CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : Mut = A18V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1318A18VA5342VnonsyngCtgTt721872170.99986116288-16290
ORF1ab/nsp1318A18VA5342VnonsyngCTgTA721810.00013854316288-16290

Details of the mutation A18V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt72177218All0.00138
ORF1ab/nsp1318A18VgCTgTA17218All0
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt976976AY.40.001519
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt885885B.1.3910.997745
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt465465B.1.617.20.001751
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt394394AY.290.006215
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt302302B.1.1.70.00027
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt235235AY.30.002337
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt224224AY.250.001347
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt220220B.1.20.001937
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt181181AY.440.001102
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt171171AY.340.016581
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt164164AY.50.003386
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt141141P.1.140.00674
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt131131AY.430.00058
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt129129AY.1200.004796
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt118118D.20.008855
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt112112AY.1140.025884
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt112112AY.4.20.002429
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt105105B.10.000962
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt101101AY.330.006745
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt9696AY.260.002718
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt8686B.1.1.2530.215539
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt7777AY.1030.000478
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt6666B.1.1.5190.002621
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt6262AY.750.003473
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt5555B.1.10.000998
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt4242P.10.000662
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt4141AY.200.001593
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt4141AY.420.001649
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt4040B.1.1.2220.00816
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt3737B.1.1770.000487
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt3737B.1.5260.00087
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt3636AY.1170.003043
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt3636AY.390.00089
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt3232AY.4.2.10.004768
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt3232B.1.5950.008351
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt3131AY.230.002162
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt3030B.1.36.160.042735
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2828B.1.5960.00244
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2727AY.4.50.002902
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2626A.2.50.012974
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2626AY.1070.012116
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2626AY.1190.000918
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2626B.1.2210.001847
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2525AY.1060.008372
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2424AY.39.10.000951
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2323AY.1000.001058
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2323B.1.6210.002036
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2222AY.1020.000583
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2121C.36.30.011912
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2020AY.130.00322
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt2020AY.98.10.000969
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1919B.1.1600.000593
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1717B.1.4290.0004
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1717B.1.6340.058219
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1616AY.3.10.001364
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1616AY.930.004369
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1515AY.470.000467
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1515B.1.360.002189
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1414AY.1110.002564
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1414B.1.2340.001847
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1414B.1.4270.000707
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1313B.1.177.210.000994
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1313B.1.617.10.001677
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1212B.1.177.420.010733
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1111A.290.058511
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1111AY.9.10.000921
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1111AY.99.20.001014
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1111C.360.010018
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1010A.23.10.007042
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1010AY.1180.000626
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1010AY.610.001048
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt1010R.10.0009
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt99AY.29.10.001985
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt99AY.90.000608
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88AY.120.2.10.003986
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88AY.140.000704
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88AY.460.000833
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88AY.840.0035
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88AY.9.20.000294
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88AY.920.002298
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88B.1.1.1290.073394
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88B.1.1.2140.000444
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88B.1.1.250.004548
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt88B.1.36.170.003953
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt77AY.1130.000997
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt77AY.630.002708
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt77B.1.2430.000487
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt77B.1.362.20.033019
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt77B.1.3690.001997
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt77C.370.000812
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt66AY.270.000388
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt66AY.46.60.000433
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt66B.1.1.10.00196
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt66B.1.1.3290.023077
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt66B.1.177.850.032609
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt66B.1.2650.007624
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt66P.1.170.000971
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55AY.1210.000677
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55AY.160.001898
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55AY.300.001979
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55AY.980.000395
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55B0.000639
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55B.1.1.3580.172414
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55B.1.177.120.000758
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55B.1.177.440.002595
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55B.1.4040.00651
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55B.1.4260.005045
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55B.1.5780.089286
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt55C.160.005302
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44AY.360.000593
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44AY.370.001264
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44AY.46.20.002541
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44AY.5.30.00135
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44AY.5.40.001107
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44AY.540.000381
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44AY.60.000165
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44AY.620.001743
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44B.1.1.1980.005874
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44B.1.1.2910.00297
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44B.1.1.3110.001433
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44B.1.1.4640.005891
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44B.1.110.30.002874
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44B.1.36.330.030303
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44B.1.4700.005618
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt44Q.40.001819
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt230.111111
ORF1ab/nsp1318A18VgCTgTA130.055556
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33AY.120.000948
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33AY.320.001597
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33AY.380.001498
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33AY.450.000365
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33AY.740.000347
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33AY.780.004622
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33AY.880.002653
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33AZ.10.002602
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.1.2630.004673
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.177.190.004292
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.3970.014563
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.4000.001287
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.5610.001191
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.5880.00273
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.6280.001057
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22A.270.003311
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AD.20.000438
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AU.20.004843
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AY.10.000791
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AY.120.20.002571
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AY.350.000466
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AY.550.001835
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AY.680.000547
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AY.730.001331
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22AY.850.000854
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.1.1700.002494
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.1.2300.018349
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.1.2410.004141
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.1.3220.017544
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.177.570.000562
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.177.750.002081
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.177.860.000367
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.2320.001075
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.3620.003082
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.5160.003914
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.5650.001621
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.617.30.00597
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.6190.001742
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.6250.004706
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.1.6350.035088
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22B.400.000729
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22C.380.016129
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22P.1.160.000748
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt22P.40.007605
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AE.10.011364
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AE.80.000489
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AS.20.015625
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AU.30.00211
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.110.001339
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.240.000431
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.410.000294
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.500.000799
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.520.000814
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.70.000196
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.710.000475
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.790.001211
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.80.000606
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.900.000684
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11AY.940.000443
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.1810.004545
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.1860.003436
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2370.005405
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2430.004082
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2650.003155
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2740.005051
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2800.003086
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2820.011628
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.3090.005848
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.3280.016949
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.3370.003597
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.3680.003086
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.1310.008772
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.140.017544
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.177.300.002513
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.177.450.000381
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.177.530.002392
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.2010.005682
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.2470.014925
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.2840.013158
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.2980.002114
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.36.350.002604
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.4250.002994
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.4320.011236
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.4390.005917
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.5560.007519
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.5670.003333
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.1.930.000934
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11B.290.003509
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11C.350.000774
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11D.50.004975
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11P.1.17.10.000875
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11P.1.40.000977
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11P.20.000187
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11P.60.003145
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11Q.10.000126
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11W.10.008696
ORF1ab/nsp1318A18VgCtgTt11W.20.004831