CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : Mut = V49I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1349V49IV5373InonsynGttAtt31433143116381-16383

Details of the mutation V49I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt31433143All0.000601
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt789789AY.430.003496
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt431431B.1.10.007819
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt136136AY.4.50.014619
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt128128AY.420.005149
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt127127B.1.1.70.000114
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt110110AY.7.20.061521
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt100100A0.0387
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt9191AY.460.009471
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt9090AY.46.10.092402
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt8787AY.98.10.004213
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt7878A.41
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt7777AY.610.008068
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt7474AY.5.40.020476
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt6565AY.390.001606
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt6464AY.340.006206
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt4545AY.710.021378
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt4444B.1.617.20.000166
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt4242AY.9.10.003516
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt3737AY.40.000058
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt3535AY.46.60.002527
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt3333AY.75.10.00595
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt3131AY.1160.00889
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt3131AY.330.00207
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt2727AY.9.20.000992
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt2121AY.540.002002
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt2020AY.440.000122
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1919B.10.000174
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1818P.1.10.005718
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1616C.36.30.009075
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1313AY.530.003738
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1313AY.700.002711
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1212AY.680.003285
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1111AY.1020.000292
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1010AY.1060.003349
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1010AY.1200.000372
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt1010AY.620.004357
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt99B.1.1.1610.031802
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt88AY.1030.00005
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt88B.1.1.3540.035088
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt77AY.410.002058
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt77AY.670.00325
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt77AY.840.003062
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt77AY.920.002011
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt77AY.980.000553
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt77B0.000895
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt66AY.360.000889
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt66AY.580.005445
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt66AY.650.003198
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt66B.1.1.4090.016997
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt55AY.1130.000712
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt55B.1.5250.000566
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt44AY.510.003636
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt44B.1.1.700.001364
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt33AY.380.001498
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt33AY.450.000365
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt33AY.50.000062
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt33B.1.177.750.003122
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt33P.10.000047
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt33P.1.70.000958
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt220.111111
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22AY.10.000791
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22AY.230.000139
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22AY.320.001065
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22AY.370.000632
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22AY.470.000062
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22AY.730.001331
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22AY.90.000135
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22B.1.1.100.00223
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22B.1.1.2770.001517
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22B.1.1.3700.025316
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt22C.37.10.005236
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.560.001605
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.570.000656
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.950.000761
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11AY.970.001701
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.1.1710.003676
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.1.5120.028571
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.1.5240.020833
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.1.5280.004808
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.160.140.002119
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.177.510.004566
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.4320.011236
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp1349V49IGttAtt11C.360.000911