CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp12 : CodonNum = 91 & Codon = Gag

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1291K91EK4483EnonsynAagGag189418850.99524813711-13713

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag18851894All0.000361
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag768768AY.4.2.10.114422
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag223223B.1.1.70.0002
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag113113AY.4.20.002451
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag8484AY.40.000131
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag6969AY.39.10.002733
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag5858B.1.617.20.000218
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag4040AY.440.000243
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag3838AY.1030.000236
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag3030AY.430.000133
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag2828P.10.000441
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag2525AY.250.00015
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag2525B.1.6370.001827
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1919B.1.1.4860.029968
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1818B.10.000165
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1818C.350.013932
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1616B.1.1770.000211
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1515B.1.3510.000446
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1414AY.470.000435
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1414B.1.177.600.003058
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1313B.1.6210.001151
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1212B.1.20.000106
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1212B.1.3960.008469
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag1010AY.1000.00046
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag99AY.290.000142
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag99AY.30.00009
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag88AY.200.000311
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag88AY.390.000198
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag88C.370.000929
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag66AY.260.00017
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag66P.20.00112
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag55B.1.2400.001078
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag55P.1.170.000809
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag44AY.300.001583
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag44B.1.1.2220.000816
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag44B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33AY.230.000209
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33AY.270.000194
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33AY.980.000237
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.1.10.00098
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.1.2660.036585
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.177.210.000229
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.258.170.000312
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.3560.005181
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33D.20.000225
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag33P.1.140.000143
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22AY.340.000194
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22AY.460.000208
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22AY.50.000041
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22AY.750.000112
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22AY.850.000854
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22AY.860.00166
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22B.1.177.870.001456
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11A.70.055556
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.1150.005208
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.130.000161
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.330.000067
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.420.00004
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.640.000595
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.730.000665
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.770.001127
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.830.001724
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.910.00073
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11AY.950.000761
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.1.3360.016667
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.1.830.00271
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.177.200.001517
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.177.330.001645
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.2770.02381
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.3190.003049
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.3200.001245
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11C.260.007353
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11P.1.10.10.00813
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp1291K91EAagGag11Q.30.000145