CoV-GLUE Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp12 : Mut = K91R

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORF	CodonNum	Mut	ORF1abMut	MutType	RefCodon	MutCodon	AACount	CodonCount	CodonProp	Genome Position
ORF1ab/nsp12	91	K91R	K4483R	nonsyn	aAg	aGg	13853	13851	0.999856	13711-13713
ORF1ab/nsp12	91	K91R	K4483R	nonsyn	aAG	aGA	13853	2	0.000144373	13711-13713

Details of the mutation K91R within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORF	CodonNum	Mut	RefCodon	MutCodon	CodonCount	AACount	Lineage	LineageCodonProp
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	13851	13853	All	0.002649
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAG	aGA	2	13853	All	0
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2876	2876	B.1.617.2	0.010829
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2781	2781	AY.41	0.81746
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1459	1459	AY.103	0.009059
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1237	1237	B.1.1.7	0.001107
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	481	481	AY.4	0.000749
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	460	460	AY.44	0.0028
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	404	404	B.1.625	0.950588
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	370	370	AY.42	0.014885
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	356	356	B.1.177	0.004688
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	204	204	AY.3	0.002029
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	186	186	AY.33	0.012421
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	170	170	P.1	0.002678
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	136	136	AY.25	0.000818
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	133	133	AY.43	0.000589
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	126	126	AY.6	0.005182
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	124	124	B.1.2	0.001092
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	110	110	AY.102	0.002917
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	106	106	B.1	0.000971
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	93	93	B.1.1.214	0.005157
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	81	81	B.1.258.17	0.008422
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	75	75	AY.118	0.004699
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	67	67	B.1.1	0.001215
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	66	66	B.1.1.189	0.099849
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	63	63	B.1.429	0.001482
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	61	61	B.1.526	0.001434
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	57	57	B.1.1.222	0.011628
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	53	53	AY.9	0.003583
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	52	52	AY.26	0.001472
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	48	48	AY.39	0.001186
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	48	48	B.1.1.519	0.001906
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	46	46	AY.29	0.000726
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	46	46	AY.47	0.001431
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	42	42	AY.120	0.001562
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	41	41	C.37	0.004759
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	34	34	AY.98	0.002686
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	34	34	K.1	0.809524
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	33	33	AY.119	0.001165
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	33	33	B.1.240.2	1
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	28	28	AY.5	0.000578
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	28	28	AY.57	0.018373
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	27	27	B.1.351	0.000803
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	25	25	AY.46.6	0.001805
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	23	23	B.1.1.258	0.074919
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	22	22	B.1.596	0.001917
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	21	21	AY.98.1	0.001017
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	20	20	AY.13	0.00322
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	20	20	B.1.258	0.001331
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	19	19	AY.46.4	0.003126
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	18	18	AY.37	0.005689
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	17	17	B.1.466.2	0.006651
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	16	16	AY.61	0.001676
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	16	16	B.1.177.36	0.258065
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	16	16	B.1.177.60	0.003495
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	15	15	AY.20	0.000583
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	15	15	AY.45	0.001825
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	14	14	AY.116	0.004015
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	13	13	AY.4.2	0.000282
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	13	13	B.1.1.33	0.005471
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	13	13	B.1.177.8	0.009782
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	12	12	AY.100	0.000552
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	12	12	AY.121	0.001624
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	12	12	B.1.177.4	0.002533
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	12	12	B.1.36.1	0.013683
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	12	12	B.1.637	0.000877
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	11	11	AY.23	0.000767
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	11	11	AY.39.1	0.000436
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	11	11	AY.46	0.001145
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	11	11	B.1.438.1	0.00118
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	11	11	Q.1	0.00139
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	10	10	B.1.1.434	0.003486
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	10	10	B.1.128	0.006353
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	10	10	B.1.243	0.000696
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	10	10	C.36.3	0.005672
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	9	9	B.1.1.525	0.04918
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	9	9	B.1.36	0.001313
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	9	9	B.1.617.1	0.001161
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	9	9	N.5	0.015901
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	8	8	AY.111	0.001465
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	8	8	AY.27	0.000518
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	8	8	B.1.619	0.006969
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	7	7	AY.12	0.002212
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	7	7	AY.2	0.002493
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	7	7	AY.5.3	0.002362
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	7	7	AY.9.2	0.000257
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	7	7	AY.99.2	0.000645
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	7	7	B.1.1.63	0.002701
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	7	7	B.1.525	0.000792
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	6	6	AY.117	0.000507
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	6	6	AY.46.3	0.005602
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	6	6	B.1.177.85	0.032609
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	6	6	B.1.311	0.001647
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	6	6	B.1.628	0.002114
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	AY.22	0.01046
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	AY.38	0.002496
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	AY.5.4	0.001384
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	AY.54	0.000477
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	AY.70	0.001043
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	AY.75	0.00028
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	AY.77	0.005637
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	AY.84	0.002187
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	AY.91	0.003652
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	5	5	B.1.1.25	0.002843
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	A.1	0.001127
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	AY.107	0.001864
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	AY.109	0.002959
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	AY.30	0.001583
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	AY.32	0.00213
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	AY.34.1	0.00204
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	AY.39.2	0.006163
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	AY.9.1	0.000335
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	B.1.1.1	0.001307
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	B.1.1.306	0.001754
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	B.1.1.317	0.001647
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	B.1.160	0.000125
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	B.1.36.18	0.001681
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	4	B.1.427	0.000101
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAG	aGA	2	4	B.1.427	0.000101
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	C.37.1	0.010471
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	D.2	0.0003
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	P.1.1	0.001271
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	4	4	P.1.17	0.000647
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	A.2.5	0.001497
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	AY.106	0.001005
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	AY.108	0.003308
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	AY.113	0.000427
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	AY.36	0.000445
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	AY.46.2	0.001906
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	AY.60	0.002814
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	AY.7.1	0.000338
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	B.1.1.28	0.000934
