CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp12 : Mut = L758L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp12758L758LL5150LsynctCctT430941900.97238315712-15714
ORF1ab/nsp12758L758LL5150LsynctCctA43091060.024599715712-15714
ORF1ab/nsp12758L758LL5150LsynctCctG4309130.0030169415712-15714

Details of the mutation L758L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT41904309All0.000801
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA1064309All0.00002
ORF1ab/nsp12758L758LctCctG134309All0.000002
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT727750B.1.1.70.000651
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA23750B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT499513AY.40.000777
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA12513AY.40.000019
ORF1ab/nsp12758L758LctCctG2513AY.40.000003
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT508508P.1.60.988327
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT190195B.1.617.20.000715
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA5195B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT170178B.1.20.001497
ORF1ab/nsp12758L758LctCctG8178B.1.20.00007
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT174174AY.4.20.003774
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT146148AY.440.000889
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA2148AY.440.000012
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT127131AY.1030.000789
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA4131AY.1030.000025
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT109125AY.430.000483
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA16125AY.430.000071
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT8793B.10.000797
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA593B.10.000046
ORF1ab/nsp12758L758LctCctG193B.10.000009
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT8989AY.1210.012043
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT7979AY.230.00551
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT7477P.10.001166
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA377P.10.000047
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT7171B.1.177.730.040204
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT6262B.1.3510.001843
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT4747AY.30.000467
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT3739AY.1020.000981
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA139AY.1020.000027
ORF1ab/nsp12758L758LctCctG139AY.1020.000027
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT3737AY.270.002395
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT3434AY.260.000963
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT3333AY.330.002204
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT2929B.1.1770.000382
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT2828B.1.2580.001863
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT2525B.1.1.3740.059382
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT2323AY.1190.000812
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT2323AY.20.008191
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT2122AY.250.000126
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA122AY.250.000006
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT2222B.1.4530.071197
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT2121D.20.001576
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1519B.1.10.000272
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA419B.1.10.000073
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1818B.1.1.370.003472
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1818B.1.5260.000423
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1718B.1.5960.001481
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA118B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1717R.10.00153
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1616AY.290.000252
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1616B.1.4270.000808
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1616B.1.5250.001811
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT915AY.200.00035
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA615AY.200.000233
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1515B.1.5750.004551
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1414B.1.214.30.1
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1414B.1.360.002043
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1313AY.1200.000483
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1212B.1.5640.005111
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1011AY.390.000247
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA111AY.390.000025
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1010AY.60.000411
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1010B.1.1.3690.004462
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1010B.1.2430.000696
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT1010B.1.4290.000235
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT810C.370.000929
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA210C.370.000232
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT99AE.80.004401
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT99AY.550.008257
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT89B.1.177.810.001515
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA19B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT99B.1.221.40.0375
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT99B.1.3110.002471
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT99Q.80.001484
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT88AY.1090.005917
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT88AY.1180.000501
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT78AY.140.000616
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA18AY.140.000088
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT88AY.90.000541
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT88B.1.2180.041237
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT570.277778
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA270.111111
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT77AY.450.000852
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT77AY.750.000392
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT77B.1.1.10.002287
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT77B.1.4090.005469
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT77B.1.4560.022876
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT77B.1.6280.002467
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT66AY.840.002625
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT66B0.000767
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT55AY.110.006693
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT45AY.1170.000338
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA15AY.1170.000085
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT45AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA15AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT55AY.420.000201
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT55AY.470.000156
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT55B.1.1.1760.002197
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT55B.1.2210.000355
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT55B.1.5170.002135
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT44AY.29.10.000882
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT34AY.360.000445
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA14AY.360.000148
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT34AY.540.000286
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA14AY.540.000095
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT44B.1.1.2140.000222
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT44B.1.1.2220.000816
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT44B.1.1.250.002274
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT34B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA14B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT44B.1.258.170.000416
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT44B.1.5030.00995
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT23AY.1130.000285
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA13AY.1130.000142
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33AY.240.001293
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33AY.460.000312
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33AY.780.004622
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT23AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA13AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33AY.910.002191
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33AY.930.000819
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33AY.99.10.004658
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33B.1.1.390.001529
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33B.1.1.700.001023
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33B.1.4040.003906
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33C.110.031915
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33C.340.111111
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33P.1.170.000485
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT33Q.10.000379
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.120.000632
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.340.000194
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.46.20.001271
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.50.000041
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.650.001066
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22AY.7.10.000225
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT12AY.850.000427
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA12AY.850.000427
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA12AY.980.000079
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT12AY.980.000079
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.1410.004024
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.2070.002364
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.2840.000215
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.3160.00185
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.4170.005405
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1.4610.024096
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.1460.008475
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.177.720.00678
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.2390.002442
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.3960.001411
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.4650.007605
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.4660.046512
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22P.1.110.020408
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22P.1.160.000748
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22P.20.000373
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT22V.20.064516
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11A0.000387
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11A.10.000282
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11A.20.000662
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11A.270.001656
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AE.70.083333
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.160.00038
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA11AY.300.000396
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.370.000316
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.490.003195
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.600.000938
ORF1ab/nsp12758L758LctCctG11AY.610.000105
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.660.00107
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.720.001361
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA11AY.80.000606
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11AY.830.001724
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.2410.00207
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.2800.003086
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.2880.001916
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA11B.1.1.3040.002809
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.3700.012658
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.4040.015873
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.330.001645
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.500.004695
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.510.004566
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.800.001912
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.230.006061
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.3200.001245
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.3560.001727
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.36.350.002604
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.3800.006623
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.575.10.002439
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp12758L758LctCctA11B.1.9.40.006135
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11B.200.023256
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11C.36.3.10.002717
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11N.90.005952
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp12758L758LctCctT11P.50.013699