CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp12 : Mut = G228C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp12228G228CG4620CnonsynGgtTgt574574114122-14124

Details of the mutation G228C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt574574All0.00011
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt135135AY.1030.000838
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt7777AY.40.00012
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt6161B.1.36.231
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt3232AY.430.000142
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt3131B.1.1.70.000028
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt2929AY.260.000821
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt2424B.1.1.1440.685714
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt2424B.1.617.20.00009
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt1818B.10.000165
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt1515B.1.5260.000353
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt1212B.1.214.20.007194
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt88A0.003096
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt77AY.1070.003262
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt77P.1.70.002235
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt66P.10.000095
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt55AY.250.00003
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt55AY.4.30.004209
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt44AY.30.00004
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt44AY.440.000024
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt44AY.750.000224
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt44B0.000511
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt33AY.390.000074
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt33AY.420.000121
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt33AY.470.000093
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt22AY.140.000176
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt22AY.360.000296
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.280.00189
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.290.000016
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.380.000499
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11AY.940.000443
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.3190.003049
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11B.4.60.016667
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11D.20.000075
ORF1ab/nsp12228G228CGgtTgt11P.1.100.000269