CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp10 : CodonNum = 108 & Codon = gtT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp10108V108VV4361VsyngtGgtT317330200.95178113346-13348

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT30203173All0.000578
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT459470AY.40.000714
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT363376B.1.1.70.000325
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT304315B.1.617.20.001145
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT263276AY.1030.001633
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT181182AY.470.00563
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT148148B.1.5440.891566
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT125128AY.250.000752
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT103103AY.60.004236
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT7682B.10.000696
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT6472AY.430.000284
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT5972AY.440.000359
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT4449AY.30.000438
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT4647P.10.000725
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT3238AY.1020.000848
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT3838B.1.1.370.007329
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT3133B.1.10.000562
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT3233B.1.20.000282
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT3032B.1.5260.000705
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT2528B.1.1770.000329
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT2727B.1.3510.000803
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT2626AY.1170.002197
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT2626AY.1200.000967
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT2222A.2.5.20.034591
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1920AY.260.000538
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1418AY.390.000346
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1616AY.200.000622
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1515AY.980.001185
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1515B.1.1.1960.085714
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1313AY.910.009496
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1112C.370.001277
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT711AY.50.000145
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1111B.1.1.510.0189
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT511B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1010B.1.2100.021322
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT1010B.1.3180.384615
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT89AY.1000.000368
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT99AY.270.000582
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT99B.1.2430.000626
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT89B.1.4290.000188
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT88AY.610.000838
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT88B.1.1.3170.003294
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT78P.20.001306
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT77AY.290.00011
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT57AY.420.000201
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT46B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT56B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT56B.1.360.00073
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT66B.1.5270.022222
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT66B.1.6210.000531
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT66B.400.002186
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT55AY.120.20.006427
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT55AY.230.000349
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT55AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT55B.1.1.5190.000199
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT55B.1.1.580.026882
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT34AY.330.0002
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT44AY.920.001149
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT14B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT44B.1.177.690.005935
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT44B.1.3110.001098
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT44B.1.5250.000453
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT44C.180.010363
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33A0.001161
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33AE.80.001467
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33AY.7.10.000338
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33AY.90.000203
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33AY.990.003148
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33B0.000383
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT13B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33B.1.4200.03125
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT13B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33P.1.120.001452
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT33Q.40.001364
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT220.111111
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT12AY.1110.000183
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.380.000999
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.400.001929
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.450.000243
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT12AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.5.10.007519
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.750.000112
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.870.001665
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.1.4860.003155
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.2390.002442
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.3490.00143
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.5680.002222
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.5820.000981
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.5870.003795
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22B.230.005848
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22L.30.007092
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22P.1.70.000639
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.140.000088
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.20.000356
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.480.000465
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.520.000814
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.560.001605
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.650.000533
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.810.001992
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.890.004902
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11AY.930.000273
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.1710.003676
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.1910.004762
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.2050.003717
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.2300.009174
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.50.008333
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.5210.005348
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1.80.003584
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1310.008772
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.1650.011905
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.177.460.000918
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.177.550.002331
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.2220.001692
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.5550.022222
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.5900.004545
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.1.6360.006711
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11C.10.002392
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11C.350.000774
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11N.50.001767
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11P.30.001595
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11Q.30.000145
ORF1ab/nsp10108V108VgtGgtT11Q.80.000165