CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | M4855I | nonsyn | atG | atT | 12651 | 12344 | 0.975733 | 14827-14829 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | M4855I | nonsyn | atG | atA | 12651 | 154 | 0.012173 | 14827-14829 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | M4855I | nonsyn | atG | atC | 12651 | 153 | 0.0120939 | 14827-14829 |
Details of the mutation M463I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 12344 | 12651 | All | 0.002361 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 154 | 12651 | All | 0.000029 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 153 | 12651 | All | 0.000029 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 8129 | 8170 | AY.4 | 0.012652 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 31 | 8170 | AY.4 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 10 | 8170 | AY.4 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 432 | 450 | B.1.617.2 | 0.001627 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 12 | 450 | B.1.617.2 | 0.000045 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 6 | 450 | B.1.617.2 | 0.000023 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 378 | 420 | B.1.1.7 | 0.000338 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 38 | 420 | B.1.1.7 | 0.000034 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 4 | 420 | B.1.1.7 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 414 | 415 | AY.103 | 0.002571 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 415 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 394 | 411 | B.1.2 | 0.003469 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 16 | 411 | B.1.2 | 0.000141 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 411 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 231 | 241 | AY.43 | 0.001023 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 10 | 241 | AY.43 | 0.000044 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 221 | 226 | P.1 | 0.003482 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 4 | 226 | P.1 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 226 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 169 | 173 | B.1 | 0.001548 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 3 | 173 | B.1 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 173 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 146 | 155 | AY.44 | 0.000889 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 9 | 155 | AY.44 | 0.000055 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 143 | 152 | AY.25 | 0.00086 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 9 | 152 | AY.25 | 0.000054 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 150 | 150 | B.1.606 | 0.903614 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 66 | 97 | AY.46.6 | 0.004766 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 31 | 97 | AY.46.6 | 0.002238 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 92 | 93 | AY.29 | 0.001451 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 93 | AY.29 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 73 | 77 | AY.5 | 0.001507 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 4 | 77 | AY.5 | 0.000083 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 58 | 58 | B.1.1 | 0.001052 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 55 | 55 | AY.74 | 0.006361 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 53 | 54 | AY.42 | 0.002132 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 54 | AY.42 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 50 | 50 | P.1.7 | 0.015964 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 40 | 44 | AY.39 | 0.000988 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 2 | 44 | AY.39 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 2 | 44 | AY.39 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 42 | 43 | AY.102 | 0.001114 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 43 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 39 | 39 | AY.9 | 0.002636 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 38 | 38 | AY.98 | 0.003002 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 36 | 36 | AY.109 | 0.026627 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 34 | 34 | B.1.429 | 0.0008 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 31 | 31 | AY.98.1 | 0.001501 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 31 | 31 | B.1.596 | 0.002701 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 28 | 29 | B.1.177 | 0.000369 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 29 | B.1.177 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 26 | 26 | AY.20 | 0.00101 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 20 | 26 | AY.3 | 0.000199 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 6 | 26 | AY.3 | 0.00006 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 23 | 23 | AY.120 | 0.000855 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 23 | 23 | B.1.592 | 0.92 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 22 | 22 | B.1.160 | 0.000686 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 21 | 21 | B.1.36.38 | 0.034483 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 19 | 20 | B.1.369 | 0.005419 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 20 | B.1.369 | 0.000285 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 19 | 19 | B.1.595 | 0.004958 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 17 | 17 | B.1.351 | 0.000505 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 16 | 16 | AY.4.5 | 0.00172 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 15 | 15 | AY.117 | 0.001268 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 15 | 15 | AY.33 | 0.001002 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 9 | 14 | AY.47 | 0.00028 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 4 | 14 | AY.47 | 0.000124 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 14 | AY.47 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 14 | 14 | AY.99.2 | 0.00129 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 10 | 14 | B.1.621 | 0.000885 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 4 | 14 | B.1.621 | 0.000354 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 13 | 13 | AY.106 | 0.004354 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 12 | 13 | AY.119 | 0.000424 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 13 | AY.119 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 13 | 13 | AY.46 | 0.001353 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 13 | 13 | B.1.177.16 | 0.008638 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 11 | 13 | B.1.526 | 0.000259 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 2 | 13 | B.1.526 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 12 | 13 | P.1.14 | 0.000574 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 13 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 12 | 12 | AY.41 | 0.003527 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 11 | 11 | AY.61 | 0.001153 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 11 | 11 | B.1.1.70 | 0.003752 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 10 | 10 | AY.16 | 0.003797 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 10 | 10 | AY.46.4 | 0.001645 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 9 | 10 | AY.75 | 0.000504 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 10 | AY.75 | 0.000056 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 10 | 10 | B.1.1.311 | 0.003582 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 8 | 9 | AY.26 | 0.000226 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 9 | AY.26 | 0.000028 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 9 | 9 | AY.4.2 | 0.000195 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 9 | 9 | B.1.1.318 | 0.002716 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 9 | 9 | B.1.221 | 0.000639 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 8 | 8 | AY.6 | 0.000329 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 6 | 8 | B | 0.000767 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 2 | 8 | B | 0.000256 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 8 | 8 | B.1.1.170 | 0.009975 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 4 | 8 | B.1.1.519 | 0.000159 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 8 | B.1.1.519 | 0.000119 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 8 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 7 | 8 | B.1.36 | 0.001021 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 8 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 6 | 7 | AY.113 | 0.000854 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 7 | AY.113 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 7 | 7 | AY.121 | 0.000947 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 7 | 7 | AY.65 | 0.003731 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 7 | 7 | AY.94 | 0.003099 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.1.25 | 0.00398 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.240 | 0.001509 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 7 | B.1.525 | 0.000566 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 2 | 7 | B.1.525 | 0.000226 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 7 | 7 | Q.3 | 0.001015 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 6 | 6 | AY.4.4 | 0.002455 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 6 | 6 | B.1.637 | 0.000438 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 5 | AY.110 | 0.000563 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 5 | AY.118 | 0.000313 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 5 | AY.27 | 0.000324 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.234 | 0.00066 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.243 | 0.000348 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.561 | 0.001985 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 5 | B.1.617.1 | 0.000645 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 5 | C.35 | 0.00387 