CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : Mut = L63L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1363L63LL5387LsynctTctG229212500.54537516423-16425
ORF1ab/nsp1363L63LL5387LsynctTctA22929440.41186716423-16425
ORF1ab/nsp1363L63LL5387LsynctTctC2292980.042757416423-16425

Details of the mutation L63L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG12502292All0.000239
ORF1ab/nsp1363L63LctTctA9442292All0.000181
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC982292All0.000019
ORF1ab/nsp1363L63LctTctA885885AY.4.20.019194
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG707707B.1.5760.640979
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG415415B.1.5740.892473
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG5667B.10.000513
ORF1ab/nsp1363L63LctTctA867B.10.000073
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC367B.10.000027
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG5555B.1.3630.714286
ORF1ab/nsp1363L63LctTctA3132AY.40.000048
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC132AY.40.000002
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC1920B.1.1.70.000017
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG120B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp1363L63LctTctA1920B.1.617.20.000072
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC120B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC1717B.1.1.5190.000675
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC1010AY.120.10.00321
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG48B.1.20.000035
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC48B.1.20.000035
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC44B.1.6200.003784
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC33AY.50.000062
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC220.111111
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC22AY.430.000009
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC22B.1.2060.001631
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG12B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC12B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC22B.1.466.10.014388
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC22Q.10.000253
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11AY.250.000006
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11AY.290.000016
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11AY.440.000006
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11AY.470.000031
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11AY.590.00053
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp1363L63LctTctA11AY.990.001049
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11B.1.1.270.00565
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11B.1.2680.010417
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG11B.1.5110.034483
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11C.370.000116
ORF1ab/nsp1363L63LctTctG11D.20.000075
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11P.10.000016
ORF1ab/nsp1363L63LctTctC11P.20.000187