CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp12 : CodonNum = 879 & Codon = gGt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp12879D879GD5271GnonsyngAtgGt909909116075-16077

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt909909All0.000174
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt185185AY.40.000288
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt183183B.1.1.2220.037332
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt165165B.1.1.70.000148
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt6060AY.430.000266
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt4747B.1.177.40.00992
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt2828B.1.617.20.000105
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt2424AY.1190.000847
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt2323B.1.1.5190.000913
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt2020B.1.1.2140.001109
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt1717B.1.1770.000224
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt1515B.10.000137
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt1111P.10.000173
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt1010AT.10.051282
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt77B.1.10.000127
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt77B.1.20.000062
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt66AY.440.000037
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt55AY.250.00003
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt55AY.290.000079
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt55C.370.00058
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt44AY.200.000155
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt44AY.330.000267
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt44AY.420.000161
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt44B.1.1.3050.015444
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt44B.1.1.3170.001647
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt44B.1.6090.001918
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt33AY.260.000085
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt33AY.30.00003
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt33B.1.177.330.004934
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt22AY.450.000243
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt22B.1.6380.105263
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.610.000105
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.80.000606
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11AZ.30.00152
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.1.2630.001558
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.1460.004237
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.160.140.002119
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11B.60.00091
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11Q.20.000613
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11Q.80.000165
ORF1ab/nsp12879D879GgAtgGt11R.10.00009