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 5 | 5 | P.1.15 | 0.001162 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 4 | 4 | AY.12 | 0.001264 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 4 | 4 | AY.14 | 0.000352 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 4 | 4 | AY.35 | 0.000932 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 4 | AY.54 | 0.000286 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 4 | AY.54 | 0.000095 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 4 | 4 | AY.75.1 | 0.000721 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 4 | 4 | AY.9.1 | 0.000335 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 4 | AY.92 | 0.000862 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 4 | AY.92 | 0.000287 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.1.63 | 0.001543 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 4 | 4 | B.1.177.73 | 0.002265 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 2 | 4 | B.1.258 | 0.000133 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 4 | B.1.258 | 0.000133 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 4 | 4 | P.2 | 0.000747 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | A | 0.001161 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.100 | 0.000138 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.107 | 0.001398 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.116 | 0.00086 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 3 | AY.32 | 0.001065 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 3 | AY.32 | 0.000532 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.39.1 | 0.000119 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.45 | 0.000365 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.48 | 0.001395 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.53 | 0.000863 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.55 | 0.002752 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.7.1 | 0.000338 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.84 | 0.001312 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | AY.85 | 0.001282 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 3 | AY.9.2 | 0.000073 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 3 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.214 | 0.000166 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 3 | B.1.1.28 | 0.000622 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 3 | B.1.1.28 | 0.000311 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.305 | 0.011583 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.39 | 0.001529 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.177.4 | 0.000633 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.427 | 0.000151 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.564 | 0.001278 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 3 | 3 | B.1.587 | 0.005693 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | C.36 | 0.002732 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 3 | 3 | C.37 | 0.000348 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 3 | D.2 | 0.00015 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 3 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 3 | P.1.12 | 0.000968 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 3 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | A.2.5 | 0.000998 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | A.30 | 0.285714 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | AY.29.1 | 0.000441 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | AY.3.1 | 0.000171 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 2 | AY.30 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 2 | AY.30 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | AY.46.1 | 0.002053 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | AY.5.4 | 0.000553 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | AY.59 | 0.001059 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | AY.68 | 0.000547 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | AY.70 | 0.000417 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | AY.97 | 0.003401 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | AZ.2 | 0.001642 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.1 | 0.000653 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.222 | 0.000408 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.306 | 0.000877 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.61 | 0.017544 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.111 | 0.00235 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.147 | 0.001512 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.177.34 | 0.105263 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.210 | 0.004264 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.239 | 0.002442 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.241 | 0.001623 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 2 | 2 | B.1.582 | 0.000981 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.619.1 | 0.001283 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.623 | 0.001073 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 2 | 2 | B.6 | 0.00182 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | A.27 | 0.001656 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 1 | AY.10 | 0.00053 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.111 | 0.000183 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.120.1 | 0.000321 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.16.1 | 0.00047 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.23.1 | 0.000417 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.24 | 0.000431 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.34 | 0.000097 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.34.1 | 0.00051 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.4.3 | 0.000842 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.40 | 0.000964 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.77 | 0.001127 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.88 | 0.000884 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.91.1 | 0.004065 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.93 | 0.000273 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | AY.95 | 0.000761 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.190 | 0.05 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.241 | 0.00207 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.263 | 0.001558 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.317 | 0.000412 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.369 | 0.000446 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.372 | 0.000689 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.464 | 0.001473 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.481 | 0.071429 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.50 | 0.000679 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.31 | 0.011494 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.32 | 0.00135 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.57 | 0.000281 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.8 | 0.000752 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.179 | 0.003759 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.206 | 0.000816 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.218 | 0.005155 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.225 | 0.015385 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.233 | 0.014085 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.258.17 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.311 | 0.000275 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.324 | 0.001605 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.36.18 | 0.00042 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.36.7 | 0.004 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.371 | 0.001122 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.382 | 0.008929 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.395 | 0.007042 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.397 | 0.004854 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.406 | 0.006061 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.428 | 0.00102 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.453 | 0.003236 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.466.2 | 0.000391 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.470 | 0.001404 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.495 | 0.009091 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.499 | 0.00105 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.517 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.565 | 0.00081 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.575 | 0.000303 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.575.1 | 0.002439 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.576 | 0.000907 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.605 | 0.005952 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.626 | 0.005714 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.627 | 0.00202 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.628 | 0.000352 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atC | 1 | 1 | B.1.9 | 0.006173 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | C.1 | 0.002392 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | C.32 | 0.023256 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | C.36.3 | 0.000567 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | D.5 | 0.004975 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atA | 1 | 1 | N.5 | 0.001767 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | P.1.17 | 0.000162 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | P.1.2 | 0.001156 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | Q.1 | 0.000126 |
ORF1ab/nsp12 | 463 | M463I | atG | atT | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
![]() |
![]() |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
|