CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : CodonNum = 169 & Codon = gGt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13169V169GV5493GnonsyngTtgGt16161616116741-16743

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt16161616All0.000309
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt14921492AY.420.060023
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt5959B.1.1600.00184
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt3030B.1.1.2140.001664
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt1111B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt220.111111
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt22AY.40.000003
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt22AY.440.000012
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt22B.1.1.1090.08
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp13169V169GgTtgGt11B.1.619.10.000641