CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : CodonNum = 397 & Codon = gtT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13397V397VV5721VsyngtGgtT25768254620.98812517425-17427

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT2546225768All0.00487
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1815918174AY.40.028263
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22042219B.1.1.70.001973
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT812831B.1.617.20.003058
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT620620B.1.3620.955316
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT444444B.1.1.250.252416
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT287289B.1.20.002527
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT212212B.1.362.21
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT183184AY.1000.008419
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT175180AY.430.000775
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT146151AY.470.004541
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT141148B.1.1770.001857
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT118142AY.440.000718
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT120123B.10.001099
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT104105AY.420.004184
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT100100B.1.6210.008852
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT9999P.10.00156
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT7878B.6.60.069333
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT6876AY.250.000409
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT7575B.1.351.20.022693
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT5773AY.260.001614
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT6570AY.30.000647
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT6666B.1.3510.001962
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT5555B.1.3960.038814
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT5050B.1.1.580.268817
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT4547B.1.10.000816
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT3840AY.390.000939
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT3436B.1.1.5190.00135
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT3234AY.1190.00113
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT2433AY.1020.000636
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT3333B.1.1600.001029
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT3132AY.1030.000192
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT2829AY.1180.001754
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT2828AY.410.00823
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1428AY.50.000289
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT2427B.1.5960.002091
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT326B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT2222AJ.11
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT2021B.1.1.3170.008234
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1919B.1.177.210.001453
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1717AY.7.10.001916
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1617B.1.1.2140.000887
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT116AY.70.000196
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1616Q.80.002639
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1515B.1.36.290.00776
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1515B.1.362.11
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1515B.1.4290.000353
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1314AY.610.001362
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1414B.1.258.40.048276
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT313AY.1060.001005
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1212AY.1200.000446
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1011AY.290.000158
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1111AY.330.000735
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1111AY.98.10.000533
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1010AY.230.000697
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT810B.1.2210.000568
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT1010B.1.360.001459
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT99AY.340.000873
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT99B.1.3490.006433
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT99B.1.36.210.019438
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT78AY.4.20.000152
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT88AY.460.000833
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT88AY.910.005844
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT88B.1.5250.000905
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT88R.10.00072
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT47AY.200.000155
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT77AY.530.002013
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT57AY.740.000578
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT67B.1.177.570.001686
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT67B.1.2650.007624
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT77B.1.4000.003003
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT77B.1.5260.000165
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT56AY.1210.000677
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT66AY.5.30.002024
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT66AY.590.003178
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT56AY.750.00028
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT66AY.990.006296
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT66B.1.1.1870.053097
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT66B.1.5750.00182
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT55AY.9.20.000184
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT55AY.99.20.000461
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT55AZ.20.004105
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT55B.1.1.370.000964
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT55B.1.1.500.003394
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT55C.160.005302
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT55P.20.000933
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44A.10.001127
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44A.23.10.002817
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44AY.1080.00441
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44AY.1110.000733
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44AY.140.000352
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44AY.220.008368
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44AY.270.000259
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44AY.46.50.000794
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT24AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44B.1.1.2220.000816
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44B.1.1.2630.006231
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44B.1.177.120.000607
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT24B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33AY.160.001139
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33AY.450.000365
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33AY.5.40.00083
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33AY.560.004815
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33AY.720.004082
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33AY.980.000237
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33B.1.1.1410.006036
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33B.1.1.3110.001074
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT13B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33B.1.6200.002838
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33C.370.000348
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33C.390.056604
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT23P.1.140.000096
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT33P.1.70.000958
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.10.000791
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.110.002677
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT12AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.130.000322
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.280.003781
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.320.001065
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT12AY.90.000068
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.1.1530.002191
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.1.2840.000215
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.1.5260.007092
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.160.220.013514
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.177.70.00033
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.36.10.002281
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.36.100.009569
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.36.190.018519
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.3670.001585
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.3690.00057
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.438.10.000215
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.4700.002809
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.5650.001621
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT12B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22B.1.9.50.011364
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22C.36.30.001134
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT12D.20.000075
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22Q.30.00029
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT22Q.40.00091
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11A.180.05
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11A.290.005319
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.370.000316
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.520.000814
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.620.000436
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.650.000533
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.730.000665
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.770.001127
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.820.001357
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.850.000427
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11AY.960.002075
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B0.000128
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.1740.003378
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.2410.00207
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.3000.010753
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.3700.012658
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.5170.006803
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.1620.005025
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.177.790.002342
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.220.001318
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.3300.028571
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.3560.001727
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.3660.004878
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.5040.03125
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.6000.005848
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.1.780.008547
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.40.002208
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11B.400.000364
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11C.10.002392
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11C.37.10.002618
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11N.40.004255
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11N.50.001767
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp13397V397VgtGgtT11P.30.001595