CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : CodonNum = 261

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13261E261DE5585DnonsyngaGgaT77200769700.99702117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261DE5585DnonsyngaGgaC772002300.0029792717017-17019
ORF1ab/nsp13261E261EE5585EsyngaGgaA907907117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261GE5585GnonsyngAggGg2212110.95475117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261GE5585GnonsyngAGgGT221100.045248917017-17019
ORF1ab/nsp13261E261AE5585AnonsyngAggCg48460.95833317017-17019
ORF1ab/nsp13261E261AE5585AnonsyngAGgCA4820.041666717017-17019
ORF1ab/nsp13261E261delE5585deldelGAG---3333117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261KE5585KnonsynGagAag2727117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261VE5585VnonsyngAggTg21200.95238117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261VE5585VnonsyngAGgTT2110.04761917017-17019
ORF1ab/nsp13261E261XE5585XnonsynGagTag980.88888917017-17019
ORF1ab/nsp13261E261XE5585XnonsynGaGTaA910.11111117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261QE5585QnonsynGagCag77117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261TE5585TnonsynGAgACg77117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261NE5585NnonsynGaGAaT640.66666717017-17019
ORF1ab/nsp13261E261NE5585NnonsynGaGAaC620.33333317017-17019
ORF1ab/nsp13261E261SE5585SnonsynGAGAGT420.517017-17019
ORF1ab/nsp13261E261SE5585SnonsynGAGAGC420.517017-17019
ORF1ab/nsp13261E261YE5585YnonsynGaGTaT33117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261del1E5585del1delgAgg-g320.66666717017-17019
ORF1ab/nsp13261E261RE5585RnonsynGAGCGA320.66666717017-17019
ORF1ab/nsp13261E261RE5585RnonsynGAgAGg310.33333317017-17019
ORF1ab/nsp13261E261del1E5585del1delgaGga-310.33333317017-17019
ORF1ab/nsp13261E261HE5585HnonsynGaGCaT11117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261LE5585LnonsynGAgCTg11117017-17019
ORF1ab/nsp13261E261del2E5585del2delGAG--T11117017-17019

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7697077200All0.014721
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC23077200All0.000044
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2973629742B.1.1600.927395
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC629742B.1.1600.000187
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2774527749B.1.1.70.024838
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC427749B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT34003401AY.40.005292
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC13401AY.40.000002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22172217B.1.6210.196247
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT10591059B.1.160.160.984201
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA907907All0.000173
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT863863AY.160.327639
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT776776B.1.160.81
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT604606B.1.617.20.002274
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC2606B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT588588B.1.160.171
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT481481B.1.160.71
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT471471B.1.160.140.997881
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT444444AY.250.002671
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT404434AY.430.00179
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC30434AY.430.000133
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT410410B.1.160.260.992736
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA376376B.1.617.20.001416
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT340340B.1.160.280.994152
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT287288B.10.002629
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC1288B.10.000009
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT243243AY.46.60.017546
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT240240AY.290.003786
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT237237B.1.160.291
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT225225B.1.160.330.995575
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT224224B.1.160.240.99115
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg211221All0.00004
ORF1ab/nsp13261E261GgAGgGT10221All0.000002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT207207B.1.160.231
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT204204B.1.160.300.607143
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT202202B.1.160.151
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA193193AY.430.000855
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT189189B.1.160.320.811159
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT180181AY.260.005096
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC1181AY.260.000028
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT175175B.1.160.111
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT173173AY.30.001721
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT172172AY.440.001047
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT163163B.1.1770.002146
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT160160P.10.002521
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC138156AY.50.00285
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT18156AY.50.000372
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT156156B.1.160.121
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT151151B.1.4290.003553
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT132149B.1.20.001162
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC17149B.1.20.00015
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT139139B.1.160.220.939189
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT139139B.1.160.91
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT137137B.1.160.181
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT122122AB.11
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT122122B.1.160.310.983871
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT118118B.1.160.100.951613
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT110111B.1.10.001996
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC1111B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT107107AY.130.017225
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT105105AY.200.004081
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT103103AY.390.002545
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT9797B.1.6370.007088
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT9194AY.1020.002413
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC394AY.1020.00008
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA9292AY.440.00056
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT9090B.1.160.251
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg8888AY.40.000137
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT8282B.1.160.200.732143
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT8080P.1.160.029929
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7777B.1.3510.002289
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7777B.1.5260.00181
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7676A.2.50.037924
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT7474Q.10.009348
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT6666B.1.160.271
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT6464AY.1030.000397
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT6061AY.460.006245
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC161AY.460.000104
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT5858B.1.2210.00412
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA5252B.1.1.4671
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT4949AY.330.003272
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT4949B.1.160.211
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg4648All0.000009
ORF1ab/nsp13261E261AgAGgCA248All0
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT4040AY.1190.001412
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT3636AY.420.001448
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT3636B.1.160.131
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT3434B.1.177.440.017644
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---3333All0.000006
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT3232B.1.4270.001616
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2929B.1.4020.284314
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2929P.1.140.001386
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2828B.1.160.191
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag2727All0.000005
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2727B.1.1.390.013761
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2727B.1.1.4451
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg2525AY.1020.000663
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg2525AY.1090.018491
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA2525B.10.000229
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2424B.1.1.5190.000953
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2424B.1.258.110.009512
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2323B.1.177.810.004354
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2022AY.340.001939
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC222AY.340.000194
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA2222B.1.1.70.00002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2222B.1.5750.006675
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg2021All0.000004
ORF1ab/nsp13261E261VgAGgTT121All0
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2121B.1.5090.018182
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2020AY.470.000622
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2020B.1.110.30.014368
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT2020B.1.5740.043011
