CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp13 : CodonNum = 149

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp13149Y149YY5473YsyntaTtaC819819116681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149delY5473deldelTAT---108108116681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149CY5473CnonsyntAttGt60580.96666716681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149CY5473CnonsyntATtGC6020.033333316681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149HY5473HnonsynTatCat47450.95744716681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149HY5473HnonsynTaTCaC4720.042553216681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149FY5473FnonsyntAttTt38370.97368416681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149FY5473FnonsyntATtTC3810.026315816681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149DY5473DnonsynTatGat970.77777816681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149DY5473DnonsynTaTGaC920.22222216681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149EY5473EnonsynTaTGaA55116681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149XY5473XnonsyntaTtaA44116681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149QY5473QnonsynTaTCaA33116681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149NY5473NnonsynTatAat33116681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149del2Y5473del2delTAT--N310.33333316681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149del2Y5473del2deltATt--310.33333316681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149del2Y5473del2delTAt--t310.33333316681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149KY5473KnonsynTaTAaA22116681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149del1Y5473del1deltaTta-11116681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149IY5473InonsynTAtATt11116681-16683
ORF1ab/nsp13149Y149SY5473SnonsyntAttCt11116681-16683

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC819819All0.000157
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC422422B.1.1.70.000378
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC281281AY.40.000437
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---108108All0.000021
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---6464B.1.1.70.000057
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt5860All0.000011
ORF1ab/nsp13149Y149CtATtGC260All0
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat4547All0.000009
ORF1ab/nsp13149Y149HTaTCaC247All0
ORF1ab/nsp13149Y149FtAttTt3738All0.000007
ORF1ab/nsp13149Y149FtATtTC138All0
ORF1ab/nsp13149Y149FtAttTt3030AM.31
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat2929AY.450.003529
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt1919B.1.1.70.000017
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC1818AY.1130.002563
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC1717B.10.000156
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC1717B.1.20.00015
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---1515B.1.1770.000198
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC1414B.1.617.20.000053
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp13149Y149DTatGat79All0.000001
ORF1ab/nsp13149Y149DTaTGaC29All0
ORF1ab/nsp13149Y149DTatGat570.277778
ORF1ab/nsp13149Y149DTaTGaC270.111111
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC77B.1.2210.000497
ORF1ab/nsp13149Y149ETaTGaA550.277778
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat350.166667
ORF1ab/nsp13149Y149HTaTCaC250.111111
ORF1ab/nsp13149Y149ETaTGaA55All0.000001
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt55B.1.2360.010267
ORF1ab/nsp13149Y149XtaTtaA440.222222
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---44AD.20.000876
ORF1ab/nsp13149Y149XtaTtaA44All0.000001
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp13149Y149QTaTCaA330.166667
ORF1ab/nsp13149Y149NTatAat33All0.000001
ORF1ab/nsp13149Y149QTaTCaA33All0.000001
ORF1ab/nsp13149Y149del2TAt--t13All0
ORF1ab/nsp13149Y149del2TAT--N13All0
ORF1ab/nsp13149Y149del2tATt--13All0
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC33AY.30.00003
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt33AY.40.000005
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt33B.10.000027
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC33P.10.000047
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC220.111111
ORF1ab/nsp13149Y149CtATtGC220.111111
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---220.111111
ORF1ab/nsp13149Y149KTaTAaA22All0
ORF1ab/nsp13149Y149FtAttTt22AM.40.007143
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC22AY.250.000012
ORF1ab/nsp13149Y149FtAttTt22AY.40.000003
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC22AY.440.000012
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC22AY.750.000112
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---22B.10.000018
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat22B.10.000018
ORF1ab/nsp13149Y149KTaTAaA22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---22B.1.1.3150.016949
ORF1ab/nsp13149Y149FtAttTt22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp13149Y149FtATtTC12P.10.000016
ORF1ab/nsp13149Y149FtAttTt12P.10.000016
ORF1ab/nsp13149Y149DTatGat11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp13149Y149del1taTta-11All0
ORF1ab/nsp13149Y149ITAtATt11All0
ORF1ab/nsp13149Y149StAttCt11All0
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11AY.200.000039
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11AY.240.000431
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11AY.270.000065
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat11AY.30.00001
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11AY.40.000002
ORF1ab/nsp13149Y149DTatGat11AY.420.00004
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11AY.430.000004
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp13149Y149NTatAat11AY.590.00053
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11AY.610.000105
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11AY.920.000287
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp13149Y149del2TAT--N11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp13149Y149del2TAt--t11B.10.000009
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11B.1.1.2510.007937
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11B.1.1.2970.002237
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp13149Y149NTatAat11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13149Y149del2tATt--11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.160.170.001701
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat11B.1.2220.001692
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.2420.018868
ORF1ab/nsp13149Y149ITAtATt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp13149Y149NTatAat11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp13149Y149StAttCt11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp13149Y149del1taTta-11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp13149Y149YtaTtaC11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11B.1.6330.041667
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11B.30.000831
ORF1ab/nsp13149Y149HTatCat11B.60.00091
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11L.10.001905
ORF1ab/nsp13149Y149CtAttGt11P.10.000016
ORF1ab/nsp13149Y149delTAT---11Q.10.000126