CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp12 : CodonNum = 491 & Codon = aaT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp12491N491NN4883NsynaaCaaT26982698114911-14913

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT26982698All0.000516
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT868868AY.430.003846
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT552552B.1.1.70.000494
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT390390AY.16.10.183271
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT9696AY.140.008449
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT8787AY.40.000135
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT8585AY.290.001341
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT5757B.1.177.350.039392
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT3939AY.160.014806
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT3939B.1.617.20.000147
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT3636B.1.20.000317
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT2828AY.250.000168
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1919AY.30.000189
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1919P.10.000299
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1818B.10.000165
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1717AY.440.000103
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1717P.1.140.000813
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1414B.1.438.10.001502
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1313B.1.1.5190.000516
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1313B.1.177.420.011628
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1212AY.4.20.00026
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1212B.1.10.000218
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT1212B.1.1.1590.056075
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT88AY.1200.000297
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT88B.1.1.260.041885
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT88P.20.001493
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT77AY.1030.000043
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT77AY.1180.000439
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT77AY.1190.000247
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT77AY.60.000288
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT77Q.30.001015
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT66B.1.1.2220.001224
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT66Q.80.000989
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT55AY.390.000124
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT55AY.570.003281
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT55AY.90.000338
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT55B.1.3510.000149
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT55B.1.4270.000252
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT44AY.200.000155
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT44AY.260.000113
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT44AY.340.000388
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT44AY.50.000083
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT44AY.98.10.000194
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT44B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33AY.370.000948
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33AY.920.000862
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33AY.980.000237
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33B.1.1.3180.000905
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33B.1.220.003953
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33B.1.351.30.002629
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33B.1.3980.008929
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33B.1.4700.004213
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33B.1.5090.002597
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33D.20.000225
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT33P.1.70.000958
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22AY.330.000134
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22AY.470.000062
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22AY.990.002099
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22B.1.177.120.000303
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22B.1.177.580.002663
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22B.1.5820.000981
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22B.550.0059
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT22P.1.60.003891
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11A.50.001923
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AT.10.005128
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.110.001339
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.130.000161
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.20.000356
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.230.00007
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.610.000105
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.650.000533
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.750.000056
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11AY.930.000273
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.1540.04
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.2090.008929
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.2410.00207
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.3970.002252
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.130.002375
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.2230.002778
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.258.90.005
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.36.270.000763
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.4410.009615
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.5870.001898
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.6120.002653
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11C.360.000911
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11C.370.000116
ORF1ab/nsp12491N491NaaCaaT11P.1.160.000374