CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : CodonNum = 206

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13206G206CG5530CnonsynGgtTgt71637163116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206VG5530VnonsyngGtgTt27172717116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206GG5530GsynggTggA140612940.92034116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206GG5530GsynggTggC14061090.077524916852-16854
ORF1ab/nsp13206G206GG5530GsynggTggG140630.0021337116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206SG5530SnonsynGgtAgt240240116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206RG5530RnonsynGgtCgt219219116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206DG5530DnonsyngGtgAt2042030.99509816852-16854
ORF1ab/nsp13206G206DG5530DnonsyngGTgAC20410.0049019616852-16854
ORF1ab/nsp13206G206delG5530deldelGGT---8989116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206FG5530FnonsynGGtTTt3232116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206AG5530AnonsyngGtgCt13110.84615416852-16854
ORF1ab/nsp13206G206AG5530AnonsyngGTgCC1320.15384616852-16854
ORF1ab/nsp13206G206del1G5530del1delGgt-gt1180.72727316852-16854
ORF1ab/nsp13206G206del1G5530del1delggTgg-1120.18181816852-16854
ORF1ab/nsp13206G206del1G5530del1delGgTAg-1110.090909116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206TG5530TnonsynGGTACC320.66666716852-16854
ORF1ab/nsp13206G206TG5530TnonsynGGTACG310.33333316852-16854
ORF1ab/nsp13206G206QG5530QnonsynGGTCAG22116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206HG5530HnonsynGGTCAC22116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206PG5530PnonsynGGTCCG210.516852-16854
ORF1ab/nsp13206G206PG5530PnonsynGGTCCC210.516852-16854
ORF1ab/nsp13206G206NG5530NnonsynGGTAAC11116852-16854
ORF1ab/nsp13206G206KG5530KnonsynGGTAAG11116852-16854

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt71637163All0.00137
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt43274327B.1.617.10.558035
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt27172717All0.00052
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA12941406All0.000247
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC1091406All0.000021
ORF1ab/nsp13206G206GggTggG31406All0.000001
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11411141AY.140.100422
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt891891AY.40.001387
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt516516AY.40.000803
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt513513B.1.1.70.000459
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt240240All0.000046
ORF1ab/nsp13206G206RGgtCgt219219All0.000042
ORF1ab/nsp13206G206RGgtCgt215215B.1.1.70.000192
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt203204All0.000039
ORF1ab/nsp13206G206DgGTgAC1204All0
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt183183B.10.001676
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt167167B.1.1.70.00015
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt143143B.1.1.5280.6875
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt138138AY.4.50.014834
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt129129B.1.617.20.000486
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt124124B.1.617.20.000467
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt112112AY.4.20.002429
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---8989All0.000017
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt8787B.1.1.70.000078
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt7373AY.430.000323
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt7373B.1.1.340.960526
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt6666AY.200.002565
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt6565B.1.1280.041296
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt6363AY.430.000279
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt6363AY.440.000383
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt5858B.1.1.70.000052
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt5757B.1.1600.001778
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt5656C.350.043344
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt5555AY.30.000547
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt5555B.1.4290.001294
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt5454B.1.10.00098
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt5353AY.4.20.00115
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt5151B.1.1770.000672
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt5050B.10.000458
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt4747AY.250.000283
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt4545B.1.20.000396
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt4545P.10.000709
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt4444AY.46.40.007238
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt4343AY.40.000067
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt4242AY.1030.000261
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt4242B.1.20.00037
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt3939B.1.10.000707
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt3939B.1.1260.049745
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC3438AY.40.000053
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA338AY.40.000005
ORF1ab/nsp13206G206GggTggG138AY.40.000002
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt3838P.10.000599
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA3636B.1.4970.011331
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt3434B.1.177.210.0026
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt3333AY.390.000815
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt3333B.1.177.860.006054
ORF1ab/nsp13206G206FGGtTTt3232All0.000006
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt3232AY.290.000505
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt3030AY.1020.000795
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt2929B.1.1.260.151832
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt2828B.1.1.3821
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt2828B.1.177.810.005301
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt2727AY.250.000162
ORF1ab/nsp13206G206FGGtTTt2727B.1.617.10.003482
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt2424AY.440.000146
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt2424B.1.1770.000316
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt2424B.1.5260.000564
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA1824B.1.617.20.000068
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC624B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA2121AY.190.023945
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC1821B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA221B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp13206G206GggTggG121B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt2121B.1.2400.004527
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt2020AY.750.00112
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1919AY.1020.000504
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1919AY.290.0003
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1919AY.99.20.001751
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1818AY.330.001202
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1818AY.50.000372
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1818AY.520.014658
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---1818B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1818B.1.258.170.001871
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt1818B.1.4290.000424
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt1717AY.1030.000106
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt1717AY.250.000102
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1717B.1.2580.001131
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1616AY.1200.000595
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1616AY.910.011687
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1616B.1.3510.000476
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1515AY.1160.004302
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1515AY.260.000425
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1515AY.30.000149
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1515B.1.2430.001044
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1414B.1.1.5190.000556
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1414B.1.1.5190.000556
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1414B.1.2210.000994
ORF1ab/nsp13206G206AgGtgCt1113All0.000002
ORF1ab/nsp13206G206AgGTgCC213All0
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1313AY.1130.001851
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1313AY.390.000321
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA1113AY.440.000067
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC213AY.440.000012
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1313AY.46.60.000939
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1313AY.50.000268
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1313B.1.3510.000386
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt1212AY.120.2.10.005979
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC1112AY.430.000049
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA112AY.430.000004
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt1212AY.9.20.000441
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt1212B.1.20.000106
ORF1ab/nsp13206G206del1Ggt-gt811All0.000002
ORF1ab/nsp13206G206del1ggTgg-211All0
ORF1ab/nsp13206G206del1GgTAg-111All0
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA1111AY.540.001049
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---1111B.1.10.0002
