CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : Mut = M233I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13233M233IM5557InonsynatGatT604958910.9738816933-16935
ORF1ab/nsp13233M233IM5557InonsynatGatA60491390.02297916933-16935
ORF1ab/nsp13233M233IM5557InonsynatGatC6049190.0031410216933-16935

Details of the mutation M233I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT58916049All0.001127
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA1396049All0.000027
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC196049All0.000004
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT954954AY.470.029674
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT751764AY.40.001169
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA13764AY.40.00002
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT535542B.1.617.20.002014
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA4542B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC3542B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT395396B.1.20.003478
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA1396B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT282283AY.440.001716
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC1283AY.440.000006
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT258258B.1.2210.018326
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT239240AY.430.001059
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA1240AY.430.000004
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT206212AY.250.001239
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA6212AY.250.000036
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT170180B.1.1.70.000152
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA6180B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC4180B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT148149B.10.001356
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA1149B.10.000009
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT144144AY.930.039323
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT108108AY.1160.030972
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT105105B.1.1990.433884
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT5798AY.290.000899
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA4198AY.290.000647
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT9595B.1.5300.678571
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT6365AY.30.000627
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA265AY.30.00002
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT5659AY.420.002253
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA359AY.420.000121
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT5255AY.1030.000323
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA355AY.1030.000019
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT5354AY.200.00206
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA154AY.200.000039
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT5354AY.390.00131
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA154AY.390.000025
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT5253AY.1020.001379
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA153AY.1020.000027
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT4849B.1.1770.000632
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC149B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT4848B.1.360.007003
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT3939B.1.1.5190.001549
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT3232B.1.10.000581
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT3232B.1.1.2260.186047
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT2830AY.1200.001041
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC230AY.1200.000074
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT2930AY.98.10.001404
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA130AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT2727AY.4.2.10.004023
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT2727AY.50.000558
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1425B.1.6210.001239
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA1125B.1.6210.000974
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1723AY.260.000481
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA623AY.260.00017
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT2222B.1.6370.001608
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1920B.1.1.3180.005733
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA120B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1919AY.4.20.000412
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1919B.1.4290.000447
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1919P.10.000299
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1717B.1.2390.020757
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1416AY.1190.000494
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA216AY.1190.000071
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1616AY.4.10.011799
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1515AY.1180.00094
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1515B.1.177.150.009464
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1212B.1.2100.025586
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1212B.1.3510.000357
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA912B.1.3670.007132
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT312B.1.3670.002377
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1011AY.1000.00046
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA111AY.1000.000046
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1011B.1.5260.000235
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA111B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1010AY.1170.000845
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT910AY.190.010262
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC110AY.190.00114
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1010AY.330.000668
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT910AY.4.50.000967
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC110AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1010B.1.1.470.053476
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1010B.1.214.30.071429
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1010B.1.2520.066225
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT1010P.1.100.002695
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT99AY.46.50.001786
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT99AY.9.20.000331
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT99B.1.3850.095745
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT99B.1.5640.003833
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT99B.1.6310.030303
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT99N.60.06383
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT88AY.450.000973
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT68B.1.36.290.003104
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA28B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT77AY.130.001127
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT67AY.460.000624
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA17AY.460.000104
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT77B.1.1.2140.000388
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT67B.1.1600.000187
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC17B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT67B.1.2340.000792
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC17B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT77B.1.4280.007143
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT77B.1.5960.00061
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT66B.1.1.1280.042553
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA56B.1.4250.01497
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT16B.1.4250.002994
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT66B.1.6300.031414
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55AY.120.00158
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT45AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA15AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55AY.610.000524
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55AY.660.005348
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55AY.7.10.000564
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55AY.99.20.000461
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA55B.1.1.3120.00956
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55B.1.160.330.022124
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55B.1.2740.059524
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55B.1.36.380.00821
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55B.1.4270.000252
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT55R.10.00045
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT34A.2.50.001497
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA14A.2.50.000499
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44AY.1050.002572
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44AY.1140.000924
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44AY.230.000279
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44AY.510.003636
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44AY.650.002132
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44AY.770.00451
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44B.1.1.2410.008282
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44B.1.1.700.001364
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44B.1.214.20.002398
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44B.1.2320.002149
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44B.1.2400.000862
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44B.1.5460.014815
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44B.1.5680.004444
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT44B.1.5950.001044
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT34B.1.617.10.000387
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC14B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33A0.001161
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33AT.10.015385
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33AY.1060.001005
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33AY.240.001293
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33AY.29.10.000662
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33AY.320.001597
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33AY.540.000286
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33AY.75.10.000541
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT23AY.840.000875
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC13AY.840.000437
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33B.1.1.10.00098
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33B.1.1.100.003344
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33B.1.2980.006342
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33B.1.3620.004622
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT23B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC13B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33B.1.466.20.001174
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT33B.1.5510.003871
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT23P.20.000373
ORF1ab/nsp13233M233IatGatC13P.20.000187
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.100.00106
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.140.000176
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.210.003795
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA12AY.360.000148
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT12AY.360.000148
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.520.001629
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.530.000575
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.980.000158
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AY.990.002099
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AZ.10.001735
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22AZ.20.001642
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B0.000256
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.1.3240.105263
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.1.3690.000892
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT12B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA12B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.177.440.001038
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.177.860.000367
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.3340.036364
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.416.10.003125
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.4260.002018
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.5170.000854
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.5760.001813
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.5970.009259
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA22C.36.30.001134
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT22D.20.00015
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA110.055556
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11A.270.001656
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AU.30.00211
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.10.000396
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.160.00038
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.220.002092
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.300.000396
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA11AY.350.000233
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.410.000294
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.640.000595
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.730.000665
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA11AY.750.000056
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.780.001541
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.830.001724
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.850.000427
ORF1ab/nsp13233M233IatGatA11AY.900.000684
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.950.000761
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11AY.960.002075
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.2000.007463
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.2280.003049
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.2370.005405
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.3030.002762
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.3440.010753
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.3540.004386
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.3970.002252
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.4300.041667
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.4870.005587
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.5180.006329
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.5210.005348
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.177.380.010417
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.177.660.041667
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1820.007246
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.1880.016667
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.2120.016667
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.2350.002519
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.2930.0125
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.3360.002439
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.3430.020833
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.3800.006623
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.3820.008929
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.428.20.033333
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.4530.003236
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.4660.023256
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.5620.018519
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.5870.001898
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11B.410.008
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11C.10.002392
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11C.170.055556
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11C.20.016129
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11C.300.001727
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11C.320.023256
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11Q.10.000126
ORF1ab/nsp13233M233IatGatT11Q.80.000165