CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp10 : Mut = T102I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp10102T102IT4355InonsynaCtaTt1155211552113328-13330

Details of the mutation T102I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1155211552All0.002209
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt35623562B.1.1.70.003189
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt32413241P.1.100.87335
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt13641364AY.40.002123
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt321321B.1.617.20.001209
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt256256B.1.5260.006017
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt192192AY.430.000851
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt192192B.1.177.560.128171
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt178178AY.1030.001105
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt173173P.10.002725
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt121121P.1.160.045267
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt101101AY.30.001005
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt9494AY.440.000572
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt8686P.1.10.10.699187
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt7979B.1.3510.002348
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt5353AY.50.001094
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt5353B.10.000485
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt4646AY.250.000277
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt4545AY.290.00071
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt4444B.1.20.000387
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt4242B.1.5610.016673
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt4141B.1.1770.00054
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt4040AY.9.10.003349
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt3838B.1.4290.000894
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt3737AY.1020.000981
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt3737B.1.10.000671
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt3434AY.1190.0012
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt3333B.1.1600.001029
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt3232AY.1000.001472
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2929B.1.6370.002119
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2525AY.390.000618
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2323AY.340.00223
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2323AY.4.50.002472
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2323P.1.10.20.958333
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2121B.1.2580.001397
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2121P.1.140.001004
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2020AD.20.004379
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2020AY.4.20.000434
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2020B.1.177.550.04662
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt2020C.370.002321
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1818AY.240.007759
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1818R.10.00162
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1616AY.1200.000595
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1616B.6.21
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1515AY.1170.001268
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1515AY.200.000583
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1515AY.470.000467
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1515B.1.1.5190.000596
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1515Q.80.002474
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1414AY.34.10.007139
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1414AY.610.001467
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1414AY.980.001106
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1414B.1.4270.000707
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1414Q.10.001769
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1313AY.99.20.001198
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1313W.40.017568
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1212B.1.6210.001062
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1111AY.590.005826
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1010AT.10.051282
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1010AY.260.000283
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1010AY.750.00056
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1010B.1.2340.001319
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt1010B.1.6090.004794
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt99AY.4.2.10.001341
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt99AY.5.30.003036
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt99AY.620.003922
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt88AY.1180.000501
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt88AY.120.10.002568
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt88AY.420.000322
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt88AY.60.000329
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt88B.1.1.1590.037383
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt88B.1.1.3040.022472
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt88B.1.4230.081633
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt88B.1.5250.000905
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt88Q.70.008889
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt77AY.710.003325
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt77P.1.70.002235
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt66AY.16.10.00282
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt66AY.450.00073
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt66AY.98.10.000291
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt66B.1.1.2140.000333
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt66B.1.1310.052632
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt66B.1.5960.000523
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt55AY.1140.001156
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt55AY.790.006053
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt55AY.90.000338
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt55B.1.1.3110.001791
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt55P.1.150.001162
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44AY.300.001583
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44AY.460.000416
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44AY.660.004278
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44AY.690.000747
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44AY.840.00175
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44B.1.1.700.001364
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44B.1.177.770.002905
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44B.1.2400.000862
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44B.1.466.10.028777
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44P.1.120.001936
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt44Q.20.002454
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33AE.80.001467
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33AY.130.000483
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33AY.160.001139
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33AY.230.000209
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33AY.330.0002
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33AY.46.60.000217
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33AY.780.004622
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33AY.850.001282
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33B0.000383
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33B.1.177.570.000843
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33B.1.258.30.005025
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33B.1.595.10.017544
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33B.1.617.10.000387
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33P.1.10.000953
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt33P.20.00056
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.1050.001286
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.120.2.10.000997
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.29.10.000441
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.350.000466
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.4.30.001684
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.480.00093
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.5.10.007519
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.570.001312
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.740.000231
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.920.000575
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22AY.950.001522
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.1.2410.004141
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.1.2840.000215
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.1.3290.007692
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.1390.001466
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.160.120.012821
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.177.810.000379
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.2320.001075
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.3240.00321
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.351.20.000605
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.36.220.002415
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.3690.00057
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.3750.001639
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.3960.001411
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.4700.002809
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.4920.014085
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.619.10.001283
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22C.36.30.001134
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22P.1.130.001797
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt22Q.40.00091
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11A0.000387
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11A.2.30.004739
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11A.60.005128
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.170.008197
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.20.000356
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.39.20.001541
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.400.000964
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.5.20.002463
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.70.000196
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.700.000209
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.900.000684
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AY.960.002075
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11AZ.10.000867
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.1230.017857
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.1270.0625
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.2190.005
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.270.00565
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.3070.002532
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.3220.008772
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.5230.001563
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.5280.004808
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1190.010526
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1490.003425
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1510.011111
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.160.140.002119
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp10102T102IaCtaTt11B.1.177.210.000076
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