CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : Mut = S236S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13236S236SS5560SsynagTagC439439116942-16944

Details of the mutation S236S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC439439All0.000084
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC175175B.1.617.20.000659
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC7171B.1.1.70.000064
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC6060AY.430.000266
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC3030B.1.1.3320.9375
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC1212AY.99.20.001106
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC1111AY.40.000017
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC1010P.1.140.000478
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC66AY.330.000401
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC66B.1.10.000109
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC55B.1.4160.006345
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC44AY.440.000024
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC33AY.30.00003
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC33B.10.000027
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC22AY.260.000057
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC22AY.390.000049
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC22AY.60.000082
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11AY.230.00007
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11AY.250.000006
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11AY.420.00004
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11AY.450.000122
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11AY.670.000464
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11B.1.1.4210.030303
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11B.1.6180.004032
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11B.1.6290.013333
ORF1ab/nsp13236S236SagTagC11P.1.40.000977