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1919B.1.1.2140.001054
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1919B.1.177.70.003132
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1717AY.270.0011
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1717AY.4.20.000369
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1717AY.610.001781
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1717P.1.20.019653
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC915AY.1200.000335
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT615AY.1200.000223
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg1515AY.30.000149
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1515AY.9.20.000551
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1414AY.1210.001894
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA1414AY.290.000221
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1414B.1.177.730.007928
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1414B.1.2430.000974
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1113AY.1180.000689
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC213AY.1180.000125
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212AY.230.000837
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212AY.560.019262
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B0.001534
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B.1.1.2220.002448
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag1212B.1.1.70.000011
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B.1.177.430.017725
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B.1.2580.000799
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1212B.1.6230.006438
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1111AY.3.10.000938
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA1111AY.460.001145
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1111AY.750.000616
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1111AY.780.016949
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1011AY.980.00079
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC111AY.980.000079
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1111P.1.60.021401
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA1010AY.1170.000845
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1010AY.4.50.001075
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1010AY.98.10.000484
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT1010B.1.1.2840.001074
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg1010B.1.617.20.000038
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99A.270.014901
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99AE.80.004401
ORF1ab/nsp13261E261XGagTag89All0.000002
ORF1ab/nsp13261E261XGaGTaA19All0
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99AY.39.10.000357
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA99AY.40.000014
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99AY.99.20.000829
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99B.1.1.280.002801
ORF1ab/nsp13261E261GgAGgGT99B.1.160.220.060811
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99B.1.360.001313
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99B.1.466.20.003521
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT99B.1.5580.041096
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT88AY.1000.000368
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA88AY.1030.00005
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---88B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp13261E261QGagCag77All0.000001
ORF1ab/nsp13261E261TGAgACg77All0.000001
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.10.00277
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.1060.002344
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.1170.000592
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg77AY.250.000042
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.34.10.00357
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.360.001037
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.60.000288
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT67AY.620.002614
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC17AY.620.000436
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.75.10.001262
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77AY.950.005327
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT77B.1.1.700.002387
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg77B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp13261E261NGaGAaT46All0.000001
ORF1ab/nsp13261E261NGaGAaC26All0
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA66AY.120.001896
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA66AY.390.000148
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66AY.450.00073
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66AY.590.003178
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66B.1.2600.020067
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66B.1.5250.000679
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT66C.360.005464
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg55AY.440.00003
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55AY.46.30.004669
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg55AY.470.000156
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA55AY.5.40.001384
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55AY.650.002665
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.1.2610.043103
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.258.170.00052
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.3690.001426
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.5490.035971
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55B.1.6090.002397
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55C.370.00058
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT55D.50.024876
ORF1ab/nsp13261E261SGAGAGT240.111111
ORF1ab/nsp13261E261NGaGAaC240.111111
ORF1ab/nsp13261E261SGAGAGC240.111111
ORF1ab/nsp13261E261NGaGAaT240.111111
ORF1ab/nsp13261E261SGAGAGT24All0
ORF1ab/nsp13261E261SGAGAGC24All0
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.120.001264
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT34AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC14AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA44AY.250.000024
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg44AY.40.000006
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.410.001176
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg44AY.440.000024
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.5.30.00135
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44AY.660.004278
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg44AY.920.001149
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.1.2730.027027
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA44B.1.1.3010.004717
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.1.3060.001754
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.1.3170.001647
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp13261E261TGAgACg44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.177.210.000306
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.177.310.045977
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA44B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.36.10.004561
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.36.310.007005
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT24B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC24B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.4730.076923
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.5330.038462
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.5950.001044
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg44B.1.5950.001044
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT44R.10.00036
ORF1ab/nsp13261E261RGAGCGA230.111111
ORF1ab/nsp13261E261RGAgAGg130.055556
ORF1ab/nsp13261E261YGaGTaT33All0.000001
ORF1ab/nsp13261E261del1gAgg-g23All0
ORF1ab/nsp13261E261RGAGCGA23All0
ORF1ab/nsp13261E261RGAgAGg13All0
ORF1ab/nsp13261E261del1gaGga-13All0
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.120.10.000963
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.180.030303
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.220.006276
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA33AY.230.000209
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg33AY.250.000018
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.350.000699
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA33AY.4.30.002525
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.5.40.00083
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.540.000286
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.570.001969
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.670.001393
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.840.001312
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag33B.10.000027
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.1.2790.003363
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.1.2910.002227
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.1.3260.005282
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA33B.1.1.3530.0625
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.177.750.003122
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.220.003953
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.351.20.000908
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.3800.019868
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.4740.005703
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.5610.001191
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33B.1.6200.002838
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33P.1.120.001452
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT33P.20.00056
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---220.111111
