CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : CodonNum = 227

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13227L227LL5551LsynCtgTtg20263161820.79859816915-16917
ORF1ab/nsp13227L227LL5551LsynctGctT2026332250.15915716915-16917
ORF1ab/nsp13227L227LL5551LsynctGctA202638100.039974316915-16917
ORF1ab/nsp13227L227LL5551LsynctGctC20263440.0021714516915-16917
ORF1ab/nsp13227L227LL5551LsynCtGTtA2026320.000098702116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227delL5551deldelCTG---2222116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227ML5551MnonsynCtgAtg1414116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227PL5551PnonsyncTgcCg970.77777816915-16917
ORF1ab/nsp13227L227PL5551PnonsyncTGcCA910.11111116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227PL5551PnonsyncTGcCT910.11111116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227FL5551FnonsynCtGTtT44116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227QL5551QnonsyncTgcAg430.7516915-16917
ORF1ab/nsp13227L227RL5551RnonsyncTgcGg430.7516915-16917
ORF1ab/nsp13227L227QL5551QnonsyncTGcAA410.2516915-16917
ORF1ab/nsp13227L227RL5551RnonsyncTGcGA410.2516915-16917
ORF1ab/nsp13227L227SL5551SnonsynCTgTCg320.66666716915-16917
ORF1ab/nsp13227L227SL5551SnonsynCTGTCT310.33333316915-16917
ORF1ab/nsp13227L227del1L5551del1delCtg-tg22116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227VL5551VnonsynCtGGtT22116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227IL5551InonsynCtGAtT22116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227WL5551WnonsynCTgTGg11116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227XL5551XnonsynCTGTGA11116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227TL5551TnonsynCTGACT11116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227CL5551CnonsynCTGTGC11116915-16917
ORF1ab/nsp13227L227del2L5551del2delCTg--g11116915-16917

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1618220263All0.003095
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT322520263All0.000617
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA81020263All0.000155
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC4420263All0.000008
ORF1ab/nsp13227L227LCtGTtA220263All0
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg49195114B.1.617.20.018522
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1895114B.1.617.20.000712
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC55114B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp13227L227LCtGTtA15114B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg39374425B.1.1.70.003524
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT4584425B.1.1.70.00041
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA294425B.1.1.70.000026
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC14425B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg41734173AY.350.972501
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT814816B.1.5610.323144
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC2816B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA620620B.1.1.5230.96875
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg248533AY.40.000386
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT247533AY.40.000384
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA23533AY.40.000036
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC15533AY.40.000023
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg364364B.1.4710.994536
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT277363AY.430.001227
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg82363AY.430.000363
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA3363AY.430.000013
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC1363AY.430.000004
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg248249AY.16.10.116541
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1249AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg201240AY.440.001223
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT37240AY.440.000225
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC2240AY.440.000012
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT220220B.1.1.3480.175159
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg122191B.10.001117
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT68191B.10.000623
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA1191B.10.000009
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg172177AY.480.08
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT5177AY.480.002326
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT91133AY.30.000905
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg42133AY.30.000418
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg121122AY.130.019478
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1122AY.130.000161
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg97120B.1.20.000854
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22120B.1.20.000194
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC1120B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg93119AY.250.000559
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT26119AY.250.000156
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg57113AY.1030.000354
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT33113AY.1030.000205
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA23113AY.1030.000143
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT63101B.1.2580.004192
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg38101B.1.2580.002529
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg8899AY.4.20.001909
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT999AY.4.20.000195
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA299AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT4483B.1.1770.000579
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg3783B.1.1770.000487
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC283B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg7373AY.1080.080485
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg6068AY.230.004185
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT868AY.230.000558
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg4163P.10.000646
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1963P.10.000299
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA363P.10.000047
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg4956B.1.4270.002474
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT756B.1.4270.000353
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg4655B.1.4290.001082
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT955B.1.4290.000212
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg2049B.1.10.000363
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA1549B.1.10.000272
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1449B.1.10.000254
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT2847AY.39.10.001109
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1947AY.39.10.000753
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1841B.1.3510.000535
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1341B.1.3510.000386
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA1041B.1.3510.000297
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg3637AY.190.041049
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT137AY.190.00114
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA3637B.1.1280.022872
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT137B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg2333AY.50.000475
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1033AY.50.000206
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1932AY.390.00047
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1332AY.390.000321
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg3232B.1.1.2220.006528
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT3232N.81
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1730AY.1020.000451
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1230AY.1020.000318
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC130AY.1020.000027
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg2929AY.320.015442
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg2627AY.680.007117
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT127AY.680.000274
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA1327B.1.1600.000405
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1127B.1.1600.000343
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg327B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg2127B.1.5260.000494
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT427B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA227B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg2425AY.270.001553
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT125AY.270.000065
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT2024B.1.617.10.002579
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg424B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1223AY.1000.000552
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT823AY.1000.000368
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA223AY.1000.000092
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC123AY.1000.000046
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg2023AY.5.40.005534
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT323AY.5.40.00083
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1423B.1.1.5190.000556
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT923B.1.1.5190.000357
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---2222All0.000004
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg2121B.1.1.1920.048499
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1120AY.1180.000689
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT920AY.1180.000564
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1720AY.360.00252
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg320AY.360.000445
