CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp10 : Mut = P84L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1084P84LP4337LnonsyncCacTa142014180.99859213274-13276
ORF1ab/nsp1084P84LP4337LnonsynCCaTTa142020.0014084513274-13276

Details of the mutation P84L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa14181420All0.000271
ORF1ab/nsp1084P84LCCaTTa21420All0
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa470470AY.40.000732
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa179179AY.1140.041368
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa158158B.1.20.001391
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa122122B.1.1.70.000109
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa5657B.1.617.20.000211
ORF1ab/nsp1084P84LCCaTTa157B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa5656P.50.767123
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa3939B.10.000357
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa2525B.1.1770.000329
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa2121AY.250.000126
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa1919B.1.4290.000447
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa1818AY.290.000284
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa1818AY.430.00008
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa1818B.1.5610.007146
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa1717AY.350.003962
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa1212AY.440.000073
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa1212B.1.2430.000835
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa1111AY.1030.000068
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa1010AY.1020.000265
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa99B.1.10.000163
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa77AY.30.00007
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa66AY.1180.000376
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa55AY.300.001979
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa55AY.390.000124
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa55B.1.5260.000118
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa55B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa44AY.16.10.00188
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa44B.1.5820.001963
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa44D.20.0003
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa33AY.980.000237
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa33B.1.1.4330.004274
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22AT.10.010256
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22AY.200.000078
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22AY.230.000139
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22AY.260.000057
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22AY.340.000194
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22AY.540.000191
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22B.1.1.5210.010695
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22B.1.177.330.003289
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa12B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp1084P84LCCaTTa12B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa22P.10.000032
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.270.000065
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.330.000067
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.450.000122
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.460.000104
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.470.000031
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.480.000465
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.50.000021
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.510.000909
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.60.000041
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.610.000105
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.710.000475
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11AY.740.000116
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.1330.008475
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.2730.006757
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.400.034483
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1490.003425
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.160.210.020408
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.3360.002439
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.36.330.007576
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.4410.009615
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.4910.052632
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11C.370.000116
ORF1ab/nsp1084P84LcCacTa11Q.10.000126