CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : CodonNum = 227 & Codon = ctT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13227L227LL5551LsynctGctT2026332250.15915716915-16917

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT322520263All0.000617
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1895114B.1.617.20.000712
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT4584425B.1.1.70.00041
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT814816B.1.5610.323144
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT247533AY.40.000384
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT277363AY.430.001227
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1249AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT37240AY.440.000225
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT220220B.1.1.3480.175159
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT68191B.10.000623
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT5177AY.480.002326
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT91133AY.30.000905
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1122AY.130.000161
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22120B.1.20.000194
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT26119AY.250.000156
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT33113AY.1030.000205
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT63101B.1.2580.004192
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT999AY.4.20.000195
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT4483B.1.1770.000579
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT868AY.230.000558
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1963P.10.000299
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT756B.1.4270.000353
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT955B.1.4290.000212
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1449B.1.10.000254
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT2847AY.39.10.001109
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1341B.1.3510.000386
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT137AY.190.00114
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT137B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1033AY.50.000206
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1932AY.390.00047
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT3232N.81
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1230AY.1020.000318
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT127AY.680.000274
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1127B.1.1600.000343
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT427B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT125AY.270.000065
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT2024B.1.617.10.002579
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT823AY.1000.000368
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT323AY.5.40.00083
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT923B.1.1.5190.000357
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT920AY.1180.000564
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1720AY.360.00252
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT119AY.1160.000287
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT819AY.200.000311
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1619R.10.00144
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT118B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1717B.1.177.720.057627
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT416AY.470.000124
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT516B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1016B.1.5170.00427
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1515AY.4.10.011062
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT415AY.450.000487
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT115AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT714AY.330.000467
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT114AY.620.000436
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT513AY.260.000142
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT613AY.290.000095
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT913B.1.621.10.004552
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT312AY.750.000168
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT711AY.1170.000592
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT211AY.980.000158
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT711AY.99.20.000645
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT110AY.1210.000135
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT810AY.460.000833
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT110AY.540.000095
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1010B.1.2180.051546
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT110D.20.000075
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT79AY.420.000282
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT39B0.000383
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT49B.1.1.2140.000222
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT79B.1.360.001021
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT19B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT47AY.1190.000141
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT37AY.60.000123
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT47AY.610.000419
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT36AY.120.000948
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT46AY.340.000388
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT56AY.5.30.001687
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT66B.1.1.3050.023166
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT16B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT26B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT46P.1.150.000929
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT45AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT15AY.890.004902
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT15AY.920.000287
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT55B.1.1.1350.023474
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT55B.1.36.290.002587
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT55B.1.3750.004098
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT25B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT25C.370.000232
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT55P.1.70.001596
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT140.055556
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT24AY.116.10.000623
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14AY.370.000316
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT44AY.580.00363
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14AY.840.000437
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14AY.850.000427
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT34AY.910.002191
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14AY.940.000443
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT44B.1.177.40.000844
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT24B.1.214.30.014286
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT24B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14P.1.140.000048
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23AY.140.000176
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT33AY.650.001599
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT13AY.700.000209
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23AY.90.000135
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT33B.1.1.4170.008108
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23B.1.177.120.000303
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23B.1.5820.000981
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT33B.1.6090.001438
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23N.40.008511
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12A.10.000282
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.400.000964
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22AY.500.001599
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.530.000288
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.630.000387
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22AY.690.000373
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12B.1.1.2580.003257
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22B.1.2730.025974
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12B.30.000831
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22C.140.008658
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12P.30.001595
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AN.10.02
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.490.003195
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.420.000894
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.220.001318
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.2890.00266
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.30.002618
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.4600.017857
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.4920.007042
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.5210.004975
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.6100.003546
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.9.40.006135
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11N.100.029412
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11P.20.000187
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11P.60.003145
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11Q.80.000165