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1819AY.1160.005162
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT119AY.1160.000287
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1119AY.200.000428
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT819AY.200.000311
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1919AY.520.015472
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1619R.10.00144
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg319R.10.00027
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1718B.1.2210.001208
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT118B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1717B.1.177.720.057627
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1216AY.470.000373
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT416AY.470.000124
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1116B.1.2430.000765
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT516B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1016B.1.5170.00427
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg616B.1.5170.002562
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1515AY.4.10.011062
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1115AY.450.001339
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT415AY.450.000487
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1415AY.98.10.000678
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT115AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp13227L227MCtgAtg1414All0.000003
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT714AY.330.000467
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA514AY.330.000334
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg214AY.330.000134
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1314AY.620.005664
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT114AY.620.000436
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg813AY.260.000226
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT513AY.260.000142
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg713AY.290.00011
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT613AY.290.000095
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT913B.1.621.10.004552
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg413B.1.621.10.002023
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg912AY.750.000504
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT312AY.750.000168
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT711AY.1170.000592
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg411AY.1170.000338
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg911AY.980.000711
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT211AY.980.000158
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT711AY.99.20.000645
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg411AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1111P.1.60.021401
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg1010AY.1060.003349
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg910AY.1210.001218
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT110AY.1210.000135
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT810AY.460.000833
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg210AY.460.000208
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg910AY.540.000858
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT110AY.540.000095
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT1010B.1.2180.051546
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg810D.20.0006
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC110D.20.000075
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT110D.20.000075
ORF1ab/nsp13227L227PcTgcCg79All0.000001
ORF1ab/nsp13227L227PcTGcCT19All0
ORF1ab/nsp13227L227PcTGcCA19All0
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT79AY.420.000282
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg29AY.420.00008
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg59B0.000639
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT39B0.000383
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA19B0.000128
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg59B.1.1.2140.000277
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT49B.1.1.2140.000222
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT79B.1.360.001021
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg29B.1.360.000292
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg89B.1.5960.000697
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT19B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg88AY.240.003448
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg88AY.550.007339
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---88B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT47AY.1190.000141
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg27AY.1190.000071
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA17AY.1190.000035
ORF1ab/nsp13227L227MCtgAtg77AY.40.000011
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg47AY.60.000165
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT37AY.60.000123
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT47AY.610.000419
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg27AY.610.00021
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA17AY.610.000105
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg77AY.770.007892
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA67B.1.1310.052632
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg17B.1.1310.008772
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg36AY.120.000948
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT36AY.120.000948
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT46AY.340.000388
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg26AY.340.000194
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT56AY.5.30.001687
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg16AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg66AY.7.20.003356
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC46AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg26AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg66B.1.1.10.00196
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT66B.1.1.3050.023166
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg56B.1.258.170.00052
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT16B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg46B.1.5770.002749
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT26B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT46P.1.150.000929
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg26P.1.150.000465
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg66W.20.028986
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT45AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg15AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg45AY.890.019608
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT15AY.890.004902
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg45AY.920.001149
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT15AY.920.000287
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT55B.1.1.1350.023474
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg55B.1.2340.00066
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT55B.1.36.290.002587
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT55B.1.3750.004098
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg35B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT25B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg35C.370.000348
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT25C.370.000232
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT55P.1.70.001596
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA240.111111
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg140.055556
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT140.055556
ORF1ab/nsp13227L227FCtGTtT44All0.000001
ORF1ab/nsp13227L227QcTgcAg34All0.000001
ORF1ab/nsp13227L227RcTgcGg34All0.000001
ORF1ab/nsp13227L227QcTGcAA14All0
ORF1ab/nsp13227L227RcTGcGA14All0
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT24AY.116.10.000623
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg24AY.116.10.000623
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg44AY.1200.000149
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg44AY.300.001583
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg34AY.370.000948
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14AY.370.000316
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT44AY.580.00363
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA14AY.840.000437
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg14AY.840.000437
ORF1ab/nsp13227L227LCtGTtA14AY.840.000437
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14AY.840.000437
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA24AY.850.000854
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg14AY.850.000427
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14AY.850.000427
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg44AY.870.003331
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg44AY.880.003537
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT34AY.910.002191
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg14AY.910.00073
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC34AY.940.001328
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14AY.940.000443
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg24B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA14B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg44B.1.1.3180.001207
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg44B.1.1.3980.012903
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg44B.1.1.4160.00362
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT44B.1.177.40.000844
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg24B.1.214.30.014286
