CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp12 : Mut = G179C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp12179G179CG4571CnonsynGgtTgt34463446113975-13977

Details of the mutation G179C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt34463446All0.000659
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt20422042AE.80.998533
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt843843B.1.1.70.000755
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt9696AY.40.000149
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt7070B.1.617.20.000264
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt3131AY.1030.000192
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt3030AY.250.00018
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1919B.10.000174
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1818P.1.170.002912
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1616AY.1200.000595
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1515AY.1020.000398
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1515B.1.10.000272
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1515B.1.1.3060.006576
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1414B.1.1770.000184
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1414B.1.5380.112903
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1414P.10.000221
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1313AY.30.000129
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt1111AY.390.000272
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt99AY.260.000255
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt88B.1.1.3110.002865
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt88B.1.20.00007
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt88B.1.3510.000238
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt66AY.290.000095
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt55AY.430.000022
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt55AY.920.001436
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt55B.1.617.10.000645
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt44A.2.40.013468
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt44B.1.1.890.024242
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt44B.1.2650.005083
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt44B.1.4290.000094
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt33A.2.50.001497
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt33AY.4.50.000322
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt33AY.440.000018
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt33B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22AY.120.000632
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22AY.200.000078
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22AY.460.000208
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22AY.50.000041
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22AY.60.000082
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22AY.840.000875
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22B.1.1.1590.009346
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22B.1.1.1740.006757
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22B.1.350.016949
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22B.1.3690.00057
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22C.180.005181
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22C.370.000232
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt22D.20.00015
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11A.190.009434
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.100.00053
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.160.00038
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.720.001361
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.91.10.004065
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.960.002075
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.1.1130.006993
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.1.2320.001815
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.1.3540.004386
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.1.4130.006897
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.1690.014925
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.177.450.000381
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.177.460.000918
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.351.50.0006
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.4530.003236
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11C.360.000911
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp12179G179CGgtTgt11C.37.10.002618