CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp12 : Mut = V257V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp12257V257VV4649VsyngtTgtC3242430.7514209-14211
ORF1ab/nsp12257V257VV4649VsyngtTgtA324450.13888914209-14211
ORF1ab/nsp12257V257VV4649VsyngtTgtG324360.11111114209-14211

Details of the mutation V257V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC243324All0.000046
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA45324All0.000009
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG36324All0.000007
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC6797B.1.1.70.00006
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA2797B.1.1.70.000024
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG397B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC7878P.1.170.012617
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC1726AY.40.000026
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG826AY.40.000012
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA126AY.40.000002
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG1111AY.230.000767
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC89B.1.20.00007
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA19B.1.20.000009
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC57AY.30.00005
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG27AY.30.00002
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC67B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG17B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC66A.270.009934
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG66B.1.1.3480.004777
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC66Q.10.000758
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA45B.1.3510.000119
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC15B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA24AY.430.000009
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC14AY.430.000004
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG14AY.430.000004
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC44B.340.054795
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC44P.10.000063
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA23AY.1030.000012
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC13AY.1030.000006
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC33AZ.30.004559
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC13B.10.000009
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG13B.10.000009
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA13B.10.000009
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC22AY.250.000012
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA22AY.320.001065
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC22B.1.5680.002222
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA22C.370.000232
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC110.055556
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11A0.000387
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11AY.370.000316
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11AY.390.000025
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG11AY.440.000006
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11AY.470.000031
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA11AY.610.000105
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11AY.90.000068
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11AY.920.000287
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG11B0.000128
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11B.1.1.5230.001563
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtG11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11B.390.002331
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtA11D.20.000075
ORF1ab/nsp12257V257VgtTgtC11P.1.100.000269