CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : Mut = E261D

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13261E261DE5585DnonsyngaGgaT77200769700.99702117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261DE5585DnonsyngaGgaC772002300.0029792717017-17019

Details of the mutation E261D within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7697077200All0.014721
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC23077200All0.000044
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2973629742B.1.1600.927395
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC629742B.1.1600.000187
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2774527749B.1.1.70.024838
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC427749B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT34003401AY.40.005292
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC13401AY.40.000002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22172217B.1.6210.196247
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT10591059B.1.160.160.984201
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT863863AY.160.327639
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT776776B.1.160.81
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT604606B.1.617.20.002274
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC2606B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT588588B.1.160.171
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT481481B.1.160.71
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT471471B.1.160.140.997881
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT444444AY.250.002671
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT404434AY.430.00179
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC30434AY.430.000133
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT410410B.1.160.260.992736
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT340340B.1.160.280.994152
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT287288B.10.002629
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC1288B.10.000009
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT243243AY.46.60.017546
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT240240AY.290.003786
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT237237B.1.160.291
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT225225B.1.160.330.995575
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT224224B.1.160.240.99115
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT207207B.1.160.231
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT204204B.1.160.300.607143
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT202202B.1.160.151
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT189189B.1.160.320.811159
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT180181AY.260.005096
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC1181AY.260.000028
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT175175B.1.160.111
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT173173AY.30.001721
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT172172AY.440.001047
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT163163B.1.1770.002146
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT160160P.10.002521
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC138156AY.50.00285
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT18156AY.50.000372
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT156156B.1.160.121
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT151151B.1.4290.003553
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT132149B.1.20.001162
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC17149B.1.20.00015
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT139139B.1.160.220.939189
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT139139B.1.160.91
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT137137B.1.160.181
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT122122AB.11
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT122122B.1.160.310.983871
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT118118B.1.160.100.951613
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT110111B.1.10.001996
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC1111B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT107107AY.130.017225
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT105105AY.200.004081
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT103103AY.390.002545
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT9797B.1.6370.007088
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT9194AY.1020.002413
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC394AY.1020.00008
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT9090B.1.160.251
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT8282B.1.160.200.732143
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT8080P.1.160.029929
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7777B.1.3510.002289
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7777B.1.5260.00181
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7676A.2.50.037924
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7474Q.10.009348
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT6666B.1.160.271
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT6464AY.1030.000397
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT6061AY.460.006245
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC161AY.460.000104
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT5858B.1.2210.00412
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT4949AY.330.003272
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT4949B.1.160.211
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT4040AY.1190.001412
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT3636AY.420.001448
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT3636B.1.160.131
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT3434B.1.177.440.017644
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT3232B.1.4270.001616
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2929B.1.4020.284314
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2929P.1.140.001386
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2828B.1.160.191
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2727B.1.1.390.013761
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2727B.1.1.4451
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2424B.1.1.5190.000953
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2424B.1.258.110.009512
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2323B.1.177.810.004354
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2022AY.340.001939
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC222AY.340.000194
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2222B.1.5750.006675
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2121B.1.5090.018182
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2020AY.470.000622
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2020B.1.110.30.014368
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2020B.1.5740.043011
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1919B.1.1.2140.001054
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1919B.1.177.70.003132
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1717AY.270.0011
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1717AY.4.20.000369
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1717AY.610.001781
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1717P.1.20.019653
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC915AY.1200.000335
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT615AY.1200.000223
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1515AY.9.20.000551
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1414AY.1210.001894
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1414B.1.177.730.007928
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1414B.1.2430.000974
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1113AY.1180.000689
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC213AY.1180.000125
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212AY.230.000837
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212AY.560.019262
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B0.001534
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B.1.1.2220.002448
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B.1.177.430.017725
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B.1.2580.000799
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B.1.6230.006438
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1111AY.3.10.000938
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1111AY.750.000616
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1111AY.780.016949
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1011AY.980.00079
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC111AY.980.000079
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1111P.1.60.021401
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1010AY.4.50.001075
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1010AY.98.10.000484
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1010B.1.1.2840.001074
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99A.270.014901
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99AE.80.004401
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99AY.39.10.000357
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99AY.99.20.000829
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99B.1.1.280.002801
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99B.1.360.001313
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99B.1.466.20.003521
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99B.1.5580.041096
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT88AY.1000.000368
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.10.00277
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.1060.002344
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.1170.000592
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.34.10.00357
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.360.001037
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.60.000288
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT67AY.620.002614
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC17AY.620.000436
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.75.10.001262
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.950.005327
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77B.1.1.700.002387
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66AY.450.00073
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66AY.590.003178
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66B.1.2600.020067
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66B.1.5250.000679
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66C.360.005464
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55AY.46.30.004669
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55AY.650.002665
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.1.2610.043103
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.258.170.00052
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.3690.001426
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.5490.035971
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.6090.002397
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55C.370.00058
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55D.50.024876
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.120.001264
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT34AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC14AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.410.001176
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.5.30.00135
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.660.004278
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.1.2730.027027
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.1.3060.001754
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.1.3170.001647
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.177.210.000306
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.177.310.045977
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.36.10.004561
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.36.310.007005
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT24B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC24B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.4730.076923
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.5330.038462
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.5950.001044
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44R.10.00036
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.120.10.000963
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.180.030303
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.220.006276
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.350.000699
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.5.40.00083
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.540.000286
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.570.001969
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.670.001393
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.840.001312
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.1.2790.003363
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.1.2910.002227
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.1.3260.005282
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.177.750.003122
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.220.003953
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.351.20.000908
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.3800.019868
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.4740.005703
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.5610.001191
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.6200.002838
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33P.1.120.001452
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33P.20.00056
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.1090.001479
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