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt1111B.1.1.5190.000437
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA1010AY.380.004993
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt99AY.1170.000761
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt99AY.260.000255
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt99AY.340.000873
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt99AY.5.40.00249
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt99B.1.1600.000281
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt88AY.1170.000676
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt88AY.420.000322
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt88AY.99.20.000737
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA78B.10.000064
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC18B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt88B.1.1.4280.075472
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt88B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt77AY.1030.000043
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt77B.1.1.2160.006233
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt77B.1.1.2650.022082
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt77B.1.1570.020896
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt77B.1.3690.001997
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt77B.1.4270.000353
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---77B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt77B.1.6180.028226
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt77P.20.001306
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt77P.20.001306
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---660.333333
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66AY.1200.000223
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt66AY.200.000233
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66AY.350.001398
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt66AY.39.10.000238
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt66AY.440.000037
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66AY.75.10.001082
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66AY.9.10.000502
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt66AY.9.20.00022
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA66AY.980.000474
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66B0.000767
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66B.1.177.430.008863
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66B.1.177.450.002287
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66B.1.4040.007812
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66B.1.4160.007614
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt66B.1.5960.000523
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt66B.1.6210.000531
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55AY.16.10.00235
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55AY.230.000349
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt55AY.250.00003
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---55AY.250.00003
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt55AY.30.00005
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt55AY.300.001979
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt55AY.430.000022
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt55AY.430.000022
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt55AY.440.00003
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55AY.460.00052
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt55AY.470.000156
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt55AY.610.000524
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55AY.680.001369
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55B0.000639
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55B.1.1.1350.023474
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55B.1.3110.001373
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55B.1.360.00073
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55B.1.36.290.002587
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55B.1.5750.001517
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt55B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt45B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp13206G206DgGTgAC15B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13206G206AgGtgCt55B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44AY.1180.000251
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt44AY.1190.000141
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA44AY.130.000644
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt44AY.260.000113
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt44AY.270.000259
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt44AY.390.000099
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt44AY.40.000006
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---44AY.40.000006
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt44AY.420.000161
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44AY.470.000124
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44AY.610.000419
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt44AY.750.000224
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44AY.90.00027
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44AY.980.000316
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---44B.10.000037
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA34B.1.10.000054
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC14B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt44B.1.1.2140.000222
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44B.1.1.2220.000816
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44B.1.2140.014652
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt44B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44B.1.36.10.004561
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44B.1.466.20.001565
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44B.1.5250.000453
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44B.400.001457
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt44D.50.0199
ORF1ab/nsp13206G206TGGTACC23All0
ORF1ab/nsp13206G206TGGTACG13All0
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33AY.1090.002219
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33AY.1110.000549
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt33AY.200.000117
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33AY.230.000209
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt33AY.290.000047
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC33AY.30.00003
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33AY.3.10.000256
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33AY.330.0002
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA23AY.390.000049
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC13AY.390.000025
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33AY.4.30.002525
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33AY.450.000365
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt33AY.470.000093
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33AY.60.000123
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC33AY.60.000123
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt33AY.610.000314
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33AY.940.001328
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33AY.990.003148
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.1.250.001706
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.1.3260.005282
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.1.3560.025641
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.1.4340.001046
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.1.500.002037
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.1470.002268
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA23B.1.20.000018
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC13B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt33B.1.2320.001612
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt33B.1.2820.044776
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt33B.1.36.290.001552
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.4160.003807
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.4170.085714
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.5510.003871
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33B.1.6230.001609
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt33C.36.30.001702
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33D.20.000225
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33P.1.20.003468
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt33R.10.00027
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt220.111111
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22A0.000774
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22A.110.117647
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22A.2.5.20.003145
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22A.210.00554
ORF1ab/nsp13206G206HGGTCAC22All0
ORF1ab/nsp13206G206QGGTCAG22All0
ORF1ab/nsp13206G206PGGTCCC12All0
ORF1ab/nsp13206G206PGGTCCG12All0
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC22AY.250.000012
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22AY.270.000129
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22AY.340.000194
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---22AY.420.00008
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---22AY.430.000009
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22AY.480.00093
ORF1ab/nsp13206G206RGgtCgt22AY.60.000082
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22AY.600.001876
