CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp10 : Mut = C79C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp1079C79CC4332CsyntgCtgT16561656113259-13261

Details of the mutation C79C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT16561656All0.000317
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT322322B.1.1.70.000288
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT141141B.1.617.20.000531
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT119119B.1.20.001048
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT100100AY.40.000156
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT9797B.1.1.2320.176044
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT9090AY.50.001858
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT4848B.1.4290.001129
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT3737AY.1030.00023
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT3333P.10.00052
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT3232AY.430.000142
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT2727AY.610.002829
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT2525B.10.000229
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT2424B.1.3510.000713
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT2323B.1.4050.283951
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT2222AK.21
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT2121AY.440.000128
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT2121B.1.1770.000277
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT2020AY.30.000199
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1616B.1.4330.051118
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1515AY.250.00009
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1414C.370.001625
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1313B.1.1.4130.089655
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1212B.1.2430.000835
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1212B.1.438.10.001287
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1111AY.140.000968
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1111Q.10.00139
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1010AY.260.000283
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1010B.1.10.000181
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT1010B.1.2580.000665
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT99AY.1020.000239
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT99AY.1130.001282
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT99AY.330.000601
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT99AY.360.001334
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT99B.1.1.4160.008145
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT99B.1.5770.006186
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT88AY.690.001493
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT77AY.290.00011
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT77B.1.36.190.064815
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT66AY.750.000336
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT66AY.98.10.000291
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT55AY.270.000324
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT55AY.740.000578
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT55AY.9.20.000184
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT55AY.99.20.000461
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT55B.1.1.630.001929
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT55P.1.130.004492
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT44AY.1190.000141
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT44AY.420.000161
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT44AY.470.000124
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT44AY.5.40.001107
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT44B.1.1.260.020942
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT44C.36.30.002269
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33A.2.50.001497
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33AY.200.000117
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33AY.230.000209
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33AY.46.40.000494
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33AY.490.009585
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33AY.7.10.000338
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33AY.980.000237
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33B.1.1.1700.003741
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33B.1.5170.001281
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33B.1.621.10.001517
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33C.360.002732
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT33L.30.010638
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.130.000322
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.16.10.00094
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.450.000243
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.500.001599
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.540.000191
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.620.000871
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.650.001066
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22AY.670.000929
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.1.3360.033333
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.110.30.001437
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.177.720.00678
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.2470.029851
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.4260.002018
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.4320.022472
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.5680.002222
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.6310.006734
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22C.140.008658
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22C.160.002121
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22D.20.00015
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT22P.1.70.000639
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11A0.000387
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11A.10.000282
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.390.000025
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B0.000128
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.1.3760.005952
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.6020.006536
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.80.001972
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.940.027027
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.1.960.018868
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.30.000831
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.40.002208
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11B.400.000364
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11C.1.20.004255
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11P.1.80.004785
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11P.20.000187
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11Q.80.000165
ORF1ab/nsp1079C79CtgCtgT11R.10.00009