CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : CodonNum = 210

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13210V210IV5534InonsynGttAtt569656950.99982416864-16866
ORF1ab/nsp13210V210IV5534InonsynGtTAtC569610.00017556216864-16866
ORF1ab/nsp13210V210VV5534VsyngtTgtC2561790.69921916864-16866
ORF1ab/nsp13210V210VV5534VsyngtTgtG256550.21484416864-16866
ORF1ab/nsp13210V210VV5534VsyngtTgtA256220.085937516864-16866
ORF1ab/nsp13210V210FV5534FnonsynGttTtt173173116864-16866
ORF1ab/nsp13210V210delV5534deldelGTT---5252116864-16866
ORF1ab/nsp13210V210LV5534LnonsynGttCtt25210.8416864-16866
ORF1ab/nsp13210V210LV5534LnonsynGtTCtG2520.0816864-16866
ORF1ab/nsp13210V210LV5534LnonsynGtTCtC2520.0816864-16866
ORF1ab/nsp13210V210del1V5534del1delGtt-tt16110.687516864-16866
ORF1ab/nsp13210V210del1V5534del1delgTtg-t1630.187516864-16866
ORF1ab/nsp13210V210del1V5534del1delGTt-Ct1610.062516864-16866
ORF1ab/nsp13210V210del1V5534del1delgtTgt-1610.062516864-16866
ORF1ab/nsp13210V210GV5534GnonsyngTtgGt1010116864-16866
ORF1ab/nsp13210V210AV5534AnonsyngTtgCt970.77777816864-16866
ORF1ab/nsp13210V210AV5534AnonsyngTTgCC920.22222216864-16866
ORF1ab/nsp13210V210del2V5534del2delGTt--t760.85714316864-16866
ORF1ab/nsp13210V210DV5534DnonsyngTtgAt760.85714316864-16866
ORF1ab/nsp13210V210del2V5534del2delgTTg--710.14285716864-16866
ORF1ab/nsp13210V210DV5534DnonsyngTTgAC710.14285716864-16866
ORF1ab/nsp13210V210NV5534NnonsynGTTAAC210.516864-16866
ORF1ab/nsp13210V210NV5534NnonsynGTtAAt210.516864-16866
ORF1ab/nsp13210V210TV5534TnonsynGTtACt210.516864-16866
ORF1ab/nsp13210V210TV5534TnonsynGTTACC210.516864-16866

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt56955696All0.001089
ORF1ab/nsp13210V210IGtTAtC15696All0
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt53505350AY.690.998693
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC179256All0.000034
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG55256All0.000011
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA22256All0.000004
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt173173All0.000033
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt103103AY.40.00016
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt6565AY.250.000391
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC6465B.10.000586
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA165B.10.000009
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---5252All0.00001
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC5050B.1.1.5190.001986
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt3939B.1.1.70.000035
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC1933B.1.1.70.000017
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG1333B.1.1.70.000012
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA133B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13210V210LGttCtt2125All0.000004
ORF1ab/nsp13210V210LGtTCtC225All0
ORF1ab/nsp13210V210LGtTCtG225All0
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt2424AY.260.000679
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt2424AY.440.000146
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG1724B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC424B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA324B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt2323B.1.5950.006002
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt2121B.1.1.70.000019
ORF1ab/nsp13210V210del1Gtt-tt1116All0.000002
ORF1ab/nsp13210V210del1gTtg-t316All0.000001
ORF1ab/nsp13210V210del1GTt-Ct116All0
ORF1ab/nsp13210V210del1gtTgt-116All0
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt1616AY.4.50.00172
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC1616AY.420.000644
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---1616B.1.1.70.000014
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt1515AY.40.000023
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt1414B.1.2430.000974
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG611AY.430.000027
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC411AY.430.000018
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA111AY.430.000004
ORF1ab/nsp13210V210GgTtgGt1010All0.000002
ORF1ab/nsp13210V210AgTtgCt79All0.000001
ORF1ab/nsp13210V210AgTTgCC29All0
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt99AY.430.00004
ORF1ab/nsp13210V210LGttCtt99B.1.617.20.000034
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG38B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA38B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC28B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt77A.270.011589
ORF1ab/nsp13210V210DgTtgAt67All0.000001
ORF1ab/nsp13210V210del2GTt--t67All0.000001
ORF1ab/nsp13210V210DgTTgAC17All0
ORF1ab/nsp13210V210del2gTTg--17All0
ORF1ab/nsp13210V210LGttCtt77AY.1000.000322
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt77B.1.1.2140.000388
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt66B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt66P.10.000095
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt66P.10.000095
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt55AY.330.000334
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt55B.1.2210.000355
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt55B.1.36.290.002587
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt55B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---440.222222
ORF1ab/nsp13210V210LGtTCtC240.111111
ORF1ab/nsp13210V210LGtTCtG240.111111
