002255
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22AY.910.001461
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.1.2800.006173
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.1.3360.033333
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.1.5240.041667
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.1280.001271
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.160.90.014388
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.177.100.001756
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.177.120.000303
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.4200.020833
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.4560.006536
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.5640.000852
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.564.10.003155
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.5650.001621
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.5800.00813
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.6000.011696
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22D.50.00995
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22P.1.100.000539
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11A.10.000282
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AE.10.011364
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AW.10.003049
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.180.010101
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.39.1.10.000725
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.480.000465
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.500.000799
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.810.001992
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.840.000437
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11AZ.30.00152
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.1160.0625
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.1710.003676
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.1810.004545
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.2050.003717
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.270.00565
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.3290.003846
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.3760.005952
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.3780.007299
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.4860.001577
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.520.012195
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.5230.001563
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1.5280.004808
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.1400.018868
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.2230.002778
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp1364Y64YtaCtaT11B.1.258.160.001637
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