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	B.1.1.464	0.004418
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	B.1.1.70	0.001023
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	B.1.177.19	0.004292
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	B.1.177.40	0.015464
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	B.1.456	0.009804
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	B.1.621	0.000266
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	B.1.627	0.006061
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	P.1.14	0.000143
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	P.1.15	0.000697
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	P.1.7	0.000958
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	3	3	Q.3	0.000435
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.105	0.001286
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.110	0.000225
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.116.1	0.000623
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.14	0.000176
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.16.1	0.00094
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.19	0.002281
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.4.4	0.000818
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.4.5	0.000215
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.48	0.00093
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.5.1	0.007519
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.53	0.000575
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.58	0.001815
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.68	0.000547
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.71	0.00095
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.74	0.000231
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.92	0.000575
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AY.94	0.000885
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	AZ.2	0.001642
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B	0.000256
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.1.134	0.022727
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.1.180	0.021505
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.1.216	0.001781
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.1.284	0.000215
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.1.333	0.002153
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.1.348	0.001592
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.1.526	0.007092
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.13	0.004751
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.139	0.001466
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.177.43	0.002954
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.177.77	0.001452
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.221	0.000142
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.258.24	0.021505
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.36.24	0.012346
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.408	0.00738
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.426	0.002018
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.433	0.00639
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.561	0.000794
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.562	0.037037
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	B.1.634	0.006849
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	C.1.2	0.008511
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	P.1.12	0.000968
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	P.1.13	0.001797
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	P.2	0.000373
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	2	2	Q.8	0.00033
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	A.2	0.000662
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	A.2.5.1	0.004808
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.10	0.00053
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.115	0.005208
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.24	0.000431
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.28	0.00189
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.34	0.000097
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.35	0.000233
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.5.2	0.002463
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.50	0.000799
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.52	0.000814
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.55	0.000917
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.59	0.00053
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.62	0.000436
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.69	0.000187
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.7	0.000196
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.75.1	0.00018
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.76	0.004831
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.8	0.000606
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.82	0.001357
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.85	0.000427
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.87	0.000833
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.88	0.000884
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.9.2.1	0.001976
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.93	0.000273
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.95	0.000761
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.96	0.002075
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.97	0.001701
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	AY.99	0.001049
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.101	0.01
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.153	0.001095
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.176	0.000439
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.192	0.002309
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.204	0.00304
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.220	0.001859
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.241	0.00207
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.290	0.018182
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.303	0.002762
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.312	0.001912
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.318	0.000302
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.326	0.001761
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.336	0.016667
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.37	0.000193
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.372	0.000689
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.409	0.002833
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.507	0.008696
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.523	0.001563
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.1.528	0.004808
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.166	0.008475
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.177.17	0.000821
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.177.20	0.001517
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.177.24	0.001295
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.177.44	0.000519
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.177.57	0.000281
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.177.6	0.000977
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.177.86	0.000183
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.189	0.004292
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.210	0.002132
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.214.2	0.0006
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.223	0.002778
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.234	0.000132
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.258.10	0.011364
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.324	0.001605
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.36.21	0.00216
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.36.29	0.000517
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.36.33	0.007576
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.36.35	0.002604
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.36.37	0.002778
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.36.7	0.004
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.36.8	0.001
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.396	0.000706
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.400	0.000429
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.402	0.009804
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.409	0.000781
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.415	0.014286
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.459	0.004082
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.468	0.005714
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.499	0.00105
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.505	0.004386
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.509	0.000866
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.517	0.000427
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.560	0.00463
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.565	0.00081
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.576	0.000907
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.580	0.004065
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.588	0.00091
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.595	0.000261
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.1.91	0.002075
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.3	0.000831
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.40	0.000364
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	B.6.6	0.000889
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	C.36	0.000911
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	C.36.1	0.004149
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	P.1.16	0.000374
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	P.1.2	0.001156
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	P.1.4	0.000977
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	P.6	0.003145
ORF1ab/nsp12	91	K91R	aAg	aGg	1	1	R.1	0.00009

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.