ORF1ab/nsp13210V210del1Gtt-tt44AY.250.000024
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA44AY.250.000024
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---44AY.40.000006
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt44AY.430.000018
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---44B.10.000037
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt44B.10.000037
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp13210V210LGttCtt44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC23AY.1030.000012
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA13AY.1030.000006
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt33AY.260.000085
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA23AY.330.000134
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG13AY.330.000067
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp13210V210GgTtgGt33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt33B.1.2100.006397
ORF1ab/nsp13210V210del1Gtt-tt23B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp13210V210del1gtTgt-13B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC23B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG13B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt33B.1.619.10.001924
ORF1ab/nsp13210V210del2GTt--t220.111111
ORF1ab/nsp13210V210TGTtACt120.055556
ORF1ab/nsp13210V210IGtTAtC120.055556
ORF1ab/nsp13210V210DgTTgAC120.055556
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt120.055556
ORF1ab/nsp13210V210AgTTgCC120.055556
ORF1ab/nsp13210V210TGTTACC120.055556
ORF1ab/nsp13210V210NGTtAAt120.055556
ORF1ab/nsp13210V210DgTtgAt120.055556
ORF1ab/nsp13210V210NGTTAAC120.055556
ORF1ab/nsp13210V210AgTtgCt120.055556
ORF1ab/nsp13210V210NGTtAAt12All0
ORF1ab/nsp13210V210NGTTAAC12All0
ORF1ab/nsp13210V210TGTtACt12All0
ORF1ab/nsp13210V210TGTTACC12All0
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt22AY.200.000078
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG12AY.40.000002
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC12AY.40.000002
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---22AY.430.000009
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG22AY.440.000012
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt22AY.440.000012
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA22AY.530.000575
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---22AY.670.000929
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp13210V210DgTtgAt22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp13210V210GgTtgGt22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA12B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC12B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp13210V210del1gTtg-t12B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13210V210del1Gtt-tt12B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13210V210GgTtgGt22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt22B.1.6190.001742
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC12C.370.000116
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG12C.370.000116
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC110.055556
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11A0.000387
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC11A.270.001656
ORF1ab/nsp13210V210DgTtgAt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp13210V210GgTtgGt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG11AY.390.000025
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp13210V210AgTtgCt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp13210V210del1Gtt-tt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp13210V210del1GTt-Ct11AY.430.000004
ORF1ab/nsp13210V210AgTTgCC11AY.440.000006
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtG11AY.450.000122
ORF1ab/nsp13210V210AgTtgCt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA11AY.480.000465
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.680.000274
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11AY.680.000274
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.720.001361
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC11AY.750.000056
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp13210V210del1Gtt-tt11AY.780.001541
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.840.000437
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC11AY.860.00083
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11AY.880.000884
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp13210V210DgTtgAt11B0.000128
ORF1ab/nsp13210V210del2gTTg--11B.10.000009
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11B.10.000009
ORF1ab/nsp13210V210LGttCtt11B.10.000009
ORF1ab/nsp13210V210GgTtgGt11B.10.000009
ORF1ab/nsp13210V210del1gTtg-t11B.10.000009
ORF1ab/nsp13210V210AgTtgCt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13210V210del2GTt--t11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13210V210del1Gtt-tt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtC11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11B.1.1.1960.005714
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11B.1.1.2850.006536
ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp13210V210FGttTtt11B.1.1.3450.043478
ORF1ab/nsp13210V210VgtTgtA11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp13210V210delGTT---11B.1.1.4200.001006
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ORF1ab/nsp13210V210IGttAtt11B.1.1.5190.00004
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