ORF1ab/nsp13261E261TGAgACg220.111111
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.1090.001479
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp13261E261QGagCag22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag22AY.140.000176
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.140.000176
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA22AY.200.000078
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.240.000862
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg22AY.30.00002
ORF1ab/nsp13261E261QGagCag22AY.30.00002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.320.001065
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA22AY.330.000134
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.370.000632
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg22AY.430.000009
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---22AY.430.000009
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg22AY.520.001629
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC12AY.630.000387
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT12AY.630.000387
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---22AY.670.000929
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.690.000373
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.740.000231
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg12AY.750.000056
ORF1ab/nsp13261E261AgAGgCA12AY.750.000056
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.820.002714
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.920.000575
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.940.000885
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22AY.960.004149
ORF1ab/nsp13261E261XGagTag22B.10.000018
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.1890.003026
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.2360.013793
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.4160.00181
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.460.008734
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp13261E261XGaGTaA12B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg12B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13261E261XGagTag12B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13261E261VgAGgTT12B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.1110.00235
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.177.330.003289
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.2390.002442
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.243.10.044444
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.258.100.022727
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.2760.033898
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC22B.1.30.005236
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.3670.001585
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.416.10.003125
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.4260.002018
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22B.1.438.10.000215
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT12B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC12B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22L.10.00381
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp13261E261NGaGAaT22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg110.055556
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag110.055556
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11A0.000387
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11A.20.000662
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11A.270.001656
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AF.10.037037
ORF1ab/nsp13261E261HGaGCaT11All0
ORF1ab/nsp13261E261LGAgCTg11All0
ORF1ab/nsp13261E261del2GAG--T11All0
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AP.10.001502
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp13261E261XGagTag11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.20.000356
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11AY.240.000431
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.30.00001
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.320.000532
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.360.000148
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11AY.380.000499
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11AY.40.000002
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.400.000964
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11AY.410.000294
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag11AY.430.000004
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11AY.430.000004
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11AY.440.000006
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.480.000465
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.5.10.003759
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.510.000909
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.60.000041
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC11AY.600.000938
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11AY.610.000105
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11AY.730.000665
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.740.000116
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.890.004902
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.900.000684
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.910.00073
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11AY.950.000761
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC11AY.990.001049
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11AY.990.001049
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp13261E261del2GAG--T11B0.000128
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg11B.10.000009
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11B.10.000009
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11B.10.000009
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13261E261TGAgACg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13261E261del1gAgg-g11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13261E261XGagTag11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.1.1410.002012
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.2100.005714
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.2290.005747
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.2320.001815
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.1.3040.002809
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.3230.014085
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.3760.005952
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.3850.004464
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp13261E261YGaGTaT11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13261E261QGagCag11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13261E261HGaGCaT11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1310.008772
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp13261E261YGaGTaT11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp13261E261KGagAag11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13261E261XGagTag11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13261E261YGaGTaT11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.177.200.001517
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.177.240.001295
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11B.1.177.700.005917
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp13261E261del1gaGga-11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.2120.016667
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.214.30.007143
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp13261E261QGagCag11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.2680.010417
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.3260.007576
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.36.270.000763
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.36.270.000763
ORF1ab/nsp13261E261LGAgCTg11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.36.70.004
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp13261E261AgAGgCA11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.4600.017857
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11B.1.4730.019231
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.5450.014493
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.5590.025
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaC11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.5810.009434
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.6060.006024
ORF1ab/nsp13261E261GgAGgGT11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.6120.002653
ORF1ab/nsp13261E261del1gAgg-g11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13261E261QGagCag11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13261E261VgAggTg11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13261E261XGagTag11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp13261E261AgAggCg11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.6380.052632
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.780.008547
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.1.9.50.005682
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11B.40.002208
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.400.000364
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11B.610.005747
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11C.170.055556
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11C.320.023256
ORF1ab/nsp13261E261EgaGgaA11C.360.000911
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11C.370.000116
ORF1ab/nsp13261E261XGagTag11C.80.004464
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11D.20.000075
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11L.30.003546
ORF1ab/nsp13261E261GgAggGg11P.10.000016
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11P.1.80.004785
ORF1ab/nsp13261E261DgaGgaT11Q.40.000455
ORF1ab/nsp13261E261delGAG---11Q.80.000165