CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : CodonNum = 420 & Codon = gaG

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13420E420EE5744EsyngaAgaG1976419764117494-17496

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG1976419764All0.00378
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG89408940B.1.617.20.033663
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG41814181AY.350.974365
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG28352835B.1.1.70.002538
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG17541754AY.480.815814
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG589589AY.16.10.276786
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG208208AY.440.001266
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG176176AY.130.028332
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG128128AY.1080.141125
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG111111AY.230.007742
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG6262AY.920.017811
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG5757AY.590.030191
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG5454AY.540.005149
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG4848AY.680.01314
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG4545AY.980.003555
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG4545B.1.177.590.725806
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG4040AY.660.042781
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG3737AY.190.042189
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG3030AY.520.02443
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG2828AY.370.00885
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG2727B.10.000247
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG2525AY.1000.00115
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG2020AY.1030.000124
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG2020AY.5.40.005534
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG1818AY.1160.005162
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG1818AY.430.00008
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG1313AY.250.000078
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG1212AY.470.000373
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG1111AY.1180.000689
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG1111AY.40.000017
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG1111AY.620.004793
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG1010AY.1210.001353
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG99AY.240.003879
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG99AY.550.008257
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG88AY.750.000448
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG88AY.770.009019
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG88AY.9.20.000294
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG77AY.870.005828
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG77AY.98.10.000339
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG66AY.30.00006
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG66AY.640.003571
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG55AY.560.008026
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG55AY.610.000524
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44AY.200.000155
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44AY.420.000161
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44AY.450.000487
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44AY.670.001857
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44AY.840.00175
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44AY.880.003537
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44B0.000511
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44B.1.1.5190.000159
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44B.1.1600.000125
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG44P.10.000063
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG33A0.001161
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG33AY.1060.001005
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG33AY.220.006276
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG33AY.530.000863
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG33AY.710.001425
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG33AY.780.004622
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG33AY.930.000819
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG33AY.950.002283
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG33B.1.221.40.0125
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG22AY.100.00106
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG22AY.110.002677
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG22AY.120.000632
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG22AY.60.000082
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG22AY.700.000417
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AU.10.001266
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.270.000065
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.280.00189
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.290.000016
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.300.000396
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.320.000532
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.330.000067
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.380.000499
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.390.000025
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.410.000294
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.510.000909
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.580.000907
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.820.001357
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.850.000427
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.910.00073
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.960.002075
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp13420E420EgaAgaG11Q.10.000126