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---22AY.670.000929
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC22AY.680.000547
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22AY.7.10.000225
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22AY.880.001768
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22AY.90.000135
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp13206G206FGGtTTt22B.10.000018
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt22B.10.000018
ORF1ab/nsp13206G206PGGTCCG12B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206PGGTCCC12B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206TGGTACC12B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206TGGTACG12B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22B.1.1.2190.01
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22B.1.1.460.008734
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22B.1.1.4860.003155
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp13206G206AgGtgCt22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.1270.004396
ORF1ab/nsp13206G206AgGtgCt22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.177.330.003289
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22B.1.3190.006098
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt22B.1.36.180.00084
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.3910.002255
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.4530.006472
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22B.1.4800.004975
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp13206G206del1Ggt-gt22B.1.5640.000852
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22B.1.6050.011905
ORF1ab/nsp13206G206del1Ggt-gt12B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13206G206del1GgTAg-12B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC22B.6.60.001778
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22C.160.002121
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22L.30.007092
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt22P.10.000032
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22P.1.100.000539
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt22R.10.00018
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11A.20.000662
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11A.2.5.10.004808
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11A.30.002096
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11A.50.001923
ORF1ab/nsp13206G206KGGTAAG11All0
ORF1ab/nsp13206G206NGGTAAC11All0
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.110.001339
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.190.00114
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.230.00007
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.240.000431
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.260.000028
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.330.000067
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.380.000499
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.380.000499
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp13206G206RGgtCgt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.4.10.000737
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp13206G206FGGtTTt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.400.000964
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.400.000964
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.410.000294
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.420.00004
ORF1ab/nsp13206G206AgGTgCC11AY.430.000004
ORF1ab/nsp13206G206FGGtTTt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.440.000006
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.450.000122
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11AY.460.000104
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.470.000031
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.510.000909
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.550.000917
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.610.000105
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.620.000436
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.620.000436
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.620.000436
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.630.000387
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.680.000274
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.690.000187
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11AY.70.000196
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.720.001361
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.730.000665
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.730.000665
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.740.000116
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.740.000116
ORF1ab/nsp13206G206FGGtTTt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp13206G206del1ggTgg-11AY.750.000056
ORF1ab/nsp13206G206QGGTCAG11AY.750.000056
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.770.001127
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.780.001541
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.780.001541
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.780.001541
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.790.001211
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.80.000606
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11AY.850.000427
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.860.00083
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11AY.860.00083
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp13206G206del1Ggt-gt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.910.00073
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11AY.990.001049
ORF1ab/nsp13206G206AgGTgCC11AY.990.001049
ORF1ab/nsp13206G206NGGTAAC11B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206del1Ggt-gt11B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206QGGTCAG11B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206HGGTCAC11B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206KGGTAAG11B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11B.10.000009
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13206G206AgGtgCt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13206G206del1Ggt-gt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.1630.007634
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.1740.003378
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.2630.001558
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.1.2850.006536
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.3670.055556
ORF1ab/nsp13206G206del1ggTgg-11B.1.1.4020.011111
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp13206G206GggTggG11B.1.1.470.005348
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.5230.001563
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.540.003021
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp13206G206HGGTCAC11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1040.00369
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.1530.018868
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11B.1.160.140.002119
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11B.1.160.280.002924
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11B.1.160.80.001289
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.177.360.016129
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.177.500.004695
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.1810.019608
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11B.1.1990.004132
ORF1ab/nsp13206G206del1Ggt-gt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp13206G206del1Ggt-gt11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.2190.009434
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.220.001318
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.2330.014085
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.2450.03125
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.3190.003049
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.3380.008621
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.3500.002933
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.4020.009804
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.4250.002994
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.4260.001009
ORF1ab/nsp13206G206TGGTACC11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.4350.011364
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.4390.005917
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11B.1.4530.003236
ORF1ab/nsp13206G206RGgtCgt11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp13206G206GggTggA11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.4650.003802
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11B.1.5200.021739
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.5370.02
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.596.10.009346
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11B.1.90.006173
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11B.4.50.011905
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11B.400.000364
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11C.170.055556
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11C.370.000116
ORF1ab/nsp13206G206AgGtgCt11D.20.000075
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11D.20.000075
ORF1ab/nsp13206G206SGgtAgt11P.10.000016
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp13206G206GggTggC11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp13206G206VgGtgTt11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11Q.10.000126
ORF1ab/nsp13206G206DgGtgAt11Q.10.000126
ORF1ab/nsp13206G206delGGT---11Q.20.000613
ORF1ab/nsp13206G206CGgtTgt11Q.30.000145