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT24B.1.214.30.014286
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg34B.1.36.170.001482
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg44B.1.466.20.001565
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT24B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA14B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg14B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg44B.1.6370.000292
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg34C.360.002732
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA14C.360.000911
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg34P.1.140.000143
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT14P.1.140.000048
ORF1ab/nsp13227L227FCtGTtT330.166667
ORF1ab/nsp13227L227QcTgcAg330.166667
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg33A.2.5.20.004717
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg33A.290.015957
ORF1ab/nsp13227L227SCTgTCg23All0
ORF1ab/nsp13227L227SCTGTCT13All0
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg23AY.1130.000285
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA13AY.1130.000142
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23AY.140.000176
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC13AY.140.000088
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT33AY.650.001599
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg23AY.700.000417
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT13AY.700.000209
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23AY.90.000135
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC13AY.90.000068
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg13B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg33B.1.1.3170.001235
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT33B.1.1.4170.008108
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23B.1.177.120.000303
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg13B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC13B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23B.1.5820.000981
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg13B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT33B.1.6090.001438
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT23N.40.008511
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg13N.40.004255
ORF1ab/nsp13227L227VCtGGtT220.111111
ORF1ab/nsp13227L227PcTGcCT120.055556
ORF1ab/nsp13227L227SCTgTCg120.055556
ORF1ab/nsp13227L227SCTGTCT120.055556
ORF1ab/nsp13227L227PcTgcCg120.055556
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12A.10.000282
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12A.10.000282
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp13227L227ICtGAtT22All0
ORF1ab/nsp13227L227del1Ctg-tg22All0
ORF1ab/nsp13227L227VCtGGtT22All0
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22AY.29.10.000441
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.400.000964
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12AY.400.000964
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22AY.410.000588
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22AY.500.001599
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12AY.530.000288
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.530.000288
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.630.000387
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12AY.630.000387
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22AY.640.00119
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22AY.690.000373
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA12AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp13227L227RcTgcGg12AY.840.000437
ORF1ab/nsp13227L227RcTGcGA12AY.840.000437
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22AY.930.000546
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.1.1.2320.00363
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12B.1.1.2580.003257
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12B.1.1.2580.003257
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.1.1.290.020619
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA12B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.1.177.510.009132
ORF1ab/nsp13227L227MCtgAtg22B.1.177.620.002384
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.1.2410.001623
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22B.1.2730.025974
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.1.3660.009756
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.1.3700.016
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.1.438.10.000215
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.1.5880.00182
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12B.30.000831
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12B.30.000831
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22B.400.000729
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22C.140.008658
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT12P.30.001595
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg12P.30.001595
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11A.50.001923
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AL.10.012987
ORF1ab/nsp13227L227del2CTg--g11All0
ORF1ab/nsp13227L227WCTgTGg11All0
ORF1ab/nsp13227L227CCTGTGC11All0
ORF1ab/nsp13227L227XCTGTGA11All0
ORF1ab/nsp13227L227TCTGACT11All0
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AN.10.02
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.100.00053
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.20.000356
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.280.00189
ORF1ab/nsp13227L227PcTgcCg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp13227L227del1Ctg-tg11AY.350.000233
ORF1ab/nsp13227L227RcTgcGg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11AY.40.000002
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp13227L227FCtGTtT11AY.430.000004
ORF1ab/nsp13227L227TCTGACT11AY.440.000006
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.490.003195
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.560.001605
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.670.000464
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11AY.670.000464
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11AY.680.000274
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.710.000475
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11AY.720.001361
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.720.001361
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.730.000665
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp13227L227PcTGcCA11AY.750.000056
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.820.001357
ORF1ab/nsp13227L227XCTGTGA11AY.840.000437
ORF1ab/nsp13227L227WCTgTGg11AY.840.000437
ORF1ab/nsp13227L227CCTGTGC11AY.850.000427
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp13227L227PcTgcCg11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.950.000761
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11AY.960.002075
ORF1ab/nsp13227L227ICtGAtT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp13227L227MCtgAtg11B.10.000009
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11B.10.000009
ORF1ab/nsp13227L227QcTGcAA11B.10.000009
ORF1ab/nsp13227L227ICtGAtT11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.1330.008475
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.3490.010309
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp13227L227PcTgcCg11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.4210.030303
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp13227L227MCtgAtg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp13227L227LctGctA11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.580.005376
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1.620.027027
ORF1ab/nsp13227L227MCtgAtg11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13227L227SCTgTCg11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13227L227del2CTg--g11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13227L227del1Ctg-tg11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.1460.004237
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.160.200.008929
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.160.250.011111
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp13227L227RcTgcGg11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.177.320.00135
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.420.000894
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp13227L227PcTgcCg11B.1.177.520.001757
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.177.650.000665
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.220.001318
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.2890.00266
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.30.002618
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp13227L227LctGctC11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.4210.007463
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp13227L227PcTgcCg11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.4600.017857
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.4740.001901
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.4920.007042
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.5210.004975
ORF1ab/nsp13227L227PcTgcCg11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.6100.003546
ORF1ab/nsp13227L227MCtgAtg11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11B.1.9.40.006135
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11C.10.002392
ORF1ab/nsp13227L227delCTG---11C.170.055556
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11N.100.029412
ORF1ab/nsp13227L227MCtgAtg11N.50.001767
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11P.20.000187
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11P.60.003145
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11Q.10.000126
ORF1ab/nsp13227L227LCtgTtg11Q.40.000455
ORF1ab/nsp13227L227LctGctT11Q.80.000165