CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : Mut = E365D

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13365E365DE5689DnonsyngaGgaT29229291220.99633917329-17331
ORF1ab/nsp13365E365DE5689DnonsyngaGgaC292291070.0036607517329-17331

Details of the mutation E365D within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2912229229All0.00557
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC10729229All0.00002
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2408824089AY.60.990705
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC124089AY.60.000041
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT858860AY.40.001335
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC2860AY.40.000003
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT853854B.1.617.20.003212
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC1854B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT328328AW.11
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT235245B.1.1.70.00021
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC10245B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT234234AY.440.001424
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT227228AY.430.001006
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC1228AY.430.000004
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT101101AY.450.01229
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT101101B.1.360.014736
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT6095AY.30.000597
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC3595AY.30.000348
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT9192AY.50.001879
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC192AY.50.000021
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT8888B.1.4290.002071
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT4873AY.250.000289
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC2573AY.250.00015
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT6970B.10.000632
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC170B.10.000009
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT6060AY.1030.000373
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT6060AY.200.002332
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT5959B.1.5981
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT5556B.1.20.000484
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC156B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT5454AY.311
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT5052AY.420.002012
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC252AY.420.00008
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT4950B.1.1770.000645
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC150B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT4748AY.390.001161
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC148AY.390.000025
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT4646AY.290.000726
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT4141AY.1020.001087
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT4141AY.1080.045204
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT4040AY.1130.005696
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT4040AY.46.60.002888
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT4040AY.640.02381
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT3939B.1.5260.000917
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT3838B.1.214.20.022782
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT3434AY.750.001905
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT3030AY.99.20.002765
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2629AY.980.002054
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC329AY.980.000237
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2727B.1.617.10.003482
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2525AY.1110.004579
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2424AY.300.009497
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2222B.1.1.2220.004488
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2222B.1.2580.001464
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2222B.1.3510.000654
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2020AY.460.002082
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT2020AY.580.018149
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1919AY.98.10.00092
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1819B.1.6360.120805
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC119B.1.6360.006711
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1818AY.230.001255
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1818AY.540.001716
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1516AY.4.20.000325
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC116AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1515B.1.10.000272
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1515P.10.000236
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1414AY.840.006124
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1414B.1.4270.000707
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1013AY.1000.00046
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC313AY.1000.000138
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1313AY.1190.000459
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1313AY.1210.001759
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1313AY.370.004109
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1212AY.1200.000446
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1212AY.330.000801
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1212B.1.4700.016854
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1111AY.1170.00093
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1111AY.260.000311
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1111AY.5.30.003711
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1010AY.1160.002868
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1010AY.470.000311
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1010B.1.2210.00071
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT1010B.1.2320.005373
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC910B.1.5250.001018
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT110B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT99AY.1180.000564
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT99AY.600.008443
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT88AY.1060.002679
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT88AY.5.40.002214
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT88AY.610.000838
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT88AY.670.003714
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC48B.1.1.5190.000159
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT48B.1.1.5190.000159
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT88B.1.619.10.005131
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT77AY.1050.004502
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT77AY.120.10.002247
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT77AY.880.006189
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT77B.1.2340.000924
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT77B.1.6210.00062
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT77P.1.70.002235
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT66A.2.50.002994
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT66AY.130.000966
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT66AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT66AY.740.000694
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT66B.1.5650.004862
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT55AY.1140.001156
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT55AY.210.009488
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT55AY.3.10.000426
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT55AY.530.001438
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT55AY.9.20.000184
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT55B.1.1.1980.007342
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT55P.20.000933
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44A.270.006623
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44AY.10.001583
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44AY.34.10.00204
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44AY.46.40.000658
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44AY.520.003257
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44AY.910.002922
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44AY.930.001092
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44B.1.1.2940.005063
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44B.1.1.5230.00625
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44B.1.3980.011905
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT34B.1.6090.001438
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC14B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44B.1.6280.001409
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT44C.36.30.002269
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33AY.120.000948
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33AY.270.000194
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33AY.340.000291
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33AY.590.001589
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33AY.70.000588
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33AY.810.005976
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33AY.90.000203
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33AY.990.003148
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33B.1.1.2140.000166
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33B.1.1.3540.013158
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33B.1.1.370.000579
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33B.1.177.350.002073
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33B.1.2230.008333
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT23B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC13B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33B.1.3670.002377
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33B.1.4680.017143
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT33B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AD.20.000438
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.190.002281
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.220.004184
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.23.10.000835
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.280.003781
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.29.10.000441
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.320.001065
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.380.000999
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.400.001929
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.410.000588
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.570.001312
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.700.000417
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.770.002255
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.80.001212
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.850.000854
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.920.000575
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22AY.950.001522
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.110.30.001437
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.1310.017544
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.177.170.001642
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.2100.004264
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.3690.00057
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.4250.005988
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.429.10.024096
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.4590.008163
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.5510.002581
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT22B.1.5870.003795
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AL.10.012987
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AP.10.001502
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC11AY.160.00038
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.360.000148
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.480.000465
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.5.20.002463
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.620.000436
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.780.001541
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11AY.890.004902
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B0.000128
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaC11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.1.3220.008772
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.1.3290.003846
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp13365E365DgaGgaT11B.1.160.320.004292
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