CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : Mut = I258T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13258I258TI5582TnonsynaTcaCc396396117008-17010

Details of the mutation I258T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc396396All0.000076
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc9494B.1.1.70.000084
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc6262AY.40.000096
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc2626B.1.1.3510.072626
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc2020B.1.1770.000263
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc1818AY.1030.000112
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc1717AY.430.000075
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc1414B.10.000128
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc1010AY.440.000061
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc1010P.10.000158
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc88B.1.3510.000238
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc77B.1.2430.000487
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc77B.1.4000.003003
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc66B.1.20.000053
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc66B.1.617.10.000774
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc55AY.200.000194
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc55AY.250.00003
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc55B.1.258.170.00052
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc44B.1.177.830.005926
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc33AY.330.0002
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc33AY.540.000286
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22A.280.005291
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22AY.30.00002
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22AY.450.000243
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22B.1.5700.005882
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22B.1.5880.00182
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11A.10.000282
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11AY.260.000028
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11AY.390.000025
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11AY.50.000021
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11AY.570.000656
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11AY.610.000105
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.4650.003802
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11C.370.000116
ORF1ab/nsp13258I258TaTcaCc11P.1.20.001156